Trendi, napovedi (arhiv november 2021)

Dobro skrit v tako gosti megli, da bi jo lahko rezali, leži mali ribnik.
Na prvi pogled je popolnoma vsakdanji. Če pa bi ga pogledali še enkrat, bi videli, da je pravljični …

Podatke pridobivam od vlade RS, MZ, NIJZ, NIB in @sledilnik.
Najlepša hvala!

arhiv analiz: oktober 2021september 2021avgust 2021julij 2021junij 2021maj 2021april 2021marec 2021februar 2021januar 2021december 2020pred decembrom 2020

Opozorilo: Vse napisano in prikazano na tej strani ter znotraj aplikacije covidSLO je plod veliko vloženega dela. Pri tem se trudim upoštevati čimveč znanstvenih dognanj in stvari predstaviti na čimbolj realen način. Je pa epidemija COVID-19 zelo kaotičen sistem, ki je odvisen od množice dejavnikov. Na svetu tako ni nikogar, ki bi lahko s 100% gotovostjo vse pravilno predvidel vnaprej, še sploh za primer Slovenije. Zato tudi jaz ne prevzemam nobene odgovornosti, če bi nekdo mojim zaključkom preveč zaupal in zaradi tega potem utrpel kakršnokoli škodo. Kot rečeno, se trudim čimbolj verno interpretirati dogajanje in pričakovanja glede epidemije v bližnji prihodnosti. Hvala za razumevanje in zaupanje!:)
avtor strani in aplikacije covidSLO: Peter Malovrh, univ. dipl. inž. el., 2020-2021

VROČE: Naloži si Windows aplikacijo covidSLO (COVID-SLOVENIJA), ki ti omogoča dinamičen pogled na epidemijo z animacijami, statistikami, HAGT kalkulatorjem, epidemiološko napovedjo, …

Časovne animacije širjenja SARS-CoV-2
Scenariji razvoja epidemije v Sloveniji

Ljudje mi znajo dati dodatno energijo:)

Moram te pohvalit, da glede na par modelov najbolj realno napoveduješ, ker zadevo gledaš najbolj celostno, z zdravo kmečko pametjo.
Hvala za pozitivno naravnane in natančne napovedi.
Pravzaprav se, gledano po posameznih dnevih, tvoja napoved za zdaj uresničuje tako dobro, da je že kičasto
Jaz vas tako rada preberem! Vse je tako simpl in realno in strokovno.
Super za trud in napovedi. Pa da vidimo kako in kaj bo.
Tako, da malo več skromnosti, več resnega dela, študiranja, analitike in manj sončenja v medijih. Tako kot dela softmarex.wordpress.com.
Hvala za vaše analize. Vedno jih z veseljem preberem, ker nudijo malo več razlage in tolažbe.
Noro, kako dobre napovedi. Ne morem verjeti da je bil res že 13.5. napisan točen datum! Bravo!!Ne vem kako nisem prej vedel za to.
Sem čakal vaše objave. Realno razmišljanje je potrebno. Ne pa pretiravanje v ekstreme kot počnejo nekateri tu gor.
Če se ne motim vas tu kar nekaj časa ni bilo na spregled – še dobro da imamo covidslo.net:)
Pa še to – pohvale za Vašo analitiko in napovedi. Super!
Hvala za to razumljivo, prepričljivo optimistično komentiranje.

Hvala za vašo požrtvovalnost, delavnost, doslednost in vztrajnost pri modeliranju epidemije!

novo 29.7.2021: Določanje skupne imunosti na osnovi števila cepljenih in ocene števila prebolelih …
novo 3.8.2021: Določanje števila neimunih po rizičnih starostnih skupinah na osnovi števila cepljenih in ocene števila prebolelih …
novo 7.8.2021: Določanje prekuženosti v aplikaciji covidSLO …

Cepivo deluje
V VB in Izraelu imajo (oktober 2021) v bolnišnicah precejšen procent oseb, ki so cepljene. A hkrati je v rizični populaciji za hospitalizacijo v teh državah velika večina ljudi cepljenih. Lepo se vidi, da je bolj varno biti med cepljenimi kot med necepljenimi – CEPIVO DELUJE.

Izračun imunih
Če poznamo delež ljudi, ki še nimajo nikakršne imunosti od prebolevanja ali/in cepljenja, še ne poznamo dejanskega deleža trenutno dovzetnih za okužbo. Zaščitenost namreč s časom slabi, in potrebno je upoštevati izmerjene faktorje trenutne dejanske zaščitenosti …

Za kontrolo predlagam obisk sorodne modelarske strani, kjer so zelo uspešno modelirali 4. (delta) val, in imajo zelo uravnotežene predloge glede načina spopadanja z epidemijo.

sreda 1.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, zdaj pada hitro, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
efekt končanja počitnic ne bo bistven, tudi zaradi PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme
vreme je oktobra pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, tudi Slovenija je že zaprla meje za potnike od tam, verjetno ga imamo tudi že mi, zaenkrat ni razlogov za kakšno paniko
R=0.73, izgledi so zelo rahlo upadanje, trenutni razpolovni čas novih primerov je 15 dni
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 13%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 23%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2072 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 2063
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 85%, 65-69: 87%, 70-74: 89%, 75-79: 89%, 80-84: 89%, 85-89: 88%; 90+: 88%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 80-85/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 20/dan, to je vrh, sedaj postopen upad.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, in glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj hitro padajo, t/2 15 dni
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in zdaj smo verjetno preko vrha 1168 23.11.

napoved ICU: očitno v skladu z napovedjo res ne bomo šli preko 300, vrh je bil izgleda 265.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), nazaj pod 200 do sredine decembra
napoved umrlih: 1300 (815 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 26. december 2021

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram dodatni zimski dvig R za 0.1 zaradi ohladitve po 26.1. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra zdaj zaradi 3. odmerkov narasla na 58%.

Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.74; b) R med 26.11. in 17.12. forsiram 0.10 navzgor; c) dosedanja prekuženost 68.8%
Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.74; b) R med 26.11. in 17.12. forsiram 0.10 navzgor; c) dosedanja prekuženost 68.8%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija hitro upada, R pada in je že v okolici 0.75 s srednjeročnimi izgledi proti 0.72.
Prekuževanje še vedno poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prehajamo sicer v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ne more prinesti, malo pa verjetno ja. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Že od 14.11. sem pisal, da sem optimist, da bo R v kratkem 0.95. Očtno sem imel glede tega dober občutek:) Potem je R hitro padel. Vse bolj realna je možnost, da bi EU-rdečo fazo dosegli že za Božič. Najslabši možni scenarij bi bil, da se to potegne še za en dodaten teden, slabše od tega pa bi si upal garantirati, da ne bo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). Prehajamo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku. Vreme tako deluje v smeri povečevanja R, a ta sila ni prav zelo močna in ni pričakovati nekega pomembnejšega dvigovanja R iz tega naslova, morda največ le zadrževanje R na nivoju okoli 0.75-0.80 za teden ali dva.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se je zaustavila, in predvidoma je bil vrh 23.11. pri 1168 hospitaliziranih.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Dnevno število smrti je proti sedanjemu vrhu postopoma naraščalo. Zdaj je vrh pri povprečnem nivoju okoli 19/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala” (pozor: po 21.11. se je edino tej skupini padanje primerov zaustavljalo, a zdaj spet pada). Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1300.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ni narastel nad 30%, kar me je rahlo presenečalo. Zdaj je spet nazaj na 30% in bomo videli … Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 8. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

sreda 1.12.2021 ob 00:45 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 2117 kod (870 manj kot prejšnji torek!), izgleda bo okoli 2250/6800 …)

Predvideno gibanje R za primer 2250 novih primerov pri 6800 PCR testih … R bi bil 0.735 z obeti proti 0.72 do sredine decembra. Razpolovna doba novih primerov je trenutno 15-16 dni. Projekcije ostajajo enake, izpolnjeni kriteriji za EU-rdečo barvno fazo se kažejo nekje okoli Božiča.

sreda 1.12.2021 ob 00:45 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 2117 kod (870 manj kot prejšnji torek!), izgleda bo okoli 2250/6800 …)

Predvideno gibanje R za primer 2250 novih primerov pri 6800 PCR testih … R bi bil 0.735 z obeti proti 0.72 do sredine decembra. Razpolovna doba novih primerov je trenutno 15-16 dni. Projekcije ostajajo enake, izpolnjeni kriteriji za EU-rdečo barvno fazo se kažejo nekje okoli Božiča.

