Trendi, napovedi (arhiv september 2021)

Dobro skrit v tako gosti megli, da bi jo lahko rezali, leži mali ribnik.
Na prvi pogled je popolnoma vsakdanji. Če pa bi ga pogledali še enkrat, bi videli, da je pravljični …

Podatke pridobivam od vlade RS, MZ, NIJZ, NIB in @sledilnik.
Najlepša hvala!

arhiv analiz: avgust 2021julij 2021junij 2021maj 2021april 2021marec 2021februar 2021januar 2021december 2020pred decembrom 2020

VROČE: Naloži si Windows aplikacijo covidSLO (COVID-SLOVENIJA), ki ti omogoča dinamičen pogled na epidemijo z animacijami, statistikami, HAGT kalkulatorjem, …

Časovne animacije širjenja SARS-CoV-2

Ljudje mi znajo dati dodatno energijo:)

Moram te pohvalit, da glede na par modelov najbolj realno napoveduješ, ker zadevo gledaš najbolj celostno, z zdravo kmečko pametjo.

Hvala za pozitivno naravnane in natančne napovedi.

Pravzaprav se, gledano po posameznih dnevih, tvoja napoved za zdaj uresničuje tako dobro, da je že kičasto.

Super za trud in napovedi. Pa da vidimo kako in kaj bo.

Tako, da malo več skromnosti, več resnega dela, študiranja, analitike in manj sončenja v medijih. Tako kot dela softmarex.wordpress.com.

Noro, kako dobre napovedi. Ne morem verjeti da je bil res že 13.5. napisan točen datum! Bravo!!Ne vem kako nisem prej vedel za to.

Sem čakal vaše objave. Realno razmišljanje je potrebno. Ne pa pretiravanje v ekstreme kot počnejo nakateri tu gor.

novo 29.7.2021: Določanje skupne imunosti na osnovi števila cepljenih in ocene števila prebolelih …
novo 3.8.2021: Določanje števila neimunih po rizičnih starostnih skupinah na osnovi števila cepljenih in ocene števila prebolelih …
novo 7.8.2021: Določanje prekuženosti v aplikaciji covidSLO …

Cepivo deluje
V VB in Izraelu imajo v bolnišnicah precejšen procent oseb, ki so cepljene. A hkrati je v rizični populaciji za hospitalizacijo v teh državah velika večina ljudi cepljenih. Lepo se vidi, da je bolj varno biti med cepljenimi kot med necepljenimi – CEPIVO DELUJE.

ponedeljek 11.10.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija že z zadnjim tednom septembra pada v skladu s projekcijo
R=0.93, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 793 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 788
SLO-zelenih je 27 občin, EU-zelenih 8 občin, ostali so še bolj kot ne rdeči ali črni
10/7/4 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 124 dni brez primera!
dosežena splošna skupna imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 75.9%
dosežena imunost starostnih skupin: 60-64: 92%, 65-69: 95%, 70-74: 99%, 75-79: 97%, 80-84: 96%, 85-89: 94%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 38/dan, smrti imajo zdaj vrh pri okoli 6/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje, v primeru izrazito slabega razvoja (plato) pač še toliko počasneje
napoved umrlih: 550-650 (192 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5000
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: Z. in V. Slovenija 19.10. (na ECDC karti tako obarvano v četrtek 28.10.)
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15-20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Spodaj je najprej prikazana standardna projekcija, ki se mi zdi nekako najbolj verjetna, potem pa še optimistična in pesimistična projekcija, ki predpostavljata nekaj manj/več “sile” (beri šole, službe, vreme, ukrepi) po spreminjanju R do 5.11.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Pesimistični scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Pesimistični scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Prebolelost (P), precepljenost (C) in skupna imunost (I) po starostnih skupinah in regijah.
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.05, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.00.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R.

Sprejemi so sedaj nekako na platoju. Koliko se bo to vleklo, je odvisno od priliva novih primerov in seveda tempa imunizacije (glej projekcije).

Hospitalizacije so sedaj očitno nekako na platoju. Koliko se bo ta vlekel, je odvisno od priliva novih primerov in sprejemov v bolnišnice (glej projekcije).
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 6-7/dan ….

nedelja 10.10.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija že z zadnjim tednom septembra pada v skladu s projekcijo
R=0.93, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 799 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 794
SLO-zelenih je 25 občin, EU-zelenih 8 občin, ostali so še bolj kot ne rdeči ali črni
9/6/4 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 123 dni brez primera!
dosežena splošna skupna imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 75.9%
dosežena imunost starostnih skupin: 60-64: 92%, 65-69: 95%, 70-74: 99%, 75-79: 97%, 80-84: 96%, 85-89: 94%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 38/dan, smrti imajo zdaj vrh pri okoli 6/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje, v primeru izrazito slabega razvoja (plato) pač še toliko počasneje
napoved umrlih: 600-700 (188 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: Z. in V. Slovenija 21.10. (na ECDC karti tako obarvano v četrtek 28.10.)
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15-20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Spodaj je najprej prikazana standardna projekcija, ki se mi zdi nekako najbolj verjetna, potem pa še optimistična in pesimistična projekcija, ki predpostavljata nekaj manj/več “sile” (beri šole, službe, vreme, ukrepi) po spreminjanju R do 5.11.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 51.8%
Prebolelost (P), precepljenost (C) in skupna imunost (I) po starostnih skupinah in regijah.
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.05, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.00.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R.

Sprejemi so sedaj nekako na platoju. Koliko se bo to vleklo, je odvisno od priliva novih primerov in seveda tempa imunizacije (glej projekcije).

Hospitalizacije so sedaj očitno nekako na platoju. Koliko se bo ta vlekel, je odvisno od priliva novih primerov in sprejemov v bolnišnice (glej projekcije).
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 6-7/dan ….

sobota 9.10.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija že od zadnjega tedna septembra pada v skladu s projekcijo
R=0.94, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 805 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 800
SLO-zelenih je 29 občin, EU-zelenih 8 občin, ostali so še bolj kot ne rdeči ali črni
9/6/3 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 122 dni brez primera!
dosežena splošna skupna imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 75.9%
dosežena imunost starostnih skupin: 60-64: 92%, 65-69: 95%, 70-74: 99%, 75-79: 97%, 80-84: 96%, 85-89: 94%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 38/dan, smrti imajo zdaj vrh pri dobrih 6/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje, v primeru izrazito slabega razvoja (plato) pač še toliko počasneje
napoved umrlih: 600-700 (182 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 29.10.
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15-20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Spodaj je najprej prikazana standardna projekcija, ki se mi zdi nekako najbolj verjetna, potem pa še optimistična in pesimistična projekcija, ki predpostavljata nekaj manj/več “sile” (beri šole, službe, vreme, ukrepi) po spreminjanju R do 5.11.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Prebolelost (P), precepljenost (C) in skupna imunost (I) po starostnih skupinah in regijah.
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so sedaj nekako na platoju. Koliko se bo to vleklo, je odvisno od priliva novih primerov in seveda tempa imunizacije (glej projekcije).

