Trendi, napovedi (arhiv januar 2022)

Dobro skrit v tako gosti megli, da bi jo lahko rezali, leži mali ribnik.
Na prvi pogled je popolnoma vsakdanji. Če pa bi ga pogledali še enkrat, bi videli, da je pravljični …

Podatke pridobivam od vlade RS, MZ, NIJZ, NIB in @sledilnik.
Najlepša hvala!

arhiv analiz: december 2021november 2021oktober 2021september 2021avgust 2021julij 2021junij 2021maj 2021april 2021
marec 2021februar 2021januar 2021december 2020pred decembrom 2020

Opozorilo: Vse napisano in prikazano na tej strani ter znotraj aplikacije covidSLO je plod veliko vloženega dela. Pri tem se trudim upoštevati čimveč znanstvenih dognanj in stvari predstaviti na čimbolj realen način. Je pa epidemija COVID-19 zelo kaotičen sistem, ki je odvisen od množice dejavnikov. Na svetu tako ni nikogar, ki bi lahko s 100% gotovostjo vse pravilno predvidel vnaprej, še sploh za primer Slovenije. Zato tudi jaz ne prevzemam nobene odgovornosti, če bi nekdo mojim zaključkom preveč zaupal in zaradi tega potem utrpel kakršnokoli škodo. Kot rečeno, se trudim čimbolj verno interpretirati dogajanje in pričakovanja glede epidemije v bližnji prihodnosti. Hvala za razumevanje in zaupanje!:)
avtor strani in aplikacije covidSLO: Peter Malovrh, univ. dipl. inž. el., 2020-2022

VROČE: Naloži si Windows aplikacijo covidSLO (COVID-SLOVENIJA), ki ti omogoča dinamičen pogled na epidemijo z animacijami, statistikami, HAGT kalkulatorjem, epidemiološko napovedjo, …

Časovne animacije širjenja SARS-CoV-2
Scenariji razvoja epidemije v Sloveniji

Ljudje mi znajo dati dodatno energijo:)

Moram te pohvalit, da glede na par modelov najbolj realno napoveduješ, ker zadevo gledaš najbolj celostno, z zdravo kmečko pametjo.
Hvala za pozitivno naravnane in natančne napovedi.
Pravzaprav se, gledano po posameznih dnevih, tvoja napoved za zdaj uresničuje tako dobro, da je že kičasto
Jaz vas tako rada preberem! Vse je tako simpl in realno in strokovno.
Super za trud in napovedi. Pa da vidimo kako in kaj bo.
Tako, da malo več skromnosti, več resnega dela, študiranja, analitike in manj sončenja v medijih. Tako kot dela softmarex.wordpress.com.
Hvala za vaše analize. Vedno jih z veseljem preberem, ker nudijo malo več razlage in tolažbe.
Noro, kako dobre napovedi. Ne morem verjeti da je bil res že 13.5. napisan točen datum! Bravo!!Ne vem kako nisem prej vedel za to.
Sem čakal vaše objave. Realno razmišljanje je potrebno. Ne pa pretiravanje v ekstreme kot počnejo nekateri tu gor.
Če se ne motim vas tu kar nekaj časa ni bilo na spregled – še dobro da imamo covidslo.net:)
Pa še to – pohvale za Vašo analitiko in napovedi. Super!
Hvala za to razumljivo, prepričljivo optimistično komentiranje.

Hvala za vašo požrtvovalnost, delavnost, doslednost in vztrajnost pri modeliranju epidemije!
Glej si priden, očitno te je zgrabilo, da prideš nekam in si prišel. Hvala bo prava beseda …
Zlate podatke imaš in jih daješ!
Mal sem kronološko pregledal tvoje projekcije in so hudica zelo točne. Bravo!

29.7.2021: Določanje skupne imunosti na osnovi števila cepljenih in ocene števila prebolelih …
3.8.2021: Določanje števila neimunih po rizičnih starostnih skupinah na osnovi števila cepljenih in ocene števila prebolelih …
7.8.2021: Določanje prekuženosti v aplikaciji covidSLO …
12.12.2021: Ocena učinkovitosti zaščite s cepljenjem ter potenciala za 5. val epidemije

Cepivo deluje
V VB in Izraelu imajo (oktober 2021) v bolnišnicah precejšen procent oseb, ki so cepljene. A hkrati je v rizični populaciji za hospitalizacijo v teh državah velika večina ljudi cepljenih. Lepo se vidi, da je bolj varno biti med cepljenimi kot med necepljenimi – CEPIVO DELUJE.

Pojasnitev paradoksa višjega deleža cepljenih v COVID-19 bolnišnicah kljub visoki precepljenosti.

Primerjava aktualne s preteklimi projekcijami
Ogledalo modelarja …

Epidemija COVID-19 koronavirus Slovenija: Primerjava preteklih projekcij

Primerjava obsega epidemije med posameznimi valovi
V posameznih valovih je bilo zaznano zelo različno število okužb. A nivo testiranja se je sčasoma povečaval, kar je potrebno pravilno zajeti pri ocenjevanju dejanskega števila okužb …

Realna primerjava med obsegi valov epidemije COVID-19 v Sloveniji.