torek 30.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, zdaj pada hitro, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
efekt končanja počitnic ne bo bistven, tudi zaradi PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme
vreme je oktobra pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, tudi Slovenija je že zaprla meje za potnike od tam, verjetno ga imamo tudi že mi, zaenkrat ni razlogov za kakšno paniko
R=0.74, izgledi so zelo rahlo upadanje, trenutni razpolovni čas novih primerov je 16 dni
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 13%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 24%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2199 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 2189
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 84%, 65-69: 86%, 70-74: 89%, 75-79: 88%, 80-84: 88%, 85-89: 88%; 90+: 88%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 92/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 20/dan, to je vrh, sedaj postopen upad.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, in glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj hitro padajo, t/2 16 dni
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in zdaj smo verjetno preko vrha 1168 23.11.

napoved ICU: očitno v skladu z napovedjo res ne bomo šli preko 300, vrh je bil izgleda 265.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), nazaj pod 200 do sredine decembra
napoved umrlih: 1400 (680 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6000
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 26. december 2021

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram dodatni zimski dvig R za 0.1 zaradi ohladitve po 26.1. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra zdaj zaradi 3. odmerkov narasla na 58%.

Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.74; b) R med 26.11. in 17.12. forsiram 0.10 navzgor; c) dosedanja prekuženost 68.8%
Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.74; b) R med 26.11. in 17.12. forsiram 0.10 navzgor; c) dosedanja prekuženost 68.8%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

Epidemija je v 4. valu približno na istem nivoju, kot je bila lani v 2. valu. Dejansko okuženih je približno enako. Je pa zdaj veliko manj hospitalizacij in smrti, kar gre pripisati cepljenju.

Primerjava nivoja epidemije s prejšnjimi valovi.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija hitro upada, R pada in je že v okolici 0.75 s srednjeročnimi izgledi proti 0.72.
Prekuževanje še vedno poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prehajamo sicer v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ne more prinesti, malo pa verjetno ja. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Že od 14.11. sem pisal, da sem optimist, da bo R v kratkem 0.95. Očtno sem imel glede tega dober občutek:) Potem je R hitro padel. Vse bolj realna je možnost, da bi EU-rdečo fazo dosegli že za Božič.
Najslabši možni scenarij bi bil, da se to potegne še za en dodaten teden, slabše od tega pa bi si upal garantirati, da ne bo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). Prehajamo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku. Vreme tako deluje v smeri povečevanja R, a ta sila ni prav zelo močna in ni pričakovati nekega pomembnejšega dvigovanja R iz tega naslova, morda največ le zadrževanje R na nivoju okoli 0.75-0.80 za teden ali dva.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se je zaustavila, in predvidoma je bil vrh 23.11. pri 1168 hospitaliziranih.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Dnevno število smrti je proti sedanjemu vrhu postopoma naraščalo. Zdaj je vrh pri povprečnem nivoju okoli 19/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala” (pozor: po 21.11. se je edino tej skupini padanje primerov zaustavljalo, a zdaj spet pada). Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1300.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ni narastel nad 30%, kar me je rahlo presenečalo. Zdaj je spet nazaj na 30% in bomo videli … Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 8. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu. Ta korelacija bo zdaj verjetno zakrita do 5. vala, če ta bo.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

Vse nižje starostne skupine imajo lepo padanje z okoli 25% tedenskimi padci novih primerov.

Situacija po starostnih skupinah:

Če pogledamo višje starostne skupine, imajo vse lepo padanje s po 25% padci tedensko.
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

torek 30.11.2021 ob 01:10 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 2189 kod (716 manj kot prejšnjo ponedeljek!), izgleda bo okoli 2550/5900 …)

Predvideno gibanje R za primer 2550 novih primerov pri 5900 PCR testih … R bi bil 0.75 z obeti proti 0.72 do sredine decembra. Razpolovna doba novih primerov je trenutno 16 dni. Projekcije ostajajo enake, izpolnjeni kriteriji za EU-rdečo barvno fazo se kažejo nekje okoli Božiča.

ponedeljek 29.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, zdaj pada hitro
efekt končanja počitnic ne bo bistven, tudi zaradi PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme
vreme je oktobra pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, tudi Slovenija je že zaprla meje za potnike od tam, verjetno jo imamo tudi že mi
R=0.75, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 13%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 24%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2329 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 2318
1/1 SLO/EU zelenih občin, 1/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 86.9% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 84%, 65-69: 86%, 70-74: 88%, 75-79: 88%, 80-84: 88%, 85-89: 88%; 90+: 87%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 92/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 20/dan, rahla rast nekje do 30.11.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, in glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj hitro padajo, t/2 17 dni
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in zdaj smo verjetno preko vrha 1168 23.11.

napoved ICU: očitno v skladu z napovedjo res ne bomo šli preko 300, vrh je bil izgleda 265.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), nazaj pod 200 do sredine decembra
napoved umrlih: 1400 (680 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6000
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 25. december 2021

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra zdaj zaradi 3. odmerkov narasla na 58%.

Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.75; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 68.5%
Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.75; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 68.5%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

Epidemija je v 4. valu približno na istem nivoju, kot je bila lani v 2. valu. Dejansko okuženih je približno enako. Je pa zdaj veliko manj hospitalizacij in smrti, kar gre pripisati cepljenju.

Primerjava nivoja epidemije s prejšnjimi valovi.
Dinamika spreminjanja primerov in incidenc.

ponedeljek 29.11.2021 ob 03:00 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 951 kod (385 manj kot prejšnjo nedeljo!), izgleda bo okoli 1000/2100 …)

Predvideno gibanje R za primer 1000 novih primerov pri 2100 PCR testih … R bi bil 0.75 z obeti proti 0.72 v nekaj dneh. Razpolovna doba novih primerov je trenutno 17 dni. Projekcije ostajajo enake, EU-rdeča barvna faza se kaže do Božiča.

nedelja 28.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, zdaj pada hitro, obeti za R <0.75
efekt končanja počitnic ne bo bistven, tudi zaradi PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme
vreme je oktobra pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, tudi Slovenija je že zaprla meje za potnike od tam
R=0.75, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 13%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 24%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2380 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 2369
1/1 SLO/EU zelenih občin, 1/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 86.8% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 84%, 65-69: 86%, 70-74: 88%, 75-79: 88%, 80-84: 88%, 85-89: 87%; 90+: 87%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 92/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 20/dan, rahla rast nekje do 30.11.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, in glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj hitro padajo, t/2 17 dni
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in zdaj smo verjetno preko vrha 1168 23.11.

napoved ICU: vrh proti koncu novembra pri okoli 290 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), nazaj pod 200 do sredine decembra
napoved umrlih: 1400 (680 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6000
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 23. december 2021

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra zdaj zaradi 3. odmerkov narasla na 58%.

Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.75; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 68.3%
Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.75; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 68.3%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

Epidemija je v 4. valu približno na istem nivoju, kot je bila lani v 2. valu. Dejansko okuženih je približno enako. Je pa zdaj veliko manj hospitalizacij in smrti, kar gre pripisati cepljenju.

Primerjava nivoja epidemije s prejšnjimi valovi.

V skupini 5-14 let je vidno zaključevanje porasta pozitivnih primerov, kar je bilo zaradi več testiranja in kot zapoznela posledica konca počitnic.

Spremembe primerov in incidenc.

nedelja 28.11.2021 ob 00:55 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 1440 kod (705 manj kot prejšnjo soboto!), izgleda bo okoli 1550/3400 …)

Predvideno gibanje R za primer 1550 novih primerov pri 3400 PCR testih … R bi bil 0.76 z obeti proti 0.72 v par dneh
Upoštevaje hipotetično število novih primerov za soboto naj bi v prihodnjih dveh mesecih epidemija padala takole. EU-rdeča tik pred Božičem. Omikron stay away!

sobota 27.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, zdaj pada hitro, obeti za R <0.75
efekt končanja počitnic ne bo bistven, tudi zaradi PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme
vreme je oktobra pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, tudi Slovenija je že zaprla meje za potnike od tam
R=0.79, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 26%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2489 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 2478
1/1 SLO/EU zelenih občin, 1/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 86.7% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 99%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 81%, 65-69: 83%, 70-74: 85%, 75-79: 84%, 80-84: 84%, 85-89: 84%; 90+: 84%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 92/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 20/dan, rahla rast nekje do 30.11.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, in glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj hitro padajo, t/2 20 dni
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in zdaj smo verjetno prko vrha 1168 23.11.

napoved ICU: vrh proti koncu novembra pri okoli 290 (ležalne dobe se daljšajo, odpusti zaostajajo), nazaj pod 200 do sredine decembra
napoved umrlih: 1400 (680 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6000
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 27. december 2021

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%.

Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.79; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 68.1%
Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.79; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 68.1%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

Epidemija je v 4. valu približno na istem nivoju, kot je bila lani v 2. valu. Dejansko okuženih je približno enako. Je pa zdaj veliko manj hospitalizacij in smrti, kar gre pripisati cepljenju.

Primerjava nivoja epidemije s prejšnjimi valovi.

V skupini 5-14 let je vidno zaključevanje porasta pozitivnih primerov, kar je bilo zaradi več testiranja in kot zapoznela posledica konca počitnic.

Spremembe primerov in incidenc.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija hitro upada, R pada in je že pod 0.80.
Prekuževanje še vedno poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prehajamo sicer v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ne more prinesti, malo pa verjetno ja. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Že od 14.11. sem pisal, da sem optimist, da bo R v kratkem 0.95. Očtno sem imel glede tega dober občutek:) Zdaj R jasno pada (to vidijo vsi) in se vidi, da zdaj gre celo proti 0.75. Očitno imamo že tisto hitrejš padanje epidemije in vse bolj realna je možnost, da bi EU-rdečo fazo dosegli že med novoletnimi prazniki. Najslabši možni scenarij bi bil, da se to potegne še za en dodaten teden, slabše od tega pa bi si upal garantirati, da ne bo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). Prehajamo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku. Vreme tako deluje v smeri povečevanja R, a ta sila ni prav zelo močna in ni pričakovati nekega pomembnejšega dvigovanja R iz tega naslova, morda največ le zadrževanje R na nivoju okoli 0.75-0.80 za teden ali dva.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se je zaustavila, in predvidoma je bil vrh 23.11. pri 1168 hospitaliziranih.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije konec oktobra in v začetku novembra se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja okoli 22/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala” (pozor: po 21.11. se edino tej skupini padanje primerov zaustavlja). Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ni narastel nad 30%, kar me je rahlo presenečalo. Zdaj je spet nazaj na 30% in bomo videli … Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša le okoli 7. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu (verjetno začasno). Ta korelacija je sicer še vedno lepo vidna, če odmislimo OK in GŠ regijo, ki sta izgleda že opravili s 4. valom.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

Rast v skupini 5-14 let se je že izpela. Vse nižje starostne skupine imajo lepo padanje z okoli 20% tedenskimi padci novih primerov.

Situacija po starostnih skupinah:

Če pogledamo višje starostne skupine, imajo vse lepo padanje s po 20% padci tedensko. Edino 85+ ima nekaj porasta, ampak to je pri nizkih incidencah in nič ne pomeni.
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

sobota 27.11.2021 ob 01:15 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 2031 kod (950 manj kot prejšnji petek!), izgleda bo okoli 2200/5500 …)

Predvideno gibanje R za primer 2200 novih primerov pri 5500 PCR testih … R bi bil 0.79 z obeti proti 0.75 v par dneh
Upoštevaje hipotetično število novih primerov za petek naj bi v prihodnjih dveh mesecih epidemija padala takole. EU-rdeča za Božič. Omikron stay away!

petek 26.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, zdaj pada hitro, obeti za R okoli 0.75
efekt končanja počitnic ne bo bistven, tudi zaradi PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme
vreme je oktobra pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
R=0.81, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 13%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 26%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2798 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 2786
2/2 SLO/EU zelenih občin, 2/2/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 86.5% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 99%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 81%, 65-69: 82%, 70-74: 84%, 75-79: 84%, 80-84: 84%, 85-89: 84%; 90+: 83%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 95/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 20/dan, rahla rast nekje do 30.11.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, in glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj hitro padajo, t/2 23 dni
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in zdaj smo verjetno prko vrha 1168 23.11.

napoved ICU: vrh proti koncu novembra pri okoli 290 (ležalne dobe se daljšajo, odpusti zaostajajo), nazaj pod 200 do sredine decembra ali Božiča
napoved umrlih: 1500 (680 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 28. december 2021

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%.

Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.81; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 67.8%
Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.81; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 67.8%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

Epidemija je v 4. valu približno na istem nivoju, kot je bila lani v 2. valu. Dejansko okuženih je približno enako. Je pa zdaj veliko manj hospitalizacij in smrti, kar gre pripisati cepljenju.

Primerjava nivoja epidemije s prejšnjimi valovi.

V skupini 5-14 let je vidno zaključevanje porasta pozitivnih primerov, kar je bilo zaradi več testiranja in kot zapoznela posledica konca počitnic.

Spremembe primerov in incidenc.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija hitro upada, R pada in je že v okolici 0.80.
Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prehajamo sicer v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ne more prinesti, malo pa verjetno ja. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Že od 14.11. sem pisal, da sem optimist, da bo R v kratkem 0.95. Očtno sem imel glede tega dober občutek:) Zdaj R jasno pada (to vidijo vsi) in se vidi, da zdaj gre celo proti 0.75. Očitno smo že pričeli s hitrejšim padanjem epidemije in vse bolj realna je možnost, da bi EU-rdečo fazo dosegli že med novoletnimi prazniki. Sicer smo s tem rokom še vedno nekje na začetku januarja. Najslabši možni scenarij bi bil, da se to potegne še za en dodaten teden, slabše od tega pa bi si upal garantirati, da ne bo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). Prehajamo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku. Vreme tako deluje v smeri povečevanja R, a ta sila ni prav zelo močna in ni pričakovati nekega pomembnejšega dvigovanja R iz tega naslova, morda največ le zadrževanje R na nivoju okoli 0.75-0.80 za teden ali dva.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se je zaustavila, in predvidoma je bil vrh 23.11. pri 1168 hospitaliziranih.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije konec oktobra in v začetku novembra se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja okoli 22/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala” (pozor: po 21.11. se edino tej skupini padanje primerov zaustavlja). Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

3D grafi poteka epidemije po regijah in starostnih skupinah so na voljo v analizi iz četrtka 25.11.2021.

petek 26.11.2021 ob 01:20 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 1888 kod (1311 manj kot prejšnji četrtek!), izgleda bo okoli 2050/5500 …)

Predvideno gibanje R za primer 2050 novih primerov pri 5.500 PCR testih … R bi bil 0.80 z obeti proti 0.70-0.75 v par dneh

četrtek 25.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, zdaj pada hitro, obeti za R okoli 0.80
efekt končanja počitnic ne bo bistven, tudi zaradi PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme
vreme je oktobra pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
R=0.87, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 14%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 26%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2798 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 2786
2/2 SLO/EU zelenih občin, 2/2/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 86.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 99%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 80%, 65-69: 82%, 70-74: 84%, 75-79: 84%, 80-84: 84%, 85-89: 83%; 90+: 83%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 95/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 20/dan, rahla rast nekje do 7.12.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, in glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj hitro padajo
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in zdaj smo verjetno prko vrha 1168 23.11.

napoved ICU: vrh proti koncu novembra pri okoli 290 (ležalne dobe se daljšajo, odpusti zaostajajo), nazaj pod 200 do sredine decembra ali Božiča
napoved umrlih: 1500 (680 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 1. januar 2022

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%.

Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.87; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 67.5%
Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.87; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 67.5%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

Epidemija je v 4. valu približno na istem nivoju, kot je bila lani v 2. valu. Dejansko okuženih je približno enako. Je pa zdaj veliko manj hospitalizacij in smrti, kar gre pripisati cepljenju.

Primerjava nivoja epidemije s prejšnjimi valovi.

V skupini 5-14 let je vidno zaključevanje porasta pozitivnih primerov, kar je bilo zaradi več testiranja in kot zapoznela posledica konca počitnic.