Hospitalizacije so sedaj očitno nekako na platoju. Koliko se bo ta vlekel, je odvisno od priliva novih primerov in sprejemov v bolnišnice (glej projekcije).
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 6-7/dan ….

petek 8.10.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija že od zadnjega tedna septembra pada v skladu s projekcijo
R=0.96, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 820 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 816
SLO-zelenih je 27 občin, EU-zelenih 7 občin, ostali so še bolj kot ne rdeči ali črni
9/6/2 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 121 dni brez primera!
dosežena splošna skupna imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 75.6%
dosežena imunost starostnih skupin: 60-64: 91%, 65-69: 95%, 70-74: 99%, 75-79: 97%, 80-84: 96%, 85-89: 93%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 38/dan, smrti imajo zdaj vrh pri dobrih 6/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje, v primeru izrazito slabega razvoja (plato) pač še toliko počasneje
napoved umrlih: 600-750 (177 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5150
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 10.11.
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15-20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Spodaj je najprej prikazana standardna projekcija, ki se mi zdi nekako najbolj verjetna, potem pa še optimistična in pesimistična projekcija, ki predpostavljata nekaj manj/več “sile” (beri šole, službe, vreme, ukrepi) po spreminjanju R do 5.11.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 51.6%
Prebolelost (P), precepljenost (C) in skupna imunost (I) po starostnih skupinah in regijah.
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.
V drugi polovici septembra se je pokazalo, da je bil kljub zavedanju, da medtedenske primerjave primerov nerealno visoko kažejo na R, R še vedno ocenjen previsoko in je bil dejansko v okolici 1 oziroma tik nad. Primeri so tako pričeli upadati. Projekcije so se zato bistveno izboljšale, dodatno pa jih je izboljšalo pospešeno cepljenje.
Konec septmbra je vreme nekoliko dvignilo R in imeli smo stagnacijo – primeri praktično niso padali več. Projekcije se s tem niso bistveno spremenile, ker je v njih itak privzeto, da se bo do konca oktobra zaradi šol, služb in vremena R poskušal dvigniti za določeno vrednost (ta predvideni prirastek pa sproti izničuje sprotna imunizacija).
Po prvem tednu oktobra imamo zopet izboljšanje in epidemija spet naprej počasi pada. Odprtje univerz (še) ne kaže efekta v skupini 15-24 let, kar je precejšnja razlika glede na odprtje šol s 1. septembrom in takratno dogajanje v skupini 5-14 let.

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 838 novih primerov pri 4709 testih, 17.80% (avg7d 19.37%, počasno padanje)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 0.85, delež 0.98
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 0.89, delež 0.97 (včeraj 0.91 in 0.96)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 0.93, delež 0.99 (včeraj 0.95 in 1.009)
R (izračunan za en teden nazaj) je 0.96 (65% teže na R iz števila primerov, 35% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V septembru je veliko boljši pokazatelj bil delež, zdaj ne več toliko.
Obseg PCR: 29.6k/teden, rahlo pada, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 155k/teden oz. 22.2k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.96 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Odprli smo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže nekje na vrhu in bomo tu nekje na dobrih 400 do sredine oktobra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem (bolj verjetno ga ne bo), bo plato tudi pri njih. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta konec novembra ali v začetku decembra, na 200 pa konec decembra ali v januarju.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanjem vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-750 smrti v 4. valu.

Podpiral sem obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so sedaj nekako na platoju. Koliko se bo to vleklo, je odvisno od priliva novih primerov in seveda tempa imunizacije (glej projekcije).

Hospitalizacije so sedaj očitno nekako na platoju. Koliko se bo ta vlekel, je odvisno od priliva novih primerov in sprejemov v bolnišnice (glej projekcije).
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 7/dan ….

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Slabše zaščitene regije (precepljenost, prekuženost, na grafu nižje) imajo več okužb (višje incidence, na grafu bolj desno), kot bolje zaščitene. Ta sklopljenost je jasno izražena že od resnega pričetka 4. vala v začetku avgusta 2021.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

V vseh starostnih skupinah se situacija umirja. Tudi po odprtju univez v oktobru ne pričakujem bistvene rasti. Število primerov v skupini 15-24 let se sicer bo povečalo, a to bo spet le statistični efekt, kot je bil tisti pri odprtju OŠ s septembrom. Pač v skupini 15-24 se bo testiralo več in primerov bo več, ker pa je incidenca ista, se bodo dvignile le medtednske primerjave primerov, delež pozitivnih pa ne. Pravi pokazatelj dogajanja bo tako spet kot septembra delež pozitivnih. Ta bi sicer lahko tudi malo upadel zaradi več respiratornih obolenj populacije, od katerih bi bilo potem več negativnih PCR testov, a bistvenega padca deleža na ta račun ne pričakujem. 7.10.2021 sicer kaže, da odprtje univerz še zdaleč ni imelo tolikšnega vpliva na incidence, kot ga je imelo odprtje šol s 1.9.2021.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

četrtek 7.10.2021

Povzetek dnevne analize:
R=0.97, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 839 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 836
SLO-zelenih je 26 občin, EU-zelenih 7 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
8/6/2 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 120 dni brez primera!
dosežena splošna skupna imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 75.3%
dosežena imunost starostnih skupin: 60-64: 91%, 65-69: 95%, 70-74: 98%, 75-79: 97%, 80-84: 96%, 85-89: 93%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 38/dan, smrti je dobrih 6/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje, v primeru platoja pač še toliko počasneje
napoved umrlih: 600-750 (175 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5150
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 17.11.
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Spodaj je najprej prikazana standardna projekcija, ki se mi zdi nekako najbolj verjetna, potem pa še optimistična in pesimistična projekcija, ki predpostavljata nekaj manj/več “sile” (beri šole, službe, vreme, ukrepi) po spreminjanju R do 5.11.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.39; c) dosedanja prekuženost 51.5%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.39; c) dosedanja prekuženost 51.5%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.29; c) dosedanja prekuženost 51.5%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.29; c) dosedanja prekuženost 51.5%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.49; c) dosedanja prekuženost 51.5%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.49; c) dosedanja prekuženost 51.5%
Prebolelost (P), precepljenost (C) in skupna imunost (I) po starostnih skupinah in regijah.
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.
V drugi polovici septembra se je pokazalo, da je bil kljub zavedanju, da medtedenske primerjave primerov nerealno visoko kažejo na R, R še vedno ocenjen previsoko in je bil dejansko v okolici 1 oziroma tik nad. Primeri so tako pričeli upadati. Projekcije so se zato bistveno izboljšale, dodatno pa jih je izboljšalo pospešeno cepljenje.
Konec septmbra je vreme nekoliko dvignilo R in imamo stagnacijo – primeri praktično ne padajo več. Projekcije se s tem niso bistveno spremenile, ker je v njih itak privzeto, da se bo do konca oktobra zaradi šol, služb in vremena R poskušal dvigniti za določeno vrednost (ta predvideni prirastek pa sproti izničuje sprotna imunizacija).

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 968 novih primerov pri 5336 testih, 18.14% (avg7d 19.41%, počasno padanje)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 0.93, delež 1.02
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 0.91, delež 0.96 (včeraj 0.89 in 0.94)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 0.95, delež 1.00 (včeraj 0.97 in 0.99)
R (izračunan za en teden nazaj) je 0.97 (50% teže na R iz števila primerov, 50% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V septembru je veliko boljši pokazatelj bil delež, zdaj ne več toliko.
Obseg PCR: 30.3k/teden,precej ustaljen, morda rahlo pada, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 160k/teden oz. 22.8k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.97 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Odprli smo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže nekje na vrhu in bomo tu nekje na dobrih 400 do sredine oktobra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem (bolj verjetno ga ne bo), bo plato tudi pri njih. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta konec novembra ali v začetku decembra, na 200 pa konec decembra ali v januarju.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanjem vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-750 smrti v 4. valu.

Podpiral sem obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so sedaj nekako na platoju. Koliko se bo to vleklo, je odvisno od priliva novih primerov in seveda tempa imunizacije (glej projekcije).

Hospitalizacije so sedaj očitno nekako na platoju. Koliko se bo ta vlekel, je odvisno od priliva novih primerov in sprejemov v bolnišnice (glej projekcije).
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 7/dan ….