Faktorji učinkovitosti zaščite po cepljenju
Ti faktorji sčasoma padajo, s poživitvenim odmerkom cepiva pa ponovno narastejo …

Epidemija COVID-19 koronavirus Slovenija: Faktorji učinkovitosti zaščit

Izračun imunih
Če poznamo delež ljudi, ki še nimajo nikakršne imunosti od prebolevanja ali/in cepljenja, še ne poznamo dejanskega deleža trenutno dovzetnih za okužbo. Zaščitenost namreč s časom slabi, in potrebno je upoštevati izmerjene faktorje trenutne dejanske zaščitenosti …

Način izračuna imunih in neimunih iz poznanega števila cepljenih in prebolelih.

Za kontrolo predlagam obisk sorodne modelarske strani, kjer so zelo uspešno modelirali glavni del 4. (delta) vala, in imajo zelo uravnotežene predloge glede načina spopadanja z epidemijo.

petek 4.2.2022

Povzetek dnevne analize:
SMO ŽE PREKO VRHA PRIMEROV IN SMO VERJETNO ŽE NA VRHU SPREJEMOV V BOLNIŠNICE, VRH HOSPITALIZACIJ VERJETNO V NEDELJO
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO MARCA DELNO RAZŠIRI TA VAL EPIDEMIJE
zaradi spremembe metodologije testiranja (zadostuje HAT+) za 1.2. in 2.2. nerealno višja številka pozitivnih (skoraj seštevek dveh dni)
R=0.96 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov in sprememb metodologije testiranja natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorcev (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se je izboljševalo, zdaj že realni
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.5% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, zdaj pa še okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas omikrona že nekaj časa preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi, zdaj baje 2x)
vrh primerov se kaže da je bil nekje okoli 26.-30.1.2022, dosegli smo tudi 17.000 dnevnih primerov, bolj natančno bom vrh definiral do 7.1., ker je treba upoštevati spremembo metodologije testiranja in zamike
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 14.630 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.381
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 76%, 65-69: 77%, 70-74: 79%, 75-79: 79%, 80-84: 79%, 85-89: 79%, 90+: 79% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 96/dan, od 3.2. se ne šteje več rdečih con v ne-covid oddelkih, kjer so samo v izolaciji

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 15/dan (pri precej ni vzrok covid), obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max (realno) dnevno povprečje je bilo 14.056 27.1., razpolovitev primerov se predvideva v 13 dneh
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 800 7.2.2022, BA.2 ga ne more povišati, od 3.2. ne-covid izolacijske rdeče cone niso več vštete

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu je bil okoli 150, omikron vrh je odpadel, omikon v EIT spravi 10x manjši delež okuženih od delte
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, spremljajoča covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji.
Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji.
Projekcija v EIT. Omikron val v Sloveniji sploh ne bo povzročil vrha v EIT. Hospitalizacij je pri omikronu 4x manj, od teh pa jih 2.5x manj potrebuje intenzivno zdravljenje. Skupno omikron spravi 10x manjši delež okuženih v EIT, kot je bilo to pri delti. Zato tudi različica BA.2 ne more povzročiti nekega izrazitega vrha v EIT.
Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji s poskusom upoštevanja BA.2 različice variante omikron. Ker trenutno BA.2 še ni prisotna v večjem obsegu, sem modeliral postopen prevzem večinskega deleža med 7.2. in 27.2. in predpostavil 50% večjo sposobnost (hitrost) širjenja. Parametrov o zniževanju učinkovitosti zaščit od cepljenja in prebolelosti zaenkrat nisem spreminjal glede na prvotno BA.1 različico omikrona.
Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

četrtek 3.2.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI IMA TRENUTNO VRH, OZIROMA SMO VERJETNO ŽE PAR DNI PREKO
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO DELNO RAZŠIRI 5. VAL EPIDEMIJE
zaradi spremembe metodologije testiranja (zadostuje HAT+) za 1.2. in 2.2. nerealno višja številka pozitivnih (skoraj seštevek dveh dni)
R=0.98 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorcev (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se izboljšuje, zdaj višji od realnih
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.5% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas omikrona že nekaj časa preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže da je bil nekje okoli 26.-30.1.2022, dosegli smo tudi 17.000 dnevnih primerov, bolj natančno bom vrh definiral do 7.1., ker je treba upoštevati spremembo metodologije testiranja in zamike
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 15.140 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 15.111
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 75%, 65-69: 77%, 70-74: 78%, 75-79: 78%, 80-84: 78%, 85-89: 78%, 90+: 79% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 115/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 12/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max (realno) dnevno povprečje je bilo 14.056 27.1., razpolovitev primerov se predvideva v 13 dneh
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1100 9.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu je bil okoli 150, omikron vrh je odpadel
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, spremljajoča covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji.
Projekcija v EIT. Omikron val v Sloveniji sploh ne bo povzročil vrha v EIT. Hospitalizacij je pri omikronu 4x manj, od teh pa jih 2.5x manj potrebuje intenzivno zdravljenje. Skupno omikron spravi 10x manjši delež okuženih v EIT, kot je bilo to pri delti. Zato tudi različica BA.2 ne more povzročiti nekega izrazitega vrha v EIT.
Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji s poskusom upoštevanja BA.2 različice variante omikron. Ker trenutno BA.2 še ni prisotna v večjem obsegu, sem modeliral postopen prevzem večinskega deleža med 7.2. in 27.2. in predpostavil 50% večjo sposobnost (hitrost) širjenja. Parametrov o zniževanju učinkovitosti zaščit od cepljenja in prebolelosti zaenkrat nisem spreminjal glede na prvotno BA.1 različico omikrona.
Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.
Potek epidemije v regiji Gorenjska.