Spremembe primerov in incidenc.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija hitro upada, R pada in je že v okolici 0.85.
Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prehajamo sicer v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ne more prinesti, malo pa verjetno ja. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Že od 14.11. sem pisal, da sem optimist, da bo R v kratkem 0.95. Očtno sem imel glede tega dober občutek:) Zdaj imam občutek, da bo R že v nekaj dneh v okolici 0.80. Očitno smo že pričeli s hitrejšim padanjem epidemije. V tem primeru je potem celo možnost, da bi EU-rdečo fazo dosegli že med novoletnimi prazniki. Sicer smo s tem rokom še vedno nekje na začetku januarja. Najslabši možni scenarij bi bil, da se to potegne še za en dodaten teden, slabše od tega pa bi si upal garantirati, da ne bo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). Prehajamo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku. Vreme tako deluje v smeri povečevanja R, a ta sila ni prav zelo močna in ni pričakovati nekega pomembnejšega dvigovanja R iz tega naslova, morda največ le zadrževanje R na nivoju okoli 0.80-0.85 za teden ali dva.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se zdaj zaustavlja, predvidoma smo na vrhu 24.11. pri 1165.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije konec oktobra in v začetku novembra se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja okoli 22/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu (verjetno začasno). Ta korelacija je sicer še vedno lepo vidna, če odmislimo OK in GŠ regijo, ki sta izgleda že opravili s 4. valom.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

Rast v skupini 5-14 let se je že izpela. Vse nižje starostne skupine imajo lepo padanje z okoli 20% tedenskimi padci novih primerov.

Situacija po starostnih skupinah:

Če pogledamo višje starostne skupine, imajo vse lepo padanje s po 20% padci tedensko. Edino 85+ ima nekaj porasta, ampak to je pri nizkih incidencah in nič ne pomeni.
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

četrtek 25.11.2021 ob 01:20 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 2461 kod (873 manj kot prejšnjo sredo!), izgleda bo okoli 2700/7700 …)

Predvideno gibanje R za primer 2700 novih primerov pri 7.700 PCR testih … R bi bil 0.88 z obeti proti 0.80-0.85 v par dneh

sreda 24.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasnega padanja je izgleda konec, padamo hitro
efekt končanja počitnic ne bo bistven, tudi zaradi PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
R=0.92, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 14%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 27%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3102 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3090
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 86.0% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 99%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 80%, 65-69: 82%, 70-74: 84%, 75-79: 83%, 80-84: 83%, 85-89: 83%; 90+: 83%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh in je nekje na nivoju 95/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 20/dan, rahla rast nekje do 7.12.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, in glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj hitro padajo
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno smo zdaj na vrhu pri okoli 1165 24.11.2021

napoved ICU: vrh proti koncu novembra pri okoli 290 (ležalne dobe se daljšajo, odpusti zaostajajo), nazaj pod 200 do Božiča
napoved umrlih: 1500 (680 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 7. januar 2022

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%.

Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.92; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 67.1%
Standardna projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.92; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.10 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 67.1%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

Epidemija je v 4. valu približno na istem nivoju, kot je bila lani v 2. valu. Dejansko okuženih je približno enako. Je pa zdaj veliko manj hospitalizacij in smrti, kar gre pripisati cepljenju.

Primerjava nivoja epidemije s prejšnjimi valovi.

V skupini 5-14 let je vidno zaključevanje porasta pozitivnih primerov, kar je bilo zaradi več testiranja in kot zapoznela posledica konca počitnic.

Spremembe primerov in incidenc.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija hitro upada, R pada in je že v okolici 0.90.
Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prehajamo sicer v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ne more prinesti, malo pa verjetno ja. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Že od 14.11. pišem, da sem optimist, da bo R v kratkem 0.95. Očtno sem imel glede tega dober občutek:) Zdaj imam občutek, da bo R že v nekaj dneh v okoli 0.85. Očitno smo že pričeli s hitrejšim padanjem epidemije. V tem primeru je potem celo možnost, da bi EU-rdečo fazo dosegli že med novoletnimi prazniki. Sicer smo s tem rokom še vedno nekje na začetku januarja. Najslabši možni scenarij bi bil, da se to potegne še za en dodaten teden, slabše od tega pa bi si upal garantirati, da ne bo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). Prehajamo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku. Vreme tako deluje v smeri povečevanja R, a ta sila ni prav zelo močna in ni pričakovati nekega pomembnejšega dvigovanja R iz tega naslova, morda največ le zadrževanje R na nivoju okoli 0.85 za teden ali dva.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se zdaj zaustavlja, predvidoma smo na vrhu 24.11. pri 1165.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije konec oktobra in v začetku novembra se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja okoli 22/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 9. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

sreda 24.11.2021 ob 02:10 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 2987 kod (1031 manj kot prejšnji torek!), izgleda bo okoli 3200-3600/7800 …)

Predvideno gibanje R za primer 3300 novih primerov pri 7.800 PCR testih … R bi bil 0.92 z obeti za pod 0.90 v par dneh

torek 23.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasno padanje je lahko do začetka decembra, potem hitreje
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji kot kaže izračun
od 17.11. naprej poteka redno 3x tedensko samotestiranje šolarjev, to bo tudi imelo statističen efekt na višje število pozitivnih, a to ne pomeni rasti epidemije
R=0.95, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 14%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 27%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3102 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3090
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 85.8% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 99%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 80%, 65-69: 81%, 70-74: 84%, 75-79: 83%, 80-84: 83%, 85-89: 83%; 90+: 83%
število novih sprejemov v bolnišnice ima vrh (incidence višjih st. skupin padajo!), je nekje na nivoju 100-105/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 19/dan, rahla rast nekje do 7.12.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno smo zdaj na vrhu pri okoli 1165 24.11.2021

napoved ICU: vrh proti koncu novembra pri okoli 295 (ležalne dobe se daljšajo, odpusti zaostajajo), nazaj pod 200 do Božiča
napoved umrlih: 1500 (680 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 16. januar 2022

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.95; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 66.6%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.95; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 66.6%

V skupini 5-14 let je vidno zaključevanje porasta pozitivnih primerov, kar je bilo zaradi več testiranja in kot zapoznela posledica konca počitnic.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden. Verjetno do konca meseca rahlo padanje, potem pa močnejše.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija rahlo upada, R pada in je tik pod 1. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje, po 17.11. pa tudi obvezno samotestiranje vseh ne-PC učencev v naših OŠ in SŠ.
Torej, delno se rast postopno preliva tudi v višje starostne skupine, ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prehajamo sicer v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ne more prinest, malo pa verjetno ja. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Že od 14.11. pišem, da sem optimist, da bo R v kratkem 0.95. Očtno sem imel glede tega dober občutek:) Zdaj imam občutek, da R ne bo za 2-3 tedne obstal na nivoju 0-97-0.98, ampak se mi zdi bolj verjetno, da bo do konca tedna že v bližini 0.90. Če se bo to uresničevalo, bomo lahko že razmišljali, da smo že pričeli s hitrejšim padanjem epidemije. V tem primeru je potem celo možnost, da bi EU-rdečo fazo dosegli že med novoletnimi prazniki. Sicer smo s tem rokom še vedno nekje na sredini januarja. Najslabši možni scenarij bi bil, da se to potegne še za en dodaten teden, slabše pa bi si upal garantirati, da ne bo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). Prehajamo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku. Vreme tako deluje v smeri povečevanja R, a ta sila ni prav zelo močna in ni pričakovati nekega pomembnejšega dvigovanja R iz tega naslova, morda največ le zadrževanje R na nivoju okoli 0.90 za teden ali dva.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se zdaj zaustavlja, predvidoma smo na vrhu 24.11. pri 1165.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije konec oktobra in v začetku novembra se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja okoli 22/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 9. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

torek 23.11.2021 ob 02:25 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 2905 kod (350 manj kot prejšnji ponedeljek!), izgleda bo okoli 3400/7200 …)

Aplikacija covidSLO takoj po objavi podatka o izdanih TAN kodah v prejšnjem dnevu ob zagonu prikaže to v osnovnem oknu.
Predvideno gibanje R za primer 13400 novih primerov pri 7.200 PCR testih … R bi bil 0.95 z obeti proti 0.90 v par dneh

ponedeljek 22.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasno padanje je lahko do začetka decembra, potem hitreje
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji kot kaže izračun
od 17.11. naprej poteka redno 3x tedensko samotestiranje šolarjev, to bo tudi imelo statističen efekt na višje število pozitivnih, a to ne pomeni rasti epidemije
R=0.96, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 14%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 27%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3155 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3143
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 85.6% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 99%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 79%, 65-69: 81%, 70-74: 83%, 75-79: 83%, 80-84: 83%, 85-89: 82%; 90+: 82%
število novih sprejemov v bolnišnice ima vrh (incidence višjih st. skupin padajo!), je nekje na nivoju 100-105/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 19/dan, rahla rast nekje do 7.12.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1165 24.11.2021

napoved ICU: vrh proti koncu novembra pri okoli 275 (odpusti zaostajajo), nazaj pod 200 do Božiča
napoved umrlih: 1500 (680 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 16. januar 2022