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Slabše zaščitene regije (precepljenost, prekuženost, na grafu nižje) imajo več okužb (višje incidence, na grafu bolj desno), kot bolje zaščitene. Ta sklopljenost je jasno izražena že od resnega pričetka 4. vala v začetku avgusta 2021.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

V vseh starostnih skupinah se situacija umirja. Tudi po odprtju univez v oktobru ne pričakujem bistvene rasti. Število primerov v skupini 15-24 let se sicer bo povečalo, a to bo spet le statistični efekt, kot je bil tisti pri odprtju OŠ s septembrom. Pač v skupini 15-24 se bo testiralo več in primerov bo več, ker pa je incidenca ista, se bodo dvignile le medtednske primerjave primerov, delež pozitivnih pa ne. Pravi pokazatelj dogajanja bo tako spet kot septembra delež pozitivnih. Ta bi sicer lahko tudi malo upadel zaradi več respiratornih obolenj populacije, od katerih bi bilo potem več negativnih PCR testov, a bistvenega padca deleža na ta račun ne pričakujem. 7.10.2021 sicer kaže, da odprtje univerz še zdaleč ni imelo tolikšnega vpliva na incidence, kot ga je imelo odprtje šol s 1.9.2021.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

sreda 6.10.2021

Povzetek dnevne analize:
R=0.97, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 848 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 843
SLO-zelenih je 25 občin, EU-zelenih 10 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
10/6/2 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 119 dni brez primera!
dosežena splošna skupna imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 75.1%
dosežena imunost starostnih skupin: 60-64: 91%, 65-69: 94%, 70-74: 98%, 75-79: 96%, 80-84: 95%, 85-89: 93%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 37/dan, smrti je blizu 7/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje, v primeru platoja pač ne
napoved umrlih: 600-750 (172 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5150
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: sredina novembra
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:)

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.39; c) dosedanja prekuženost 51.4%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.39; c) dosedanja prekuženost 51.4%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.29; c) dosedanja prekuženost 51.4%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.29; c) dosedanja prekuženost 51.4%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.49; c) dosedanja prekuženost 51.4%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.49; c) dosedanja prekuženost 51.4%
Prebolelost (P), precepljenost (C) in skupna imunost (I) po starostnih skupinah in regijah.
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.
V drugi polovici septembra se je pokazalo, da je bil kljub zavedanju, da medtedenske primerjave primerov nerealno visoko kažejo na R, R še vedno ocenjen previsoko in je bil dejansko v okolici 1 oziroma tik nad. Primeri so tako pričeli upadati. Projekcije so se zato bistveno izboljšale, dodatno pa jih je izboljšalo pospešeno cepljenje.
Konec septmbra je vreme nekoliko dvignilo R in imamo stagnacijo – primeri praktično ne padajo več. Projekcije se s tem niso bistveno spremenile, ker je v njih itak privzeto, da se bo do konca oktobra zaradi šol, služb in vremena R poskušal dvigniti za določeno vrednost (ta predvideni prirastek pa sproti izničuje sprotna imunizacija).

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 1208 novih primerov pri 6174 testih, 19.57% (avg7d 19.34%, počasno padanje)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 0.89, delež 0.94
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 0.89, delež 0.94 (včeraj 0.97 in 1.00)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 0.97, delež 0.99 (včeraj 1.01 in 1.02)
R (izračunan za en teden nazaj) je 0.98 (50% teže na R iz števila primerov, 50% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V zadnjem mesecu je veliko boljši pokazatelj bil delež.
Obseg PCR: 30.7k/teden,precej ustaljen, morda rahlo pada, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 163k/teden oz. 23.3k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.97 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Odprli smo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže nekje na vrhu in bomo tu nekje na dobrih 400 do sredine oktobra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem, bo plato tudi pri njih. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta konec novembra ali v začetku decembra, na 200 pa konec decembra ali v januarju.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanjem vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-750 smrti v 4. valu.

Podpiral sem obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so sedaj nekako na platoju. Koliko se bo to vleklo, je odvisno od priliva novih primerov in seveda tempa imunizacije (glej projekcije).

Hospitalizacije so sedaj očitno nekako na platoju. Koliko se bo ta vlekel, je odvisno od priliva novih primerov in sprejemov v bolnišnice (glej projekcije).
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 7-8/dan ….

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Slabše zaščitene regije (precepljenost, prekuženost, na grafu nižje) imajo več okužb (višje incidence, na grafu bolj desno), kot bolje zaščitene. Ta sklopljenost je jasno izražena že od resnega pričetka 4. vala v začetku avgusta 2021.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

V vseh starostnih skupinah se situacija umirja. Tudi po odprtju univez v oktobru ne pričakujem bistvene rasti. Število primerov v skupini 15-24 let se sicer bo povečalo, a to bo spet le statistični efekt, kot je bil tisti pri odprtju OŠ s septembrom. Pač v skupini 15-24 se bo testiralo več in primerov bo več, ker pa je incidenca ista, se bodo dvignile le medtednske primerjave primerov, delež pozitivnih pa ne. Pravi pokazatelj dogajanja bo tako spet kot septembra delež pozitivnih. Ta bi sicer lahko tudi malo upadel zaradi več respiratornih obolenj populacije, od katerih bi bilo potem več negativnih PCR testov, a bistvenega padca deleža na ta račun ne pričakujem.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

torek 5.10.2021

Povzetek dnevne analize:
zadnje par dni vreme rahlo povečuje R, največ spremembe med starejšimi, po regijah pa GO, KO in SA
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšem primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.98, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 866 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 862
SLO-zelenih je 20 občin, EU-zelenih 8 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
10/6/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 118 dni brez primera!
dosežena splošna skupna imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 74.9%
dosežena imunost starostnih skupin: 60-64: 90%, 65-69: 94%, 70-74: 98%, 75-79: 96%, 80-84: 95%, 85-89: 93%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je blizu 7/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje, v primeru platoja pač ne
napoved umrlih: 600-750 (164 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5150
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: sredina novembra
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:)

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.37; c) dosedanja prekuženost 51.2%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.37; c) dosedanja prekuženost 51.2%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.27; c) dosedanja prekuženost 51.2%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.27; c) dosedanja prekuženost 51.2%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.47; c) dosedanja prekuženost 51.2%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.47; c) dosedanja prekuženost 51.2%
Prebolelost (P), precepljenost (C) in skupna imunost (I) po starostnih skupinah in regijah.
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.
V drugi polovici septembra se je pokazalo, da je bil kljub zavedanju, da medtedenske primerjave primerov nerealno visoko kažejo na R, R še vedno ocenjen previsoko in je bil dejansko v okolici 1 oziroma tik nad. Primeri so tako pričeli upadati. Projekcije so se zato bistveno izboljšale, dodatno pa jih je izboljšalo pospešeno cepljenje.
Konec septmbra je vreme nekoliko dvignilo R in imamo stagnacijo – primeri praktično ne padajo več. Projekcije se s tem niso bistveno spremenile, ker je v njih itak privzeto, da se bo do konca oktobra zaradi šol, služb in vremena R poskušal dvigniti za določeno vrednost (ta predvideni prirastek pa sproti izničuje sprotna imunizacija).

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 979 novih primerov pri 4783 testih, 20.47% (avg7d 19.62%, počasno padanje)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 0.93, delež 0.94
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 0.97, delež 1.00 (včeraj 0.99 in 1.06)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 1.01, delež 1.02 (včeraj 0.98 in 1.01)
R (izračunan za en teden nazaj) je 1.01 (10% teže na R iz števila primerov, 90% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V zadnjem mesecu je veliko boljši pokazatelj bil delež.
Obseg PCR: 30.9k/teden,precej ustaljen, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 165k/teden oz. 23.7k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.98 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Odprli smo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže nekje na vrhu in bomo tu nekje na dobrih 400 do sredine oktobra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem, bo plato tudi pri njih. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta konec novembra ali v začetku decembra, na 200 pa konec decembra ali v januarju.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanjem vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-750 smrti v 4. valu.

Podpiral sem obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so sedaj nekako na platoju. Koliko se bo to vleklo, je odvisno od priliva novih primerov in seveda tempa imunizacije (glej projekcije).

Hospitalizacije so sedaj očitno nekako na platoju. Koliko se bo ta vlekel, je odvisno od priliva novih primerov in sprejemov v bolnišnice (glej projekcije).
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 7-8/dan ….