sreda 2.2.2022

Javljenih je bilo 23.429 potrjeno pozitivnih, pri opravljenih 17.143 PCR testih in 96.160 HAT.
Metodologija je sedaj spremenjena. Veliko ljudi se namesto na PCR pošlje na HAT, in HAT+ že pomeni potrjeno okužbo, ni več potrjevanja s PCR.
Potrjevanje s PCR je vzelo nekaj časa, tipično 1-2 dneva. Rezultati teh PCR testov so bili tako sporočani z omenjenim časovnim zamikom.
Tako smo tudi za včerajšnji dan prejeli rezultate PCR vzorcev od prej, dodatno pa še vse HAT+ od včeraj. Pri teh HAT+ ni omenjenega časovnega zamika poročanja. Zaradi prehodnega pojava iz naslova spremenjene metodologije smo tako za torek 1.2. prejeli precej višjo številko potrjeno pozitivnih, kot bi jo pri nespremenjeni metodologiji. Ta višja številka tako sama po sebi ne pomeni nikakršnega znaka naraščajoče epidemije.
Omenjeni efekt spremembe metodologije bo verjetno delno opazen samo še na podatkih za sredo 2.2., potem pa bomo že dobivali sprotne regularne številke. Dejansko bodo te potem bolj ažurne. Efekt prehoda na večjo ažurnost pa lahko ponazorim na primeru pošte: prijatelju pošlješ vsak dan eno pismo. Pošta ga dostavi v treh dneh. Prijatelj vsak dan dobi eno pismo. Potem pošta pohitri dostavo in skrajša dostavni čas na 1 dan. Prijatelj bo takrat v istem dnevu prejel 3 pisma (analogija s 23k primeri), potem pa spet normalno po enega na dan.
Kakšen je dejanski potek epidemije lahko posredno sklepamo po sprejemih v bolnišnice, ti pa imajo enotedenski zamik. Če smo že imeli vrh okužb, bodo sprejemi prenehali naraščati do konca tega tedna.
To in več v novici na portalu n1info.si

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI IMA TRENUTNO VRH, OZIROMA SMO VERJETNO ŽE PAR DNI PREKO
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO ?POVIŠA? IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
zaradi spremembe metodologije testiranja (zadostuje HAT+) za včeraj nerealno višja številka pozitivnih (skoraj seštevek dveh dni)
R=1.00 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorcev (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se izboljšuje, zdaj višji od realnih
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.4% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas omikrona že nekaj časa preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 26.-28.1.2022, dosegli smo tudi 17.000 dnevnih primerov, bolj natančno bom vrh definiral do 7.1., ker je treba upoštevati spremembo metodologije testiranja in zamike
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 14.760 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.737
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 75%, 65-69: 76%, 70-74: 78%, 75-79: 78%, 80-84: 78%, 85-89: 78%, 90+: 79% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 110/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 11/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max (realno) dnevno povprečje je bilo 14.056 27.1., razpolovitev primerov se predvideva v 13 dneh
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1100 9.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu je bil okoli 150, omikron vrh bo izgleda 145 10. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, spremljajoča covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov pri nas in v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala.

torek 1.2.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI IMA TRENUTNO VRH, OZIROMA SMO VERJETNO ŽE PAR DNI PREKO
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO ?POVIŠA? IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.02 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorcev (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se izboljšuje, zdaj verjetno višji od realnih
s 1. februarjem ni več nujno PCR potrjevanje HAT+ testov, zadostuje HAT … kako bo to vplivalo na sporočene številke bomo videli že jutri
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.4% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas omikrona že nekaj časa preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 26.-28.1.2022, dosegli smo tudi 17.000 dnevnih primerov, bolj natančno bom vrh definiral do 7.1., ker je treba upoštevati spremembo metodologije testiranja in zamike
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 32%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 13.912 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 13.911
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 74%, 65-69: 75%, 70-74: 77%, 75-79: 77%, 80-84: 77%, 85-89: 77%, 90+: 78% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 105/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 11/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max dnevno povprečje je bilo 14.056 27.1., razpolovitev primerov se predvideva v 13 dneh
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 950-1000 8.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 150 okoli 10. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, zraven covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov pri nas in v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala.
Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.
Potek epidemije v regiji Gorenjska.