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.96; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 66.2%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.96; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 66.2%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

V skupini 5-14 let je vidno zaključevanje porasta pozitivnih primerov, kar je bilo zaradi več testiranja in kot zapoznela posledica konca počitnic.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden. Verjetno do konca meseca rahlo padanje, potem pa močnejše.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija rahlo upada, R pada in je tik pod 1. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje, po 17.11. pa tudi obvezno samotestiranje vseh ne-PC učencev v naših OŠ in SŠ.
Torej, delno se rast postopno preliva tudi v višje starostne skupine, ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prehajamo sicer v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ne more prinest, malo pa verjetno ja. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Že od 14.11. pišem, da sem optimist, da bo R v kratkem 0.95. Očtno sem imel glede tega dober občutek:) Zdaj imam občutek, da R ne bo za 2-3 tedne obstal na nivoju 0-97-0.98, ampak se mi zdi bolj verjetno, da bo do konca tedna že v bližini 0.90. Če se bo to uresničevalo, bomo lahko že razmišljali, da smo že pričeli s hitrejšim padanjem epidemije. V tem primeru je potem celo možnost, da bi EU-rdečo fazo dosegli že med novoletnimi prazniki. Sicer smo s tem rokom še vedno nekje na sredini januarja. Najslabši možni scenarij bi bil, da se to potegne še za en dodaten teden, slabše pa bi si upal garantirati, da ne bo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). Prehajamo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi bo ostajalo v zraku. Vreme tako deluje v smeri povečevanja R, a ta sila ni prav zelo močna in ni pričakovati nekega pomembnejšega dvigovanja R iz tega naslova, morda največ le zadrževanje R na nivoju okoli 0.95 za teden ali dva.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se zdaj zaustavlja, šle bodo verjetno vsaj do 1140.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije konec oktobra in v začetku novembra se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja okoli 22/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 9. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

3D grafi poteka epidemije po regijah in starostnih skupinah so na voljo v analizi iz sobote 20.11.2021. Tu zdaj dajem le osnovna dva:

PD, PS in JV regije še nekaj oklevajo …
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej. Okuženih v rizičnih višjih starostnih skupinah je vse manj.

ponedeljek 22.11.2021 ob 01:30 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 1336 kod (418 manj kot prejšnjo soboto!), izgleda bo okoli 1400/2700 …)

Predvideno gibanje R za primer 1.400 novih primerov pri 2.700 PCR testih … R bi bil 0.96 z obeti proti 0.93

nedelja 21.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasno padanje je lahko do začetka decembra, potem hitreje
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji kot kaže izračun
od 17.11. naprej poteka redno 3x tedensko samotestiranje šolarjev, to bo tudi imelo statističen efekt na višje število pozitivnih, a to ne pomeni rasti epidemije
R=0.97, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 15%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 27%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3216 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3203
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 85.5% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 99%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 79%, 65-69: 81%, 70-74: 83%, 75-79: 83%, 80-84: 83%, 85-89: 83%; 90+: 82%
število novih sprejemov v bolnišnice ima vrh (incidence višjih st. skupin padajo!), je nekje na nivoju 105/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 19/dan, rahla rast nekje do 7.12.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1150 26.11.2021

napoved ICU: vrh proti koncu novembra pri okoli 265, nazaj pod 200 do Božiča
napoved umrlih: 1500 (597 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 16. januar 2022

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.97; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 66.0%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.97; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 66.0%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

V skupini 5-14 let je viden porast pozitivnih primerov, več testiranja in zapoznela posledica konca počitnic. Rast ima tudi regija PD.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden. Verjetno do konca meseca rahlo padanje, potem pa močnejše.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija rahlo upada, R pada in je tik pod 1. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje, po 17.11. pa tudi obvezno samotestiranje vseh ne-PC učencev v naših OŠ in SŠ.
Torej, delno se rast postopno preliva tudi v višje starostne skupine, ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil, tudi vreme za naslednji teden dni ne kaže kakšnega posebnega vpliva na R. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R. Sem optimist, da bo R v kratkem 0.95, nekatere starostne skupine imajo že takega.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). V zadnjem času ni bilo nekih drastičnih sprememb temperature in vlage, zato v naslednjem tednu ni pričakovati večjih sprememb R iz tega naslova.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se zdaj zaustavlja, šle bodo verjetno vsaj do 1140.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije konec oktobra in v začetku novembra se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja okoli 22/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 9. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

nedelja 21.11.2021 ob 00:42 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 2146 kod (157 manj kot prejšnjo soboto!), izgleda bo okoli 2200/5000 …)

Predvideno gibanje R za primer 2.200 novih primerov pri 5.000 PCR testih … R bi bil 0.97 z obeti proti 0.95

3D grafi poteka epidemije po regijah in starostnih skupinah so na voljo v analizi iz sobote 20.11.2021.

sobota 20.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasno padanje je lahko do začetka decembra, potem hitreje
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji kot kaže izračun
od 17.11. naprej poteka redno 3x tedensko samotestiranje šolarjev, to bo tudi imelo statističen efekt na višje število pozitivnih, a to ne pomeni rasti epidemije
R=0.98, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 15%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 27%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3233 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3221
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 85.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 99%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 79%, 65-69: 81%, 70-74: 83%, 75-79: 82%, 80-84: 82%, 85-89: 82%; 90+: 82%
število novih sprejemov v bolnišnice ima vrh (incidence višjih st. skupin padajo!), je nekje na nivoju 110/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 19/dan, rahla rast nekje do 7.12.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1150 26.11.2021

napoved ICU: vrh proti koncu novembra pri okoli 255, nazaj pod 200 do Božiča
napoved umrlih: 1500 (597 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 16. januar 2022

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.98; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 65.6%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.98; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 65.6%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

V skupini 5-14 let je viden porast pozitivnih primerov, več testiranja in zapoznela posledica konca počitnic. Rast ima tudi regija PD.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden. Verjetno do konca meseca rahlo padanje, potem pa bolj zares.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija rahlo upada, R pada in je tik pod 1. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje, po 17.11. pa tudi obvezno samotestiranje vseh ne-PC učencev v naših OŠ in SŠ.
Torej, delno se bo rast postopno prelila tudi v višje starostne skupine (malo se že), ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil, tudi vreme za naslednji teden dni ne kaže kakšnega posebnega vpliva na R. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R. Sem optimist, da bo R v kratkem 0.95, nekatere starostne skupine imajo že takega.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano). V zadnjem času ni bilo nekih drastičnih sprememb temperature in vlage, zato v naslednjem tednu ni pričakovati večjih sprememb R iz tega naslova.

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije so po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščale, rast se zdaj zaustavlja, šle bodo verjetno vsaj do 1140.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja okoli 25/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 9. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu (verjetno začasno). Ta korelacija je sicer še vedno lepo vidna, če odmislimo OK regijo, ki je izgleda že opravila s 4. valom.
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

Skupina 85+ nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja.
Skupina 5-14 let je z nekaj časovnega zamika po koncu počitnic ter zaradi množičnega samotestiranja izskočila z incidenco. Zdaj se to postopoma že preliva tudi v druge skupine, a jim incidence še kljub temu padajo.

Situacija po starostnih skupinah:

Če pogledamo skupino 5-14 let in jo primerjamo s preostalimi skupaj, vidimo, da ostale že lepo padajo. Lahko bi rekli, da je naš pravi trenutni R blizu teh 0.92.