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Slabše zaščitene regije (precepljenost, prekuženost, na grafu nižje) imajo več okužb (višje incidence, na grafu bolj desno), kot bolje zaščitene. Ta sklopljenost je jasno izražena že od resnega pričetka 4. vala v začetku avgusta 2021.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

V vseh starostnih skupinah se situacija umirja. Tudi po odprtju univez v oktobru ne pričakujem bistvene rasti. Število primerov v skupini 15-24 let se sicer bo povečalo, a to bo spet le statistični efekt, kot je bil tisti pri odprtju OŠ s septembrom. Pač v skupini 15-24 se bo testiralo več in primerov bo več, ker pa je incidenca ista, se bodo dvignile le medtednske primerjave primerov, delež pozitivnih pa ne. Pravi pokazatelj dogajanja bo tako spet kot septembra delež pozitivnih. Ta bi sicer lahko tudi malo upadel zaradi več respiratornih obolenj populacije, od katerih bi bilo potem več negativnih PCR testov, a bistvenega padca deleža na ta račun ne pričakujem.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

ponedeljek 4.10.2021

Povzetek dnevne analize:
zadnje par dni vreme rahlo povečuje R, največ spremembe med starejšimi, po regijah pa GO, KO in SA
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšem primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.98, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 875 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 870
SLO-zelenih je 25 občin, EU-zelenih 7 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
11/7/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 117 dni brez primera!
dosežena splošna skupna imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 74.8%
dosežena imunost starostnih skupin: 60-64: 90%, 65-69: 94%, 70-74: 98%, 75-79: 96%, 80-84: 95%, 85-89: 93%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je blizu 7/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje, v primeru platoja pač ne
napoved umrlih: 600-750 (156 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5150
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: sredina novembra
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:)

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.36; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.36; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.26; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.26; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.46; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.46; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

nedelja 3.10.2021

Povzetek dnevne analize:
zadnje par dni vreme rahlo povečuje R, največ spremembe med starejšimi, po regijah pa GO, KO in SA
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšem primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.98, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 883 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 879
SLO-zelenih je 27 občin, EU-zelenih 7 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
10/7/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 116 dni brez primera!
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je blizu 7/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje, v primeru platoja pač ne
napoved umrlih: 600-750 (149 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5150
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: sredina novembra
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:)

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.36; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.36; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.26; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.26; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.46; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.46; c) dosedanja prekuženost 51.0%
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.
V drugi polovici septembra se je pokazalo, da je bil kljub zavedanju, da medtedenske primerjave primerov nerealno visoko kažejo na R, R še vedno ocenjen previsoko in je bil dejansko v okolici 1 oziroma tik nad. Primeri so tako pričeli upadati. Projekcije so se zato bistveno izboljšale, dodatno pa jih je izboljšalo pospešeno cepljenje.
Konec septmbra je vreme nekoliko dvignilo R in imamo stagnacijo – primeri praktično ne padajo več. Projekcije se s tem niso bistveno spremenile, ker je v njih itak privzeto, da se bo do konca oktobra zaradi šol, služb in vremena R poskušal dvigniti za določeno vrednost (ta predvideni prirastek pa sproti izničuje sprotna imunizacija).

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 531 novih primerov pri 2438 testih, 21.78% (avg7d 19.85%, počasno padanje)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 1.16, delež 1.13
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 1.02, delež 1.10 (včeraj 1.00 in 1.05)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 0.98, delež 1.02 (včeraj 0.96 in 1.00)
R (izračunan za en teden nazaj) je 1.02 (10% teže na R iz števila primerov, 90% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V zadnjem mesecu je veliko boljši pokazatelj bil delež.
Obseg PCR: 31.2k/teden, rahlo raste, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 170k/teden oz. 24.2k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.98 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Odprli smo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže nekje na vrhu in bomo tu nekje na dobrih 400 do sredine oktobra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem, bo plato tudi pri njih. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta konec novembra, na 200 pa konec decembra ali v januarju.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanjem vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-750 smrti v 4. valu.

Podpiral sem obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so sedaj nekako na platoju. Koliko se bo to vleklo, je odvisno od priliva novih primerov in seveda tempa imunizacije (glej projekcije).

Hospitalizacije so sedaj očitno nekako na platoju. Koliko se bo ta vlekel, je odvisno od priliva novih primerov in sprejemov v bolnišnice (glej projekcije).
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 7-8/dan ….

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Slabše zaščitene regije (precepljenost, prekuženost, na grafu nižje) imajo več okužb (višje incidence, na grafu bolj desno), kot bolje zaščitene. Ta sklopljenost je jasno izražena že od resnega pričetka 4. vala v začetku avgusta 2021.

V vseh starostnih skupinah se situacija umirja. Tudi po odprtju univez v oktobru ne pričakujem bistvene rasti. Število primerov v skupini 15-24 let se sicer bo povečalo, a to bo spet le statistični efekt, kot je bil tisti pri odprtju OŠ s septembrom. Pač v skupini 15-24 se bo testiralo več in primerov bo več, ker pa je incidenca ista, se bodo dvignile le medtednske primerjave primerov, delež pozitivnih pa ne. Pravi pokazatelj dogajanja bo tako spet kot septembra delež pozitivnih. Ta bi sicer lahko tudi malo upadel zaradi več respiratornih obolenj populacije, od katerih bi bilo potem več negativnih PCR testov, a bistvenega padca deleža na ta račun ne pričakujem.

Situacija po starostnih skupinah:

sobota 2.10.2021

Povzetek dnevne analize:
zadnje par dni vreme rahlo povečuje R, največ spremembe med starejšimi, po regijah pa GO, KO in SA
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšem primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.97, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, še vedno pa seveda službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje višjo rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 871 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 867
SLO-zelenih je 25 občin, EU-zelenih 8 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
9/6/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 115 dni brez primera!
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je blizu 7/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje
napoved umrlih: 600-700 (140 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5150
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: sredina novembra
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (20% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Kakorkoli, najbolj realna trenutno izgleda varianta postopnega padanja epidemije brez dolgega platoja. V optimističnem scenariju je padanje lahko celo malce pospešeno.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.37; c) dosedanja prekuženost 50.9%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.37; c) dosedanja prekuženost 50.9%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.27; c) dosedanja prekuženost 50.9%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.27; c) dosedanja prekuženost 50.9%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.47; c) dosedanja prekuženost 50.9%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.47; c) dosedanja prekuženost 50.9%
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.
V drugi polovici septembra se je pokazalo, da je bil kljub zavedanju, da medtedenske primerjave primerov nerealno visoko kažejo na R, R še vedno ocenjen previsoko in je bil dejansko v okolici 1 oziroma tik nad. Primeri so tako pričeli upadati. Projekcije so se zato bistveno izboljšale, dodatno pa jih je izboljšalo pospešeno cepljenje.
Konec septmbra je vreme nekoliko dvignilo R in imamo stagnacijo – primeri praktično ne padajo več. Projekcije se s tem niso bistveno spremenile, ker je v njih itak privzeto, da se bo do konca oktobra zaradi šol, služb in vremena R poskušal dvigniti za določeno vrednost (ta predvideni prirastek pa sproti izničuje sprotna imunizacija).

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 993 novih primerov pri 4997 testih, 19.87% (avg7d 19.65%, počasno padanje)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 0.97, delež 1.09
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 1.00, delež 1.05 (včeraj 1.05 in 1.03)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 0.96, delež 1.00 (včeraj 0.92 in 0.97)
R (izračunan za en teden nazaj) je 0.99 (10% teže na R iz števila primerov, 90% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V zadnjem mesecu je veliko boljši pokazatelj bil delež.
Obseg PCR: 31.0k/teden, precej ustaljen, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 172k/teden oz. 25.9k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.97 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Odprli smo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže vrh že dosegle in bomo tu nekje okoli 400 do konca meseca septembra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem, bodo padale zelo počasi, sicer pa zmerno hitro. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta v novembra, na 200 pa konec decembra.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanjem vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-750 smrti v 4. valu.

Podpiral sem obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so po padcu na 1/dan sredi julija zdaj spet okoli 40/dan. Sprejemi so zdaj očitno na vrhu in bi v skladu s trendi pri novih primerih morali zdaj začeti počasi upadati (in to zdaj nestrpno pričakujem).

Hospitalizacije so avgusta pričele hitro naraščati. Sredi septembra pa je tempo rasti v skladu z gibanji novih sprejemov upadel. Prognoza je zaradi povišanega tempa cepljenja sedaj ugodna.:)
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 7-8/dan ….