ponedeljek 31.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI VERJETNO ŽE NA VRHU VALA ALI MALO ČEZ
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.08 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorce (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se stanje počasi izboljšuje
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.4% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 27.-31.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov, tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 33%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 14.056 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.055
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 73%, 65-69: 75%, 70-74: 76%, 75-79: 76%, 80-84: 76%, 85-89: 76%, 90+: 77% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 105/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 11/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max dnevno povprečje >14.000 28.-31.1., posamezen dan lahko tudi 18.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 9.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 170 okoli 10. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, zraven covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov pri nas in v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.
Potek epidemije v regiji Gorenjska.

nedelja 30.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI VERJETNO ŽE NA VRHU VALA
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.10 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorce (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se stanje počasi izboljšuje
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.4% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 27.-31.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov, tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 34%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 14.031 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.025
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 91% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 76%, 75-79: 76%, 80-84: 76%, 85-89: 76%, 90+: 76% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 100/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 11-12/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 29 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >14.000 28.-30.1., posamezen dan lahko tudi 18.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1000 9.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160 okoli 10. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, zraven covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov pri nas in v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala.

sobota 29.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI ZELO BLIZU VRHA ALI MORDA CELO NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.15 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorce (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se stanje počasi izboljšuje
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (9.4% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 27.-31.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov in ni še znakov ustavljanja rasti, a tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 14.039 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.070
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 91% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 71%, 65-69: 73%, 70-74: 75%, 75-79: 74%, 80-84: 74%, 85-89: 74%, 90+: 75% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 100/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 12/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 20 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >14.500 28.-30.1., posamezen dan lahko tudi 20.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 10.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več in kasneje)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-190 okoli 12. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, zraven covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 2.5, po vrhu omikron vala pa v začetku februarja spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 70%, a se po sredini januarja postopoma vrača nazaj proti 85%. Reinfekcije se k P ne prištevajo.
P>100% pri nekaterih regijah je posledica štetja vseh primerov iz uradnih podatkov, kjer pa znotraj skrivajo tudi reinfekcije.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!
Pri omikronu smo šli s tem čez rob. Trenutno se kaže nekje pri 18000 testih dnevno oziroma 11500 PCR+. V drugi polovici januarja so že kar konkretni zamiki pri jemanju brisov (tudi 3-4 dni) in tudi pri obdelavi v laboratorijih (do 48 ur). Ob javljenih številkah novih primerov je zadaj še nejavljenih kar precej. Ko bomo čez vrh, se bo še nekaj dni obdelovalo za nazaj, šele potem (morda zadnje dni januarja) pa bi lahko začeli opažati padanje številk novih primerov.

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.
22.1. se že bližamo vrhu vala okužb, kar pomeni da R pada proti 1. Ker je merjen za 4 dni nazaj, bo krivulja računskega (merjenega) R na spodnjem grafu dosegla vrednost 1 4 dni po dejanskem vrhu vala.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval. Varianta omikron pa uspe v precejšnji meri zaobiti to zaščito, zato v omikron valu ta pada in je trenutno okoli 8.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 6.1.2022 je padel od 2.87 celo samo na 1.6, potem pa je zaradi tretjih odmerkov spet naraščal in je zdaj okoli 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

petek 28.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI ZELO BLIZU VRHA ALI MORDA CELO NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.14 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (9% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 24.-28.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov in ni še znakov ustavljanja rasti, a tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 32%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 13.334 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 13.323
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 74%, 65-69: 75%, 70-74: 77%, 75-79: 77%, 80-84: 77%, 85-89: 77%, 90+: 77% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 95-100/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 13/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 25 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >13.000 28.-30.1., posamezen dan lahko tudi 20.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 5.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-190 okoli 7. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200-300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala.

četrtek 27.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI ZELO BLIZU VRHA ALI MORDA CELO NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.10 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (8.4% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 24.-28.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov in ni še znakov ustavljanja rasti, a tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 23%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 12.375 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 12.368
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 83%, 65-69: 85%, 70-74: 87%, 75-79: 87%, 80-84: 87%, 85-89: 87%, 90+: 87% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 95-100/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 13/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 29 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >13.000 28.-30.1., posamezen dan lahko tudi 20.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 3.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-180 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200-300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od 25.12.2021 naprej.
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 3.2, po vrhu omikron vala pa v začetku februarja spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 70%, a se po sredini januarja postopoma vrača nazaj proti 85%. Pod P se zaenkrat prištevajo tudi reinfekcije, ki se v bistvu ne bi smele.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!
Pri omikronu smo šli s tem čez rob. Trenutno se kaže nekje pri 18000 testih dnevno oziroma 11500 PCR+. V drugi polovici januarja so že kar konkretni zamiki pri jemanju brisov (tudi 3-4 dni) in tudi pri obdelavi v laboratorijih (do 48 ur). Ob javljenih številkah novih primerov je zadaj še nejavljenih kar precej. Ko bomo čez vrh, se bo še nekaj dni obdelovalo za nazaj, šele potem (morda zadnje dni januarja) pa bi lahko začeli opažati padanje številk novih primerov.