Situacija po starostnih skupinah:

Če pogledamo višje starostne skupine, imajo vse razen 45-54 let že padanje …

Situacija po starostnih skupinah:

Če primerjamo skupino 45-54 let in jo primerjamo s preostalimi višjimi skupinami skupaj (55+), vidimo, da ostale padajo. Vse to se tudi lepo vidi na 3D grafih v nadaljevanju.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

sobota 20.11.2021 ob 04:30 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 2981 kod (273 manj kot prejšnji petek!), izgleda bo okoli 3400/7700 …)

Predvideno gibanje R za primer 3.400 novih primerov pri 7.700 PCR testih … R bi bil 0.98 z obeti proti 0.95

petek 19.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasno padanje je lahko do začetka decembra, potem hitreje
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso kaj dosti v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji kot kaže izračun
od 17.11. naprej poteka redno 3x tedensko samotestiranje šolarjev, to bo tudi imelo statističen efekt na višje število pozitivnih, a to ne pomeni rasti epidemije
nekaj več primerov v zadnjem času v starostni skupini 5-14 let ter OS in PD regiji
R=0.99, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 15%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 28%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3295 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3282
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 85.0% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 98%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 79%, 65-69: 80%, 70-74: 83%, 75-79: 82%, 80-84: 82%, 85-89: 82%; 90+: 82%
število novih sprejemov v bolnišnice ima vrh (incidence višjih st. skupin padajo!), je nekje na nivoju 110/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 19/dan, rahla rast nekje do 7.12.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021, zaradi povečanega obsega HAT gremo lahko čez
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1160 25.11.2021

napoved ICU: vrh konec novembra pri okoli 265, nazaj pod 200 do Božiča
napoved umrlih: 1500 (597 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 17. januar 2022

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.99; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 65.2%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=0.99; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 65.2%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

V skupini 5-14 let je viden porast pozitivnih primerov, več testiranja in zapoznela posledica konca počitnic. Rast ima tudi regija PD.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden. Verjetno do konca meseca rahlo padanje, potem pa bolj zares.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada in je v bližini 1. Ker ga merimo za teden dni nazaj, imamo trenutno že rahlo padajočo epidemijo. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje, po 17.11. pa tudi obvezno samotestiranje vseh ne-PC učencev v naših OŠ in SŠ.
Torej, delno se bo rast postopno prelila tudi v višje starostne skupine (malo se že), ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil, tudi vreme za naslednji teden dni ne kaže kakšnega posebnega vpliva na R. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R. Sem optimist, da bo R v kratkem 0.95, nekatere starostne skupine imajo že takega.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1160.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja okoli 25/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 9. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu (verjetno začasno).
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

Skupina 85+ nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja.
Skupina 5-14 let je z nekaj časovnega zamika po koncu počitnic ter zaradi množičnega samotestiranja izskočila z incidenco. Zdaj se to postopoma že preliva tudi v druge skupine, a jim incidence še kljub temu padajo.

Situacija po starostnih skupinah:

Če pogledamo skupino 5-14 let in jo primerjamo s preostalimi skupaj, vidimo, da ostale že padajo …

Situacija po starostnih skupinah:

Če pogledamo višje starostne skupine, imajo vse razen 45-54 let že padanje …

Situacija po starostnih skupinah:

Če primerjamo skupino 45-54 let in jo primerjamo s preostalimi višjimi skupinami skupaj (55+), vidimo, da ostale padajo. Vse to se tudi lepo vidi na 3D grafih v nadaljevanju.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

četrtek 18.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasno padanje je lahko do začetka decembra
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji kot kaže izračun
od 17.11. naprej poteka redno 3x tedensko samotestiranje šolarjev, to bo tudi imelo statističen efekt na višje število pozitivnih, a to ne pomeni rasti epidemije
nekaj več primerov v zadnjem času v starostni skupini 5-14 let ter OS in PD regiji
R=1.00, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 15%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 29%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3283 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3269
2/0 SLO/EU zelenih občin, 2/0/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 84.7% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 98%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 78%, 65-69: 80%, 70-74: 82%, 75-79: 82%, 80-84: 82%, 85-89: 81%; 90+: 81%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se upočasnjuje (incidence višjih st. skupin padajo!), je nekje na nivoju 110/dan, vrh sprejemov je že ali bo v par dneh

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 18/dan, rahla rast do konca novembra
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021, zaradi povečanega obsega HAT gremo lahko čez
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1160 26.11.2021

napoved ICU: vrh konec novembra pri okoli 270, pod 200 do Božiča
napoved umrlih: 1500 (575 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 17. januar 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Situacija po starostnih skupinah: incidence v višjih starostnih skupinah padajo, sprejemi v bolnišnice se morajo pričeti zmanjševati.
Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.00; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 64.7%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.00; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 64.7%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

V skupini 5-14 let je viden porast okužb, zapoznela posledica konca počitnic. Rast pospešuje tudi regija PD.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada in je v bližini 1. Ker ga merimo za teden dni nazaj, imamo trenutno že rahlo padajočo epidemijo. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje, po 17.11. pa tudi obvezno samotestiranje vseh ne-PC učencev v naših OŠ in SŠ.
Torej, delno se bo rast postopno prelila tudi v višje starostne skupine (malo se že), ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil, tudi vreme za naslednji teden dni ne kaže kakšnega posebnega vpliva na R. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R. Sem optimist, da bo R v kratkem 0.95.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1160.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja 20-30/dan, zaradi težkih razmer v bolnišnicah verjetno lahko tudi nekaj čez. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, verjetno okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 9. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

Glede razvoja epidemije v regijah in starostnih skupinah se v zadnjem dnevu ni nič posebnega zgodilo, zato predlagam ogled živopisnih in celo 3D grafov v analizi iz 16.11.2021.

sreda 17.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasno padanje je lahko do začetka decembra
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji kot kaže izračun
od 17.11. naprej poteka redno 3x tedensko samotestiranje šolarjev, to bo tudi imelo statističen efekt na višje število pozitivnih, a to ne pomeni rasti epidemije
nekaj več primerov v zadnjem času v starostni skupini 5-14 let ter OS in PD regiji
R=1.00, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 15%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 29%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3269 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3255
2/0 SLO/EU zelenih občin, 2/0/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 84.5% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 98%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 78%, 65-69: 80%, 70-74: 82%, 75-79: 81%, 80-84: 81%, 85-89: 81%; 90+: 81%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se upočasnjuje, je nekje na nivoju 110/dan, vrh sprejemo bo v par dneh

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 18/dan, rahla rast do konca novembra
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021, zaradi povečanega obsega HAT gremo lahko čez
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1150

napoved ICU: do sredine decembra 240-260, vrh konec novembra pri okoli 265
napoved umrlih: 1500 (515 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 20. januar 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je 50%. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.00; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 64.2%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.00; b) R med 12.11. in 3.12. forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 64.2%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

V skupini 5-14 let je viden porast okužb, zapoznela posledica konca počitnic. Rast pospešuje tudi regija PD.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada in je v bližini 1. Ker ga merimo za teden dni nazaj, imamo trenutno že rahlo padajočo epidemijo. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje, po 17.11. pa tudi obvezno samotestiranje vseh ne-PC učencev v naših OŠ in SŠ.
Torej, delno se bo rast postopno prelila tudi v višje starostne skupine (malo se že), ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil, tudi vreme za naslednji teden dni ne kaže kakšnega posebnega vpliva na R. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R. Sem optimist, da bo R v kratkem 0.95.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1150.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja 20-30/dan, zaradi težkih razmer v bolnišnicah verjetno lahko tudi nekaj čez. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, verjetno okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 9. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

Glede razvoja epidemije v regijah in starostnih skupinah se v zadnjem dnevu ni nič posebnega zgodilo, zato predlagam ogled živopisnih in celo 3D grafov v analizi iz 16.11.2021.

torek 16.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasno padanje je lahko do začetka decembra
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji kot kaže izračun
rast poganjajo starostna skupina 5-14 let ter OS in PD regiji
R=1.02, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 16%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 29%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3298 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3284
1/0 SLO/EU zelenih občin, 1/0/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 84.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 97%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska imunost starostnih skupin: 60-64: 78%, 65-69: 79%, 70-74: 81%, 75-79: 81%, 80-84: 81%, 85-89: 80%; 90+: 80%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se upočasnjuje, je nekje na nivoju 110/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 18/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021, zaradi povečanega obsega HAT gremo lahko čez
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1150

napoved ICU: cela druga polovica novembra pri okoli 240-250
napoved umrlih: 1500 (515 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 20. januar 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.02; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 63.5%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.02; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 63.5%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

Dodajam virtualni/hipotetični scenarij, ko bi se recimo do jutri zjutraj cepili vsi preostali necepljeni državljani. Precepljenost bi čez noč poskočila na 100% (drugače vemo, da se vsi itak ne morejo cepiti). Učinkovitost cepiva seveda še vedno ostane na sedanjih 50%. Smrti bi bilo 300-400 manj, v EU-rdeči pa bi bili nazaj že mesec dni prej (sredina decembra).