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Slabše zaščitene regije (precepljenost, prekuženost, na grafu nižje) imajo več okužb (višje incidence, na grafu bolj desno), kot bolje zaščitene. Ta sklopljenost je jasno izražena že od resnega pričetka 4. vala v začetku avgusta 2021.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

V vseh starostnih skupinah se situacija umirja. Tudi po odprtju univez v oktobru ne pričakujem bistvene rasti. Število primerov v skupini 15-24 let se sicer bo povečalo, a to bo spet le statistični efekt, kot je bil tisti pri odprtju OŠ s septembrom. Pač v skupini 15-24 se bo testiralo več in primerov bo več, ker pa je incidenca ista, se bodo dvignile le medtednske primerjave primerov, delež pozitivnih pa ne. Pravi pokazatelj dogajanja bo tako spet kot septembra delež pozitivnih. Ta bi sicer lahko tudi malo upadel zaradi več respiratornih obolenj populacije, od katerih bi bilo potem več negativnih PCR testov, a bistvenega padca deleža na ta račun ne pričakujem.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

petek 1.10.2021

Povzetek dnevne analize:
dnevno število primerov že nekaj časa ne raste več, očitno smo čez vrh okužb 4. vala
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšem primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.96, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, največ zdaj pa službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 873 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 869
SLO-zelenih je 28 občin, EU-zelenih 8 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
9/6/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 114 dni brez primera!
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je blizu 7/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje
napoved umrlih: 600-700 (140 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5150
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: sredina novembra
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (21% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Kakorkoli, najbolj realna trenutno izgleda varianta postopnega padanja epidemije brez dolgega platoja. V optimističnem scenariju je padanje lahko celo malce pospešeno.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.7%

četrtek 30.9.2021

Povzetek dnevne analize:
dnevno število primerov že nekaj časa ne raste več, očitno smo čez vrh okužb 4. vala
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšem primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.95, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, največ zdaj pa službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 868 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 864
SLO-zelenih je 29 občin (že raste nazaj), EU-zelenih 7 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
9/6/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 113 dni brez primera!
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se je ustavila (vrh), trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je blizu 7/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje
napoved umrlih: 600-700 (136 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5150
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 14.11. (med 27.10. in 14.12. vzhod prej, zahod kasneje)
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (22% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Kakorkoli, najbolj realna trenutno izgleda varianta postopnega padanja epidemije brez dolgega platoja. V optimističnem scenariju je padanje lahko celo malce pospešeno.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.7%
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.
V drugi polovici septembra se je pokazalo, da je bil kljub zavedanju, da medtedenske primerjave primerov nerealno visoko kažejo na R, R še vedno ocenjen previsoko in je bil dejansko v okolici 1. Primeri so tako pričeli upadati. Projekcije so se zato bistveno izboljšale, dodatno pa jih je izboljšalo pospešeno cepljenje.

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 1028 novih primerov pri 5753 testih, 17.87% (avg7d 19.18%, počasno padanje)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 1.00, delež 0.99
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 0.96, delež 0.99 (včeraj 0.94 in 1.04)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 0.89, delež 0.96 (včeraj 0.85 in 0.95)
R (izračunan za en teden nazaj) je 0.95 (10% teže na R iz števila primerov, 90% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V zadnjem mesecu je veliko boljši pokazatelj bil delež.
Obseg PCR: 31.7k/teden, precej ustaljen, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 181k/teden oz. 25.9k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.95 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Čez nekaj dni odpremo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže vrh že dosegle in bomo tu nekje okoli 400 do konca meseca septembra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem, bodo padale zelo počasi, sicer pa zmerno hitro. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta v novembra, na 200 pa konec decembra.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanjem vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-700 smrti v 4. valu.

Podpiral sem obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so po padcu na 1/dan sredi julija zdaj spet okoli 40/dan. Sprejemi so zdaj očitno na vrhu in bi v skladu s trendi pri novih primerih morali zdaj začeti počasi upadati (in to zdaj nestrpno pričakujem).

Hospitalizacije so avgusta pričele hitro naraščati. Sredi septembra pa je tempo rasti v skladu z gibanji novih sprejemov upadel. Prognoza je zaradi povišanega tempa cepljenja sedaj ugodna.:)
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 7-8/dan ….

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Slabše zaščitene regije (precepljenost, prekuženost, na grafu nižje) imajo več okužb (višje incidence, na grafu bolj desno), kot bolje zaščitene. Ta sklopljenost je jasno izražena že od resnega pričetka 4. vala v začetku avgusta 2021.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

V vseh starostnih skupinah se situacija umirja. Tudi po odprtju univez v oktobru ne pričakujem bistvene rasti. Število primerov v skupini 15-24 let se sicer bo povečalo, a to bo spet le statistični efekt, kot je bil tisti pri odprtju OŠ s septembrom. Pač v skupini 15-24 se bo testiralo več in primerov bo več, ker pa je incidenca ista, se bodo dvignile le medtednske primerjave primerov, delež pozitivnih pa ne. Pravi pokazatelj dogajanja bo tako spet kot septembra delež pozitivnih. Ta bi sicer lahko tudi malo upadel zaradi več respiratornih obolenj populacije, od katerih bi bilo potem več negativnih PCR testov, a bistvenega padca deleža na ta račun ne pričakujem.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

sreda 29.9.2021

Povzetek dnevne analize:
dnevno število primerov že nekaj časa ne raste več, imamo celo že padajoči trend
R je bil nižji od prejšnjih ocen in nakazuje se, da smo na vrhu 4. vala, s primeri pa že čez
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšm primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.94, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, največ zdaj pa službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 866 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 861
SLO-zelenih je 28 občin (že raste nazaj), EU-zelenih 7 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
8/6/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 112 dni brez primera!
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se ustavlja, trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je blizu 7/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje
napoved umrlih: 600-650 (128 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 3.11. (med 24.10. in 7.12. vzhod prej, zahod kasneje)
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (22% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Kakorkoli, najbolj realna trenutno izgleda varianta postopnega padanja epidemije brez dolgega platoja. V optimističnem scenariju je padanje lahko celo malce pospešeno.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.5%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.5%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.5%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.5%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.5%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.5%
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.
V drugi polovici septembra se je pokazalo, da je bil kljub zavedanju, da medtedenske primerjave primerov nerealno visoko kažejo na R, R še vedno ocenjen previsoko in je bil dejansko v okolici 1. Primeri so tako pričeli upadati. Projekcije so se zato bistveno izboljšale, dodatno pa jih je izboljšalo pospešeno cepljenje.

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 1339 novih primerov pri 6408 testih, 20.90% (avg7d 19.20%, počasno padanje, zadnji dan dvig)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 1.12, delež 1.04
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 0.94, delež 1.04 (včeraj 0.81 in 0.99)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 0.85, delež 0.95 (včeraj 0.81 in 0.94)
R (izračunan za en teden nazaj) je 0.94 (10% teže na R iz števila primerov, 90% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V zadnjem mesecu je veliko boljši pokazatelj bil delež.
Obseg PCR: 31.6k/teden, rahlo padal, zadnji dan porast, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 186k/teden oz. 26.5k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.94 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Čez nekaj dni odpremo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže vrh že dosegle in bomo tu nekje okoli 400 do konca meseca septembra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem, bodo padale zelo počasi, sicer pa zmerno hitro. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta v zadnjem tednu oktobra, na 200 pa konec decembra.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanjem vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-650 smrti v 4. valu.

Podpiral sem obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so po padcu na 1/dan sredi julija zdaj spet okoli 40/dan. Sprejemi so zdaj očitno na vrhu in bi v skladu s trendi pri novih primerih morali zdaj začeti počasi upadati (in to zdaj nestrpno pričakujem).

Hospitalizacije so avgusta pričele hitro naraščati. Sredi septembra pa je tempo rasti v skladu z gibanji novih sprejemov upadel. Prognoza je zaradi povišanega tempa cepljenja sedaj ugodna.:)
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 7-8/dan ….