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.
22.1. se že bližamo vrhu vala okužb, kar pomeni da R pada proti 1. Ker je merjen za 4 dni nazaj, bo krivulja računskega (merjenega) R na spodnjem grafu dosegla vrednost 1 4 dni po dejanskem vrhu vala.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval. Varianta omikron pa uspe v precejšnji meri zaobiti to zaščito, zato v omikron valu ta pada in je trenutno okoli 8.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 6.1.2022 je padel od 2.87 celo samo na 1.6, potem pa je zaradi tretjih odmerkov spet naraščal in je zdaj okoli 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

sreda 26.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI PRIBLIŽEVANJA VRHU ALI NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, ZA KATERO SE GOVORI, DA JE ŠE KUŽNEJŠA IN DA LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.12 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (8% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, usklajevanja podatkov med MZ in NIJZ ter omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-26.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov in ni še znakov ustavljanja rasti, a tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 25%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 11072 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 11058
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 91,4% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 81%, 65-69: 83%, 70-74: 85%, 75-79: 84%, 80-84: 84%, 85-89: 84%, 90+: 85% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 90/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 10/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 24 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >12.000 22.-26.1., posamezen dan lahko tudi 20.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1000 3.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-170 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200-300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala.

torek 25.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI PRIBLIŽEVANJA VRHU ALI NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, ZA KATERO SE GOVORI, DA JE ŠE KUŽNEJŠA IN DA LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.15 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (7.4% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah ali usklajevanja podatkov med MZ in NIJZ
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 27%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 11072 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 11058
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90,7% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 79%, 65-69: 81%, 70-74: 83%, 75-79: 82%, 80-84: 82%, 85-89: 82%, 90+: 83% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 85/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan (zadnje dni celo 10/dan), obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 20 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 800-1000 3.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-170 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 11500 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 3.2, po vrhu omikron vala pa v začetku februarja spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 70%, a se po sredini januarja postopoma vrača nazaj proti 85%. Pod P se zaenkrat prištevajo tudi reinfekcije, ki se v bistvu ne bi smele.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!
Pri omikronu smo šli s tem čez rob. Trenutno se kaže nekje pri 18000 testih dnevno oziroma 11500 PCR+. V drugi polovici januarja so že kar konkretni zamiki pri jemanju brisov (tudi 3-4 dni) in tudi pri obdelavi v laboratorijih (do 48 ur). Ob javljenih številkah novih primerov je zadaj še nejavljenih kar precej. Ko bomo čez vrh, se bo še nekaj dni obdelovalo za nazaj, šele potem (morda zadnje dni januarja) pa bi lahko začeli opažati padanje številk novih primerov.

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.
22.1. se že bližamo vrhu vala okužb, kar pomeni da R pada proti 1. Ker je merjen za 4 dni nazaj, bo krivulja računskega (merjenega) R na spodnjem grafu dosegla vrednost 1 4 dni po dejanskem vrhu vala.
27.1. je že postalo dokaj jasno, da 23.1. še nismo dosegli vrha vala, in to tudi ob upoštevanju zamikov pri jemanju brisov (slab dan) in poročanju rezultatov PCR (še en slab dan). V vsakem primeru pa smo zdaj res že zelo blizu vrha, teoretično pa lahko že na njem ali celo dan ali dva preko. Različica BA.2 pa zna tu podaljšati padanje z vrha, ali morda celo povišati vrh, bomo videli. Za BA.2 projekcije še niso prilagojene.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval. Varianta omikron pa uspe v precejšnji meri zaobiti to zaščito, zato v omikron valu ta pada in je trenutno okoli 8.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 6.1.2022 je padel od 2.87 celo samo na 1.6, potem pa je zaradi tretjih odmerkov spet naraščal in je zdaj okoli 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

ponedeljek 24.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI PRIBLIŽEVANJA VRHU ALI NA VRHU
R=1.20 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (7% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah ali usklajevanja podatkov med MZ in NIJZ
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 29%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 10481 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 10474
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90,2% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 77%, 65-69: 79%, 70-74: 81%, 75-79: 80%, 80-84: 80%, 85-89: 80%, 90+: 81% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 80/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan (zadnje dni celo 10/dan), obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 15 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 800-1000 3.2.2022 (razen če je vrh podcenjen)

napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 150-160 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 11500 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.

nedelja 23.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI PRIBLIŽEVANJA VRHU
R=1.25 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah ali usklajevanja podatkov med MZ in NIJZ
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 9991 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 9950
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89,9% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 75%, 65-69: 77%, 70-74: 79%, 75-79: 79%, 80-84: 79%, 85-89: 79%, 90+: 79% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 75/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan (zadnje dni celo 10/dan), obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 12 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 800-1100 3.2.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-190 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 11500 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.