15.11.2021: Projekcija 100% precepljenosti čez noč iz 15.11.2021 na 16.11.2021 …

Pa še podoben virtualen scenarij, če bi se 100% precepljenost zgodila v noči na 1.9.2021. V bistvu bi se pravi 4. val pričel šele decembra, vrh bi bil v januarju, a bil bi precej nižji od našega trenutnega, in vsi parametri bi bili precej boljši.

15.11.2021: Projekcija 100% precepljenosti čez noč iz 31.8.2021 na 1.9.2021 …

V skupini 5-14 let je viden porast okužb, zapoznela posledica konca počitnic. Rast pospešujeta tudi regiji OS in PD.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada in je v bližini 1. Ker ga merimo za teden dni nazaj, imamo trenutno že rahlo padajočo epidemijo. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje.
Torej, delno se bo rast postopno prelila tudi v višje starostne skupine (malo se že), ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil, tudi vreme za naslednji teden dni ne kaže kakšnega posebnega vpliva na R. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R. Sem optimist, da bo R v kratkem 0.95.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1150.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja 20-30/dan, zaradi težkih razmer v bolnišnicah verjetno lahko tudi nekaj čez. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, verjetno okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 9. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu (verjetno začasno).
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

Skupina 85+ nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja.
Skupina 5-14 let je z nekaj časovnega zamika po koncu počitnic izskočila z incidenco, zdaj se to postopoma že preliva tudi v druge skupine.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

ponedeljek 15.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija od 6.11. naprej ni več rasla ampak počasi padala, počasno padanje je lahko do začetka decembra
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji
v nedeljo višja številka, to pripisujem povečanemu obsegu hitrega testiranja + 300 primerov viška je bilo samo v OS regiji!
R=1.01, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 16%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 30%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3239 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3224
1/0 SLO/EU zelenih občin, 1/0/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 83.7% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 97%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska imunost starostnih skupin: 60-64: 77%, 65-69: 79%, 70-74: 81%, 75-79: 80%, 80-84: 80%, 85-89: 80%; 90+: 80%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se upočasnjuje, je nekje na nivoju 110/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 18/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021, zaradi povečanega obsega HAT gremo lahko čez
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1100

napoved ICU: cela druga polovica novembra pri okoli 240-250
napoved umrlih: 1500 (515 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 20. januar 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.01; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 63.0%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.01; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 63.0%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

V skupini 5-14 let je viden porast okužb, zapoznela posledica konca počitnic.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada. Ker ga merimo za teden dni nazaj, imamo trenutno že rahlo padajočo epidemijo. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje.
Torej, delno se bo rast postopno prelila tudi v višje starostne skupine, ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil, tudi vreme za naslednji teden dni ne kaže kakšnega posebnega vpliva na R. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R. Sem optimist, da bo R v kratkem 0.95.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1100.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja 20-30/dan, zaradi težkih razmer v bolnišnicah verjetno lahko tudi nekaj čez. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, verjetno okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in zdaj znaša okoli 6-9. Kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkov je ta faktor še bistveno višji.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

nedelja 14.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija očitno ne raste več, kot kaže celo že počasi pada, počasno padanje je lahko do začetka decembra
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
od 8.11. do 13.11. se je podvojil obseg HAT, zato med pozitivnimi ranga 200 dodatnih pozitivnih, R zato v resnici nekaj nižji
R=1.00, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 16%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 30%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3162 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3148
1/0 SLO/EU zelenih občin, 1/0/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 83.7% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 97%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska imunost starostnih skupin: 60-64: 77%, 65-69: 79%, 70-74: 81%, 75-79: 80%, 80-84: 80%, 85-89: 80%; 90+: 80%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se upočasnjuje, je pa že preko 115/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 15/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1170

napoved ICU: cela druga polovica novembra pri okoli 260-270
napoved umrlih: 1500 (515 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 20. januar 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.00; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 62.8%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.00; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 62.8%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

V skupini 5-14 let je viden porast okužb, zapoznela posledica konca počitnic. Pri ostalih skupinah in veliki večini regij je viden zmaren trend k upadanju novih okužb.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden, v zadnjih dneh celo že rahlo pada.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada. Ker ga merimo za teden dni nazaj, imamo trenutno že rahlo padajočo epidemijo. Skupina 5-14 let nam zdaj pričakovano dviguje R, a umetno ga dviguje tudi podvojen obseg HAT testiranja od 8.11. dalje.
Torej, delno se bo rast postopno prelila tudi v višje starostne skupine, ampak del te rasti je umeten zaradi podvojenega obsega HAT. Prekuževanje poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil, tudi vreme za naslednji teden dni ne kaže kakšnega posebnega vpliva na R. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R. Sem optimist, da bo R v kratkem 0.95.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1160.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja 20-30/dan, zaradi težkih razmer v bolnišnicah verjetno lahko tudi nekaj čez. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, verjetno okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …
Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Ves 4. val je bila jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) so imele višje incidence (bolj desno). Od 9.11. naprej se je zaradi preloma preko vrha epidemije začela situacija obračati tudi tu (verjetno začasno).
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

Skupina 85+ nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

sobota 13.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija očitno ne raste več, morda celo že počasi pada, počasno padanje je lahko do začetka decembra
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
R=1.01, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 16%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 30%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3155 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3141
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 83.6% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 97%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska imunost starostnih skupin: 60-64: 77%, 65-69: 79%, 70-74: 81%, 75-79: 80%, 80-84: 80%, 85-89: 80%; 90+: 80%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se upočasnjuje, je pa že preko 115/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 15/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1160

napoved ICU: cela druga polovica novembra pri okoli 250-260
napoved umrlih: 1500 (493 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 20. januar 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam je R zaradi počitnic postopoma padel za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.01; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 62.4%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.01; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 62.4%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Projekcija dogajanja v EIT/EIZ/ICU …

V skupini 5-14 let je viden porast okužb, zapoznela posledica konca počitnic. Pri ostalih skupinah in veliki večini regij je viden zmaren trend k upadanju novih okužb.

Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden, v zadnjih dneh celo že rahlo pada.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada. Ker ga merimo za teden dni nazaj, imamo trenutno že rahlo padajočo epidemijo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1160.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja 20-30/dan, zaradi težkih razmer v bolnišnicah verjetno lahko tudi nekaj čez. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, verjetno okoli 1500.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ne naraste nad 30%, kar me rahlo preseneča. 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Bolj podrobna slika trenutnega dogajanja …

sobota 13.11.2021 ob 02:53 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 3254 kod, izgleda bo okoli 3700/9700 …)

Predvideno gibanje R za primer 3.700 novih primerov pri 9.700 PCR testih … R bi bil 1.01

petek 12.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija očitno ne raste več, morda celo že počasi pada, počasno padanje je lahko do začetka decembra
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, nekaj pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
R=1.02, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 17%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3154 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3140
2/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 83.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 97%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska imunost starostnih skupin: 60-64: 76%, 65-69: 78%, 70-74: 80%, 75-79: 80%, 80-84: 80%, 85-89: 79%; 90+: 79%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se upočasnjuje, je že okoli 110/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 15/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj smo izgleda če čez glavni vrh 3338 6.11.2021
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1150

napoved ICU: cela druga polovica novembra pri okoli 240-280
napoved umrlih: 1500 (474 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 20. januar 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam R zaradi počitnic postopoma pade za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.02; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 61.9%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.02; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 61.9%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden, v zadnjih dneh celo že rahlo pada.
Laboratoriji tokrat zmorejo več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada. Ker ga merimo za teden dni nazaj, imamo trenutno zelo verjetno že rahlo padajočo epidemijo.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1150.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja 20-30/dan, zaradi težkih razmer v bolnišnicah verjetno lahko tudi nekaj čez. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, verjetno okoli 1500.

petek 12.11.2021 00:55 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 3137 kod, izgleda bo okoli 3500/8700 …)