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”. Malce pozitivno je presenečala Podravska.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Slabše zaščitene regije (precepljenost, prekuženost, na grafu nižje) imajo več okužb (višje incidence, na grafu bolj desno), kot bolje zaščitene. Ta sklopljenost je jasno izražena že od resnega pričetka 4. vala v začetku avgusta 2021.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

V vseh starostnih skupinah se situacija umirja. Tudi po odprtju univez v oktobru ne pričakujem bistvene rasti. Število primerov v skupini 15-24 let se sicer bo povečalo, a to bo spet le statistični efekt, kot je bil tisti pri odprtju OŠ s septembrom. Pač v skupini 15-24 se bo testiralo več in primerov bo več, ker pa je incidenca ista, se bodo dvignile le medtednske primerjave primerov, delež pozitivnih pa ne. Pravi pokazatelj dogajanja bo tako spet kot septembra delež pozitivnih. Ta bi sicer lahko tudi malo upadel zaradi več respiratornih obolenj populacije, od katerih bi bilo potem več negativnih PCR testov, a bistvenega padca deleža na ta račun ne pričakujem.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

torek 28.9.2021

Povzetek dnevne analize:
dnevno število primerov se zadnje dni resno umirja, imamo celo že padajoči trend
R je bil nižji od prejšnjih ocen in nakazuje se, da smo na vrhu 4. vala, s primeri pa že čez
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšm primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.93, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, največ zdaj pa službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 844 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 839
SLO-zelenih je 29 občin (že raste nazaj), EU-zelenih 6 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
9(že raste nazaj/5/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 111 dni brez primera!
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se ustavlja, trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je blizu 7/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje
napoved umrlih: 600-650 (128 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 31.10.
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (22% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Kakorkoli, najbolj realna trenutno izgleda varianta postopnega padanja epidemije brez dolgega platoja. V optimističnem scenariju je padanje lahko celo malce pospešeno.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.3%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.3%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.3%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.3%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.3%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.3%
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.
V drugi polovici septembra se je pokazalo, da je bil kljub zavedanju, da medtedenske primerjave primerov nerealno visoko kažejo na R, R še vedno ocenjen previsoko in je bil dejansko v okolici 1. Primeri so tako pričeli upadati. Projekcije so se zato bistveno izboljšale, dodatno pa jih je izboljšalo pospešeno cepljenje.

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 1037 novih primerov pri 4785 testih, 21.67% (avg7d 19.01%, počasi pada)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 0.78, delež 0.95
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 0.81, delež 0.99 (včeraj 0.82 in 0.98)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 0.81, delež 0.94 (včeraj 0.83 in 0.94)
R (izračunan za en teden nazaj) je 0.93 (10% teže na R iz števila primerov, 90% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V zadnjem mesecu je veliko boljši pokazatelj bil delež.
Obseg PCR: 31.1k/teden, rahlo pada, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 190k/teden oz. 28.1k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.93 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Čez nekaj dni odpremo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže vrh že dosegle in bomo tu nekje okoli 400 do konca meseca septembra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem, bodo padale zelo počasi, sicer pa zmerno hitro. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta v zadnjem tednu oktobra, na 200 pa konec decembra.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanjem vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-650 smrti v 4. valu.

Podpiral sem obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so po padcu na 1/dan sredi julija zdaj spet okoli 40/dan. Sprejemi so zdaj očitno na vrhu in bi v skladu s trendi pri novih primerih morali zdaj začeti počasi upadati (in to zdaj nestrpno pričakujem).

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”. Malce pozitivno je presenečala Podravska.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

V vseh starostnih skupinah se situacija umirja. Tudi po odprtju univez v oktobru ne pričakujem bistvene rasti. Število primerov v skupini 15-24 let se sicer bo povečalo, a to bo spet le statistični efekt, kot je bil tisti pri odprtju OŠ s septembrom. Pač v skupini 15-24 se bo testiralo več in primerov bo več, ker pa je incidenca ista, se bodo dvignile le medtednske primerjave primerov, delež pozitivnih pa ne. Pravi pokazatelj dogajanja bo tako spet kot septembra delež pozitivnih. Ta bi sicer lahko tudi malo upadel zaradi več respiratornih obolenj populacije, od katerih bi bilo potem več negativnih PCR testov, a bistvenega padca deleža na ta račun ne pričakujem.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

Hospitalizacije so avgusta pričele hitro naraščati. Sredi septembra pa je tempo rasti v skladu z gibanji novih sprejemov upadel. Prognoza je zaradi povišanega tempa cepljenja sedaj ugodna.:)
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti, ki naj bi bil okoli 7-8/dan ….

ponedeljek 27.9.2021

Povzetek dnevne analize:
dnevno število primerov se zadnje dni resno umirja, imamo celo že padajoči trend
R je bil nižji od prejšnjih ocen in nakazuje se, da smo na vrhu 4. vala, s primeri pa že čez
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšm primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.94, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, največ zdaj pa službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 883 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 878
SLO-zelenih je 28 občin (že raste nazaj), EU-zelenih 6 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
8(že raste nazaj/5/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 110 dni brez primera!
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se ustavlja, trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je okoli 6/dan in se (le še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje
napoved umrlih: 600-650 (119 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: začetek novembra
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (22% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti izhoda brez ravnega platoja (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Kakorkoli, najbolj realna trenutno izgleda varianta postopnega padanja epidemije brez dolgega platoja. V optimističnem scenariju je padanje lahko celo malce pospešeno.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.2%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.2%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.2%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.2%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.2%
Pesimistični scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 50.2%

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte imajo zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R..

Sprejemi so po padcu na 1/dan sredi julija zdaj spet preko 40/dan. Sprejemi bi v skladu s trendi pri novih primerih morali začeti zdaj upadati (in to zdaj nestrpno pričakujem).

Hospitalizacije so avgusta pričele hitro naraščati. Sredi septembra pa je tempo rasti v skladu z gibanji novih sprejemov upadel. Prognoza je zaradi povišanega tempa cepljenja sedaj ugodna.:)
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 6 na dan. Morali bi biti blizu maksimuma dnevnih smrti ….

nedelja 26.9.2021

Povzetek dnevne analize:
dnevno število primerov se zadnje dni resno umirja, imamo celo že padajoči trend
R je bil nižji od prejšnjih ocen in nakazuje se, da smo na vrhu 4. vala, s primeri pa že čez
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšm primeru to lahko preko platoja zavleče v december
R=0.93, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, največ zdaj pa službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje rast R
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 884 (max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 878
SLO-zelenih je 26 občin (že raste nazaj), EU-zelenih 8 občin (že raste nazaj), ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
10(že raste nazaj/4/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 109 dni brez primera!
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se ustavlja, trenutno povprečno okoli 40/dan, smrti je okoli 6/dan in se (še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje
napoved umrlih: 600-650 (112 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5100
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (22% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti hitrega izhoda (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Kakorkoli, najbolj realna trenutno izgleda varianta postopnega padanja epidemije brez dolgega platoja. V optimističnem scenariju je padanje lahko celo malce pospešeno.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.1%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.1%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.1%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.1%

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Trenutno importirani primeri in pa različica delta prevladujeta nad ugodnimi zunanjimi razmerjami.

Sprejemi so po padcu na 1/dan sredi julija zdaj spet preko 40/dan. Sprejemi bi v skladu s trendi pri novih primerih morali začeti zdaj upadati (in to zdaj nestrpno pričakujem).

Hospitalizacije so avgusta pričele hitro naraščati. Sredi septembra pa je tempo rasti v skladu z gibanji novih sprejemov upadel. Prognoza je zaradi povišanega tempa cepljenja sedaj ugodna.:)
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 5 na dan. Računamo, da krivlja smrti ne bo tako zvesto sledila hospitalizacijam, kot trenutno sprejemi in hospitalizacije sledijo okužbam.

sobota 25.9.2021

Povzetek dnevne analize:
dnevno število primerov se zadnje dni resno umirja, imamo celo že padajoči trend
R je bil nižji od prejšnjih ocen in nakazuje se, da smo na vrhu 4. vala
sledi padanje parametrov epidemije, se pa v najslabšm primeru to lahko preko platoja zavleče v decembermedtedenskih razmerij primerov, a očitno premalo
R=0.95, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, največ zdaj pa službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje rast R
7-dnevno povprečje javljenih primerov je 898, NIJZ s korekcijami za nazaj 893
SLO-zelenih je 27 občin (že raste nazaj), EU-zelenih 8 občin (že raste nazaj), ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
8/4/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 108 dni brez primera!
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se ustavlja, trenutno povprečno okoli 42/dan, smrti je okoli 6/dan in se (še) počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): smo že čez vrh, ki je bil 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno
napoved hospitaliziranih: kot kaže smo na vrhu pri dobrih 400, sledi počasno padanje
napoved umrlih: 600-650 (106 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5050-5100
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (22% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti hitrega izhoda (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa mi pravi, naj se ne zaletimo:) Kakorkoli, najbolj realna trenutno izgleda varianta postopnega padanja epidemije brez dolgega platoja. V optimističnem scenariju je padanje lahko celo malce pospešeno.

Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.1%
Realen scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.40; c) dosedanja prekuženost 50.1%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.1%
Scenarij hitrejšega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 5.11. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 50.1%
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta (še) največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.

Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Podatki PCR testov za včeraj: 1005 novih primerov pri 5534 testih, 18.16% (avg7d 19.31%, pada)

Primerjava z istim dnevom pred enim tednom: primeri 0.79, delež 0.91
Podobna primerjava za zadnjih 3 dni skupno: primeri 0.78, delež 0.93 (včeraj 0.81 in 0.96)
Podobna primerjava za zadnjih 7 dni skupno: primeri 0.85, delež 0.94 (včeraj 0.90 in 0.96)
R (izračunan za en teden nazaj) je 0.93 (10% teže na R iz števila primerov, 90% iz deleža pozitivnih). Tu nekje je pravi R. V zadnjem mesecu je veliko boljši pokazatelj bil delež.
Obseg PCR: 32.6k/teden, pada, rekord je bil konec oktobra 44k/teden
Obseg HAT: 197k/teden oz. 28.1k/dan, pada, rekord je bil 25.5. 222k/teden oziroma 32k/dan

Ocenjujem (za teden dni nazaj) R=0.95 Proces povečevanja R zaradi delte je že nekaj časa končan. Zdaj ga višajo službe in šole, malenkost tudi vreme (pri delti ima vreme zelo majhen vpliv). Niža ga sprotna imunizacija. Efekt več primerov zaradi povečanega testiranja v skupini 5-14 let se je iznihal. Izračunani R je tako sredi septembra vleklo previsoko. Ta efekt sem ves čas upošteval, a očitno še premalo. Pravi pokazatelj je bil delež pozitivnih, ki ga je treba bolj upoštevati v situacijah, ko pričneš na novo testirati neko skušino, ki je prej nisi testiral, dejanska incidenca v njej pa se načeloma ne razlikuje od drugih. Počasi bi se moral bolj pokazati efekt šol. Čez nekaj dni odpremo tudi univerze … A sprotna imunizacija (prekuževanje + cepljenje) je relativno močna – neimune je namreč le še (največ) četrtina prebivalstva.

Hospitalizacije so kot kaže vrh že dosegle in bomo tu nekje okoli 400 do konca meseca septembra, potem pa padanje. Če se zgodi pesimističen scenarij z dvomesečnim platojem platojem, bodo padale zelo počasi, sicer pa zmerno hitro. Padec na 300 hospitaliziranih se obeta v zadnjem tednu oktobra, na 200 pa v prvi polovici decembra.

Potencial smrti našega 4. vala že precej časa ocenjujem na okoli dobrih 500 (recimo temu osnovni potencial), a v realnosti bo ta davek med neimunimi (med 65+ jih je bilo 24.9. okoli 24k) verjetno precej nižji, realno okoli 300-400. Podobno sem ves čas ocenjeval, da zaradi postopnega padanja zaščite od cepljenja lahko ta številka naraste tudi na 400 ali več, lahko tudi 500 ali 600. Upošteval sem še zadnja cepljenja, prekuženost nekaj pod 50% ter to, da se bo v 4. valu okužilo podoben delež neimunih, kot se je v dosedanjih valovih skupaj. Delta bi sicer zaradi svoje višje virulentnosti lahko našla večji delež neimunih, a po drugi strani so ljudje z največ stiki do sedaj že večinoma prekuženi. Če bi jih delta recimo našla 75%, bi se osnovni potencial smrti iz 500 povišal na 850. Z upoštevanje vsega tega je bila moja ocena od poletja do sem okoli 500-700 smrti v 4. (delta) valu.
Model trenutno kaže na okoli 600-650 smrti v 4. valu.

Podpiram obvezno cepljenje skupine 50+. Zaradi njih bi namreč lahko imeli polne bolnišnice. Cepljenje močno zmanjša pritisk na bolnišnice, družba pa lahko zato normalno funkcionira. V zadnjem času je z zahtevanim pogojem PCT tempo cepljenja za nekaj časa narasel, rast epidemije pa se je zaustavila – uvedba obveznega cepljenja očitno ne bo potrebna, vseeno pa naj se ljudje zaščitijo.
Nasprotujem siljenju v cepljenje mlajših od 40 let. Oni so manj ogroženi in ne polnijo bolnišnic. Če so se sami odločili, da jih prebolevanje covid ne skrbi, naj ga prebolijo. Tudi zaščita, ki jo bodo s tem pridobili (če preživijo), bo boljša in dolgotrajnejša, kot zaščita pridobljena s cepljenjem, taki so pač izsledki znanstvenih raziskav v zadnjem času.
Absolutno nasprotujem posrednemu siljenju v cepljenje otrok, to bi moralo biti prepuščeno posamezniku/družini. Pri otrocih so riziki pri prebolevanju covid že primerljivi z nizkimi riziki zaradi cepljenja, efekta na zasedenost bolnišnic in na širjenje bolezni pa tako cepljenje praktično nima.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je tedaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni (poleg prekuževanja) še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Trenutno importirani primeri in pa različica delta prevladujeta nad ugodnimi zunanjimi razmerjami.

Sprejemi so po padcu na 1/dan sredi julija zdaj spet preko 40/dan. Sprejemi bodo izgleda par dni še malo naraščali, potem pa bi v skladu s trendi pri novih primerih morali začeti upadati (in to zdaj nestrpno pričakujem).

Hospitalizacije so avgusta pričele hitro naraščati. Sredi septembra pa je tempo rasti v skladu z gibanji novih sprejemov upadel. Prognoza je zaradi visokega tempa cepljenja sedaj ugodna in kot kaže, sploh ne bomo presegli številke 1000 sočasno hospitaliziranih:) Model vrh sedaj prikazuje 8.10. pri okoli 427 hospitaliziranih.
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 5 na dan. Računamo, da krivlja smrti ne bo tako zvesto sledila hospitalizacijam, kot trenutno sprejemi in hospitalizacije sledijo okužbam.

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”. Malce pozitivno je presenečala Podravska.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

petek 24.9.2021

Povzetek dnevne analize:
dnevno število primerov se zadnje dni resno umirja, imamo celo že padajoči trend
imuni še nismo toliko, da bi lahko že sedaj bilo konec vala, pa tudi pazimo se ne toliko, je pa bil R očitno nižji
razlog za previsoke projekcije je bil poleg povišanega tempa cepljenja delno tudi precenjen R – je bilo upoštevano, da je nižji od medtedenskih razmerij primerov, a očitno premalo
R=0.98, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, največ zdaj pa službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje rast R
7-dnevno povprečje javljenih primerov je 941, NIJZ s korekcijami za nazaj 927 !!!!!
SLO-zelenih je 24 občin (že raste nazaj), EU-zelenih 7 občin (še pada a bo kmalu obrat), ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
9/3/1 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 107 dni brez primera!
število novih sprejemov v bolnišnice (zdaj umirjeno) narašča, trenutno povprečno okoli 44/dan, smrti je okoli 6/dan in se počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vrh med zdaj (optimističen scenarij – padanje) in koncem oktobra pri največ 1180 (pesimističen scenarij – plato)
napoved hospitaliziranih: vrh 420-430 med začetkom oktobra in sredino novembra, odvisno od tega, ali imamo plato ali že izhod
napoved umrlih: 600-850 (101 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5130-5270
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (22% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Dogajanje je odvisno od tega, ali bomo zdaj imeli plato, ali pa se bomo kar takoj začeli spuščati. Videlo se bo do konca septembra. Veliko podatkov govori v prid varianti hitrega izhoda (šole ne vplivajo toliko kot lani, vreme pa sploh ne), konzervativna narava pa pravi, naj se ne zaletimo:)

Scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 30.10. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 49.9%
Scenarij platoja – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 30.10. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 49.9%
Scenarij hitrega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 30.10. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 49.9%
Scenarij hitrega izhoda – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 30.10. postopoma navzgor za 0.30; c) dosedanja prekuženost 49.9%
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