sobota 22.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.30 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 33%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 8862 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 8825
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89,4% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 74%, 65-69: 75%, 70-74: 77%, 75-79: 77%, 80-84: 77%, 85-89: 77%, 90+: 77% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 75/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 11 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 3.2.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 170-200 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 11500 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 3.2, po vrhu omikron vala pa v začetku februarja spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 70%, a se po sredini januarja postopoma vrača nazaj proti 85%.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!
Pri omikronu smo šli s tem čez rob. Trenutno se kaže nekje pri 18000 testih dnevno oziroma 11500 PCR+. V drugi polovici januarja so že kar konkretni zamiki pri jemanju brisov (tudi 3-4 dni) in tudi pri obdelavi v laboratorijih (do 48 ur). Ob javljenih številkah novih primerov je zadaj še nejavljenih kar precej. Ko bomo čez vrh, se bo še nekaj dni obdelovalo za nazaj, šele potem (morda zadnje dni januarja) pa bi lahko začeli opažati padanje številk novih primerov.

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.
22.1. se že bližamo vrhu vala okužb, kar pomeni da R pada proti 1. Ker je merjen za 4 dni nazaj, bo krivulja računskega (merjenega) R na spodnjem grafu dosegla vrednost 1 4 dni po dejanskem vrhu vala.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval. Varianta omikron pa uspe v precejšnji meri zaobiti to zaščito, zato v omikron valu ta pada in je trenutno okoli 8.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 6.1.2022 je padel od 2.87 celo samo na 1.6, potem pa je zaradi tretjih odmerkov spet naraščal in je zdaj okoli 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

petek 21.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.35 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 34%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 8525 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 8489
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89,1% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 75%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 76% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 75/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 9.2 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1200 3.2.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 11500 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.

četrtek 20.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.36 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 36%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 8105 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 8068
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88,7% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 70%, 65-69: 72%, 70-74: 74%, 75-79: 74%, 80-84: 74%, 85-89: 74%, 90+: 74% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 65-70/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 5-6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 9 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1200 3.2.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1305 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 11500 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.

sreda 19.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.37 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-24.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 37%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 7614 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 7576
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88,7% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 69%, 65-69: 71%, 70-74: 73%, 75-79: 73%, 80-84: 73%, 85-89: 73%, 90+: 73% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 65/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8.8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-24.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1297 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s zgodnejšim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 11500 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4, po vrhu omikron vala pa spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja () in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 75%.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 4.1.2022 je padel od 2.87 že na 1.69 in še pada.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

torek 18.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.38 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-24.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 8000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 39%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 6919 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 6882
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88,2% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 68%, 65-69: 69%, 70-74: 71%, 75-79: 71%, 80-84: 71%, 85-89: 71%, 90+: 71% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 60-65/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8.6 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 20.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1290 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s prejšnjim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 7000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4, po vrhu omikron vala pa spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja () in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 75%.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 4.1.2022 je padel od 2.87 že na 1.69 in še pada.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

ponedeljek 17.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.40 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-23.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000-7500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 41%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 6417 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 6381
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.9% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 66%, 65-69: 67%, 70-74: 69%, 75-79: 69%, 80-84: 69%, 85-89: 69%, 90+: 70% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 55-60/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8.5 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 20.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1280 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s prejšnjim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 7000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.
Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

nedelja 16.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.42 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-22.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000-7500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 41%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 6066 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 6029
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.9% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 66%, 65-69: 67%, 70-74: 69%, 75-79: 69%, 80-84: 69%, 85-89: 69%, 90+: 69% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 60/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 20.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1273 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s prejšnjim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 7000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4, po vrhu omikron vala pa spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 75%.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

sobota 15.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.45 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-22.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 48%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 5686 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 5646
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.5% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 57%, 65-69: 59%, 70-74: 60%, 75-79: 60%, 80-84: 60%, 85-89: 60%, 90+: 61% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 50-55/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 7.5 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 20.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 15.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1100-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1260 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku glede na rezultate dosedanjih raziskav in potekov v državah s prejšnjim razvojem omikron vala. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 7000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4, po vrhu omikron vala pa spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 75%.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

petek 14.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.47 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki podira vse rekorde incidenc in je izgleda že čez vrh; trenutno najbolj raste in jih dohiteva skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-22.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 48%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 5241 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 5202
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 58%, 65-69: 59%, 70-74: 61%, 75-79: 60%, 80-84: 60%, 85-89: 60%, 90+: 61% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 50/dan, pričenja se porast sprejemov zaradi omikrona

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 7.2 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 18.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1260 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 7000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 3.5, po vrhu omikron vala pa spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja () in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 75%.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

četrtek 13.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO PREHOD IZ EKSPONENTNE V LINEARNO RAST
R=1.50 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki podira vse rekorde incidenc in je že blizu vrha; trenutno najbolj raste in jih dohiteva skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-22.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 48%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 4834 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 4796
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.0% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 57%, 65-69: 59%, 70-74: 60%, 75-79: 60%, 80-84: 60%, 85-89: 60%, 90+: 60% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 48/dan, zadnje dni nekaj porasta, verjetno še zaradi NY delte …

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 6.8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 18.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1260 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 7000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.

sreda 12.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO PREHOD IZ EKSPONENTNE V LINEARNO RAST
R=1.58 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 25.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki podira vse rekorde incidenc; trenutno najbolj raste in jih dohiteva skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že preko 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultatov žal ne objavljajo sproti dnevno
vrh primerov se kaže nekje okoli 17.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 46%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 4402 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 4367
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90.7% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 59%, 65-69: 60%, 70-74: 62%, 75-79: 62%, 80-84: 62%, 85-89: 62%, 90+: 62% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 47/dan, zadnje dni nekaj porasta, verjetno še zaradi NY delte …

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 6 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 17.-20.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1200 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1241 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 7000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT. Delno se že upošteva rezultate katarske raziskave o cca. 60% učinkovitosti prebolevnosti ter VB/Kalifornijske o 50-70% zmanjšanem deleže hospitalizacij in 75% zmanjšanem deležu ICU.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 3.5, po vrhu omikron vala pa spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja () in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 75%.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 4.1.2022 je padel od 2.87 že na 1.69 in še pada.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

torek 11.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO PREHOD IZ EKSPONENTNE V LINEARNO RAST
R=1.65 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
včeraj nerealno nizko število novih primerov (5164), pa čeprav je to absolutni rekord – to se vidi na nenaravno zlomljenih krivuljah, smo na meji testnh kapacitet
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, ki podira vse rekorde incidenc
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že preko 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 5-6000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 46%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 3923 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 3910
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 59%, 65-69: 60%, 70-74: 62%, 75-79: 61%, 80-84: 61%, 85-89: 61%, 90+: 62% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 50/dan, zadnje dni nekaj porasta, morda še zaradi delte …

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 5 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 17.-20.1., posamezen dan lahko krepko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1200 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150-155, predviden omikron vrh 200-250 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1241 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT …

ponedeljek 10.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.70 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, ki ima že rekordno incidenco
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že preko 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
že od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 34%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 3670 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 3634
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.8% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 76%, 75-79: 76%, 80-84: 76%, 85-89: 75%, 90+: 76% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 50/dan, zadnje dni nekaj porasta, morda še zaradi delte …

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 4.7 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >8000 15.-20.1., posamezen dan lahko krepko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150-155, predviden omikron vrh 250-300 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1230 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT …
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4, po vrhu omikron vala pa spet spuščan nazaj proti 2. Različica virusa omikron je bistveno znižala učinkovitost zaščite od cepljenja () in tudi prebolelosti. Trenutno je v epidemiološkem modelu aplikacije covidSLO učinkovitost zaščite C znižana za 35% njene vrednosti, učinkovitost zaščite P pa pa je znižana iz 93% na 75%.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 4.1.2022 je padel od 2.87 že na 1.69 in še pada.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

nedelja 9.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.75 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, ki ima že rekordno incidenco
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že okoli 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
že od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 3455 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 3445
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.6% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 76%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 76% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., zdaj nekje na nivoju 45-50/dan, zadnje dni nekaj porasta …

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 4.7 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >8000 15.-20.1., posamezen dan lahko krepko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1230 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT …

Ostali prikazi so na voljo v analizi prejšnjega dne.

sobota 8.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.80 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, ki ima že rekordno incidenco
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že okoli 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
že od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3095 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 3068
4/1 SLO/EU zelenih občin, 3/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.4% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 73%, 70-74: 76%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 75% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., zdaj nekje na nivoju 45/dan, zadnje dni nekaj porasta …

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 8/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 4.7 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >8000 15.-20.1., posamezen dan lahko krepko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1100 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1219 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov v EIT …
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4, po vrhu omikron vala pa spet spuščan nazaj proti 2.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.
Občine in regije po 7d incidenci primerov na 100k prebivalcev, obarvano po starem SLO barvnem semaforju …
Občine in regije po 14d incidenci primerov na 100k prebivalcev, obarvano po EU barvnem semaforju …

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 15. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 3.1.2022 je padel od 2.87 že na 2.24 in še pada, verjetno bo kmalu pod 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

petek 7.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.80 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, že jutri bo imela rekordno incidenco
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že preko 80%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
že od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2694 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 2667
3/2 SLO/EU zelenih občin, 3/2/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 71%, 65-69: 73%, 70-74: 75%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 75% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., zdaj nekje na nivoju 40-45/dan, zadnje dni nekaj porasta …

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 8/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 4.7 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >8000 15.-20.1., posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 na prehodu v februar
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1219 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000 (posivljeno). Najbolj nejasno je, koliko bo pri omikronu res manj sprejemov EIT …
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4, po vrhu omikron vala pa spet spuščan nazaj proti 2.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.
Občine in regije po 7d incidenci primerov na 100k prebivalcev, obarvano po starem SLO barvnem semaforju …
Občine in regije po 14d incidenci primerov na 100k prebivalcev, obarvano po EU barvnem semaforju …