V juliju je bilo opazno naraščanje deleža pozitivnih pri precej konstantnem obsegu PCR testiranja. Pri tem je obseg HAT testov vmes večinoma naraščal. To vsekakor niso bili pokazatelji prave resne rasti, saj pri pravi rasti hkrati naraščata obseg testiranja in delež pozitivnih. Ker se je več testirala skupina 15-24 let, ki je zaradi več stikov in potovanj tudi v resnici bila bolj okužena, je z rastjo števila primerov rastel tudi delež pozitivnih.
Se je pa obseg PCR testiranja v začetku avgusta pričel nazaj rahlo povečevati. Očitno lokalno rast smo začeli opažati po 10.8.
Konec avgusta so zaradi konca počitnic padli uvoženi primeri, pa še hitro testiranje ni več brezplačno. Rast primerov je tako nižja in samo še zmerno eksponentna, linearne rasti zaradi uvoženih primerov je samo še skoraj zanemarljivo malo.
Po prvem tednu septembra smo opažali dvig izmerjenega R, ki pa je seveda bil v dokajšnji meri posledica dodatnega testiranja v skupini 5-14 let, kjer je zato bila visoka rast primerov (prej testiranja ni bilo in zato primerov malo). Skupina 5-14 je po incidenci po napovedih v deh tednih ujela in prehitela skupino 15-24, potem pa se je njena rast po sredini septembra umirila in opazili smo vnaprej predviden padec izmerjenega R. R je bil v vmesnem času tako deloma precenjen (zdaj kaže da celo ZELO precenjen), in ga je bilo potrebno krepko korigirati navzdol. Skupina 15.24 let, ki se je zdaj več testirala, v resnici ni bolj okužena od drugih skupin, zato z naraščanjem skupnega števila pozitivnih delež pozitivnih ni naraščal in zato na grafu za R taka razlika med polno (število primerov) in črtkano (delež pozitivnih) modro krivuljo.
V oktobru je bilo sicer pričakovati postopen dvig R proti 1.4. A pospešen tempo cepljenja pomeni še večjo sprotno imunizacijo, ki še hitreje sproti znižuje R, kot ga razmere, službe in šole dvigujejo. Tako da zdaj bolj kaže, da se MORDA dvigne do 1.10, kaj več pa ne, še bolj verjetno pa max do 1.05.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Trenutno importirani primeri in pa različica delta prevladujeta nad ugodnimi zunanjimi razmerjami.

Sprejemi so po padcu na 1/dan sredi julija zdaj spet preko 40/dan. Sprejemi bodo izgleda par dni še malo naraščali, potem pa bi v skladu s trendi pri novih primerih morali začeti upadati (in to zdaj nestrpno pričakujem).

Hospitalizacije so avgusta pričele hitro naraščati. Sredi septembra pa je tempo rasti v skladu z gibanji novih sprejemov upadel. Prognoza je zaradi visokega tempa cepljenja sedaj ugodna in kot kaže, sploh ne bomo presegli številke 1000 sočasno hospitaliziranih:) Model vrh sedaj prikazuje 8.10. pri okoli 427 hospitaliziranih.
Povprečno dnevno število umrlih je zdaj nekako že spet preko 5 na dan. Računamo, da krivlja smrti ne bo tako zvesto sledila hospitalizacijam, kot trenutno sprejemi in hospitalizacije sledijo okužbam.

Incidence regij so zelo v skladu z zaščitenostjo regij (glej tabelo relativne zaščitenosti regij na začetku analize). OK in GŠ imata kljub ugodnejšim zunanjim razmeram intenziven 4. val. PM in KO sta vskladu s pričakovanji vztrajno na najnižjih incidencah. Vmes kakšna majhna regija naredi kakšen opaznejši premik, a se to v kakšnem tednu hitro kompenzira in regija se vrne “na svoje mesto”. Malce pozitivno je presenečala Podravska.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od junija 2021 naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

četrtek 23.9.2021

Povzetek dnevne analize:
tudi vzhodna Slovenija izpolnila kriterije za EU-rdečo! na ECDC karti bo tako označeno danes 23.9
dnevno število primerov se zadnje dni resno umirja, imamo celo že padajoči trend
imuni še nismo toliko, da bi lahko že sedaj bilo konec vala, pa tudi pazimo se ne toliko, je pa bil R očitno nižji
razlog za previsoke projekcije je bil poleg povišanega tempa cepljenja delno tudi precenjen R – je bilo upoštevano, da je nižji od medtedenskih razmerij primerov, a očitno premalo
R=0.99, konec poletja že nekaj malega dodaja vreme, največ zdaj pa službe in šole, sprotna imunizacja preprečuje rast R
7-dnevno povprečje javljenih primerov je 962, NIJZ s korekcijami za nazaj 955
SLO-zelenih je 20 občin (že raste nazaj), EU-zelenih 8 občin, ostali so bolj kot ne rdeči ali črni
9/4/2 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne, Hodoš 106 dni, Žetale 42 dni! Osilnica je pred nekaj dnevi izpadla po 137 dneh!!!!!
število novih sprejemov v bolnišnice (zdaj umirjeno) narašča, trenutno povprečno okoli 43/dan, smrti je okoli 6/dan in se počasi dviguje
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vrh okoli 1180 21.10. (znižanje zaradi povečanega tempa cepljenja in nižjega R)
napoved hospitaliziranih: 400 24.9., vrh okoli 427 8.10.
napoved umrlih: 500-700 (99 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5120
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (22% slabše!) … zelo v skladu s tem se sedaj gibajo incidence!!

Rezultati epidemiološkega modela, ki se nahaja v aplikaciji covidSLO, so na grafu spodaj, in prikazuje vse glede poteka epidemije pomembne krivulje. Omogočeno je ročno nastavljanje treh parametrov: tempo cepljenja, jesenski dvig R ter privat nastavitev dosedanje prekuženosti. V osnovi je izrisan scenarij, ko se tempo cepljenja v prvih treh tednih napovedi samodejno prilagaja razdeljenim prvim odmerkom v zadnjih treh tednih. Vrh dogajanja se kaže proti koncu oktobra, ker se število neimunih prej očitno ne bo dovolj zmanjšalo.

Najbolj verjeten scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 30.10. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 49.8%
Najbolj verjeten scenarij – predpostavke: a) tempo cepljenja samodejno prilagojen prvim odmerkom; b) R gre med 5.9. in 30.10. postopoma navzgor za 0.50; c) dosedanja prekuženost 49.8%
Ob enaki stopnji okuževanja kot skupno v prejšnjih valovih, se nam med neimunimi obeta največ toliko smrti …
Spremembe primerov in incidenc.

Importi v regijah JV/PS/GO iz začetka julija so se v dveh tednih lepo absorbirali. V vmesnem času nam je R zaradi delte naraščal in tudi že prestopil mejo R=1.
Za tem so se importi seveda dogajali tudi v drugih regijah, ki so po incidencah tako dohitevale in tudi dohitele prve tri omenjene regije.
Sprememba je nastopila nekako po 23.7.2021, ko je zaradi vse bolj prevladujoče delte R prišel v okolico 1 in se uvoženi primeri, ki jih je bilo še vedno veliko, niso absorbirali več. V bistvu so se nam nekako superponirali na obstoječo incidenco in nam jo nekako linearno poviševali. Primeri so se potem iz prvotnih skupin 15-24 ter 25-35 let intenzivneje prelivali tudi v višje starostne skupine, ki jim je potem tudi naraščala incidenca.
Po 2.-10.8.2021 nam je štartala blaga lokalna eksponentna rast, ker so nam začeli rasti tako PCR testi kot število pozitivnih. Koliko je je bilo, je bilo odvisno od kontrole superprenašalskih dogodkov, od vremena in še od marsičesa. Do konca avgusta je bila kontrola solidna in rast ni bila pretirana.
Že dolgo prej sem sicer predvideval, da se nam resna rast lahko začne dogajati v 2. polovici avgusta, bolnišnice pa bi se potem začele opazneje polniti v septembru.
V prvi polovici septembra smo bili priče (bolj kot ne statistični) rasti incidence v skupini 5-14 let, ker se ti šolarji testirajo več, kot so se poleti.