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 15. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 3.1.2022 je padel od 2.87 že na 2.24 in še pada, verjetno bo kmalu pod 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

četrtek 6.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.75 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že preko 80%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2383 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 2361
3/1 SLO/EU zelenih občin, 3/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 71%, 65-69: 73%, 70-74: 75%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 75% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35-40/dan

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 5 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >5000 15.-20.1., posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 na prehodu v februar
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1204 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000 (posivljeno).
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.
Občine in regije po 7d incidenci primerov na 100k prebivalcev, obarvano po starem SLO barvnem semaforju …
Občine in regije po 14d incidenci primerov na 100k prebivalcev, obarvano po EU barvnem semaforju …

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji pričel s prvo okužbo, ki je bila nekje v začetku decembra. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R do sredine januarja še nekoliko narastel …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 15. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 3.1.2022 je padel od 2.87 že na 2.24 in še pada, verjetno bo kmalu pod 2.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija je bila zakrita do omikron vala.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

sreda 5.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.50 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, največ med ženskami 15-34 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že okoli 80%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2079 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 2058
4/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.8% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 76%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 76% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35/dan

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 6 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >5000 15.-20.1., posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 na prehodu v februar
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1204 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000 (posivljeno).
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

torek 4.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.40 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, največ med ženskami 15-34 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že krepko preko 50%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 33%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1764 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1747
3/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.6% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 74%, 65-69: 75%, 70-74: 78%, 75-79: 77%, 80-84: 77%, 85-89: 77%, 90+: 77% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35-40/dan

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7-8/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >5000 sredi januarja, posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 520 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 konec januarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1198 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.
Občine in regije po 7d incidenci primerov na 100k prebivalcev, obarvano po starem SLO barvnem semaforju …
Občine in regije po 14d incidenci primerov na 100k prebivalcev, obarvano po EU barvnem semaforju …

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji pričel s prvo okužbo, ki je bila nekje v začetku decembra. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R do sredine januarja še nekoliko narastel …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 15. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 3.1.2022 je padel od 2.87 že na 2.24 in še pada, verjetno bo kmalu pod 2.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija bo zdaj verjetno zakrita do 5. vala, če ta bo.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej
Situacija po starostnih skupinah:

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

ponedeljek 3.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI ŽE DOMINANTEN OD 30.12.2021!
R=1.40 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, največ med ženskami 25-34 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že krepko preko 50%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1539 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1526
6/1 SLO/EU zelenih občin, 3/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.4% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 77%, 65-69: 79%, 70-74: 82%, 75-79: 81%, 80-84: 81%, 85-89: 81%, 90+: 81% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35-40/dan

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7-8/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >5000 sredi januarja, posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 520 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-170, predviden omikron vrh 250-300 konec januarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1189 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 300

Modelska projekcija omikron vala v Sloveniji. Je veliko parametrov, ki močno vplivajo na projekcijo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000.

nedelja 2.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI ŽE DOMINANTEN!
R=1.40 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, največ med ženskami 25-34 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že krepko preko 50%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 8000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 30%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1494 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1482
6/1 SLO/EU zelenih občin, 4/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 77%, 65-69: 79%, 70-74: 81%, 75-79: 81%, 80-84: 81%, 85-89: 81%, 90+: 81% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35/dan

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >4000 sredi januarja, posamezen dan lahko preko 8000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 520 do 13.1.2021, predviden omikron vrh okoli 900 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-170, predviden omikron vrh 250-300 konec januarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1178 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 300

sobota 1.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI ŽE DOMINANTEN!
R=1.41 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že preko 50%, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(sploh ni šala)
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 8000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 30%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1471 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1458
6/1 SLO/EU zelenih občin, 4/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 78%, 65-69: 80%, 70-74: 82%, 75-79: 82%, 80-84: 82%, 85-89: 81%, 90+: 82% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35/dan

smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >4000 sredi januarja, posamezen dan lahko preko 8000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11.
, min po delta valu bo okoli 520 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-170, predviden omikron vrh 250-300 konec januarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1172 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 300

Prvi poskus projekcije omikron vala v Sloveniji. Poskus zato, ker je veliko parametrov, ki močno vplivajo, njihove dejanske vrednosti pa svet še ne pozna in so tu nastavljeni po najboljšem možnem občutku. Primeri bodo zaradi omejitev testiranja verjetno odrezani nekje okoli nivoja 4-5000.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah … Za delta val sem 27.12. v aplikaciji covidSLO znižal faktor asimtomatičnosti iz 3 na 2, in sicer postopoma pade od 1.9.2021 do 25.11.2021 iz 3 na 2, od takrat naprej pa je 2. Se pravi, na enega odkritega s testi je še en neodkrit. Za omikron je ta faktor v prvi polovici januarja postopoma povečevan iz 2 na 4.