Predvideno gibanje R za primer 3.500 novih primerov pri 8.700 PCR testih … R bi bil 1.02

četrtek 11.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija raste, rast se upočasnjuje, približujemo se vrhu okužb, smo tam tam, morda bomo imeli plato do začetka decembra
odločilo bo, ali bo efekt končanja počitnic (upoštevan v projekcijah), ter koliko se bodo ljudje zdaj sami bolj zaščitno obnašali, malo pa tudi vreme
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
R=1.04, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) 17.3%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3203 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3188
2/0 SLO/EU zelenih občin, 2/0/0 občin (Kobilje, Solčava) brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 83.0% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 96%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska imunost starostnih skupin: 60-64: 76%, 65-69: 78%, 70-74: 80%, 75-79: 79%, 80-84: 79%, 85-89: 79%; 90+: 79%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se nadaljuje, je že okoli 105/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 15/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj gremo ponovno čez, verjetno še kakšen dan rasti z max 7dAvg okoli 3200-3400
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1200

napoved ICU: cela druga polovica novembra pri okoli 250-290
napoved umrlih: 1500 (430 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 20. januar 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam R zaradi počitnic postopoma pade za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.04; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 61.4%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.04; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 61.4%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Spremembe primerov in incidenc.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden, v zadnjih dneh celo že rahlo pada.
Laboratoriji bodo tokrat očitno zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada. Vprašanje je, do kam in v kolikšnem času bo uspel pasti. Če pade pod 1, bomo imeli padajočo epidemijo. Vrh kaže da bo zdaj zdaj.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1200.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja 20-30/dan, zaradi težkih razmer v bolnišnicah zelo verjetno lahko tudi nekaj čez. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, verjetno okoli 1500.

četrtek 11.11.2021 00:45 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 3390 kod, očitno bo okoli 3700/9200 …)

Predvideno gibanje R za primer 3.700 novih primerov pri 9.200 PCR testih … R bi bil 1.04

sreda 10.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija raste, rast se upočasnjuje, približujemo se vrhu okužb, še nekaj dni ali pa bomo imeli plato do začetka decembra
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega + premaknilo druženja v notranje prostore, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
R=1.06, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) 17.3%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3338 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3322 (jutri korekcija za 200 navzdol)
1/0 SLO/EU zelenih občin, 1/0/0 občin (Kobilje) brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 82.7% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 96%, 65-69: 99%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska imunost starostnih skupin: 60-64: 76%, 65-69: 77%, 70-74: 80%, 75-79: 79%, 80-84: 79%, 85-89: 79%; 90+: 78%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se nadaljuje, je že okoli 105/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 15/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj gremo ponovno čez, verjetno še kakšen dan rasti z max 7dAvg okoli 3200-3500
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1200-1300

napoved ICU: cela druga polovica novembra pri okoli 265
napoved umrlih: 1500 (430 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 20. januar 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam R zaradi počitnic postopoma pade za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.20 in potem še njegov padec nazaj za 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.06; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 60.9%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.06; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 60.9%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 50%
Spremembe primerov in incidenc.
Takole izgledajo občine in regije po 14d/100k incidenci.
Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po 7d/100k incidenci.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden, v zadnjih dneh celo že rahlo pada.
Laboratoriji bodo tokrat očitno zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada. Vprašanje je, do kam in v kolikšnem času bo uspel pasti. Če pade pod 1, bomo imeli padajočo epidemijo. Upanje, da bi se to lahko zgodilo proti koncu prejšnjega tedna, in bi potem imeli padanje okužb, je žal izpuhtelo. Kot sem rekel, itak nisem bil prevelik optimist glede tega. Vrh okužb se sedaj kaže v drugem tednu novembra, model pa nakazuje na nekak plato do začetka decembra.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …

Vpliv zunanjih razmer (rumena krivulja) na R. Od nastopa delte so imele zunanje razmere majhen vpliv na gibanje reprodukcijskega števila R, zdaj imajo večjega.

Hospitalizacije po vmesnem platoju pri 400 hospitaliziranih ponovno naraščajo, šle bodo verjetno vsaj do 1250.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast ni jasen, verjetno je šlo za neko statistično prekladanje podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem.
Zaradi rasti epidemije se zdaj dviguje tudi dnevno število umrlih. Predvidevam, da na nekje največ do povprečnega nivoja 20-30/dan, zaradi težkih razmer v bolnišnicah zelo verjetno lahko tudi nekaj čez. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Število smrti med neimunimi v 4. valu so že dolgo vnaprej določene za 500-700, a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, verjetno okoli 1500.

Takole stojimo po SLO in EU barvnih fazah …
Pregled po regijah
Razvoj epidemije v večjih slovenskih občinah (nad XXk prebivalcev).
Že ves 4. val je jasno izražena odvisnost incidenc regij z njihovo zaščitenostjo glede na najbolje zaščiteno regijo – slabše zaščitene (spodaj) imajo višje incidence (bolj desno).
3D potek epidemije po regijah (7d/100k incidenca oziroma tedenska vsota primerov per capita) – od začetka epidemije naprej

Skupina 85+ nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja.

Situacija po starostnih skupinah:
3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka julija 2021 naprej.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

3D potek epidemije po starostnih skupinah (7d/100 incidenca) od začetka.

preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 4087 kod, očitno bo okoli 4500/10000 …)

Predvideno gibanje R za primer 4.500 novih primerov pri 10.000 PCR testih … R bi bil 1.06

Še malo sem se poigral z modelom. Kaj se recimo zgodi, če zamahnemo s čarobno paličico in cepivo popolnoma preneha učinkovati? In kaj če obratno cepljenje in prebolelost zdajle pričneta učinkovati 100%?

Kaj se zgodi, če pritisnemo čarobni gumb in cepivo naenkrat preneha učinkovati … sledilo bi preko 600 ICU in 3000 sočasnih hospitalizacij, 3000 smrti v 4. valu
Kaj pa, če naenkrat cepljenje in prebolelost začneta učinkovati 100% … konec vala do Božiča.

torek 9.11.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija raste, rast se upočasnjuje, približujemo se vrhu okužb, še nekaj dni ali pa bomo imeli plato do začetka decembra
vreme je pokazalo veliko več moči od pričakovanega, AY podvariante delte pri nas baje še niso v igri
R=1.08, vreme/šole/službe/univerze ga povečujejo, sprotna imunizacja deluje v nasprotno smer

bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) 18.7%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 33%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3191 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 3178
1/0 SLO/EU zelenih občin, 1/0/0 občin (Kobilje) brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 81.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)

P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 95%, 65-69: 98%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska imunost starostnih skupin: 60-64: 74%, 65-69: 76%, 70-74: 78%, 75-79: 78%, 80-84: 77%, 85-89: 77%; 90+: 77%
rast števila novih sprejemov v bolnišnice se nadaljuje, je že okoli 100/dan

smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 13/dan
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): imeli smo vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, zdaj gremo ponovno čez, verjetno še kakšen dan rasti z max 7dAvg okoli 3200-3500
napoved hospitaliziranih: kot kaže je imel prvi vrh plato pri dobrih 400, potem rast in verjetno bo šlo do okoli 1070

napoved ICU: cela druga polovica novembra pri okoli 235
napoved umrlih: 1500 (430 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 6100
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: konec januarja 2022
pred delto sta najbolje zaščiteni Koroška in Pomurska, najslabše Obalno-kraška (15% slabše!) … zelo v skladu s tem se v 4. valu gibajo incidence primerov!!

Imunost (I) glede na prekuženost (P) in precepljenost (C) po starostnih skupinah in regijah …

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO poskušam modelirati situacijo, ko nam R zaradi počitnic postopoma pade za neko vrednost, z zamikom dveh tednov pa se po koncu njih vrne za nekaj manjšo vrednost nazaj navzgor. Nazaj nekaj manj, ker se bo vmes bazen dovzetnih še nekoliko zmanjšal. Poleg tega modeliram tudi novoletni porast R za 0.15 in potem še njegov padec nazaj za istih 0.15. Štartam s trenutno izmerjenim R. Koliko se bo dejansko stanje v resnici ujemalo s to projekcijo, bo povedalo dejansko stanje, ne projekcija.

Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.08; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 60.2%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 48%
Rahlo optimistična projekcija – predpostavke: a) začetni R=1.08; b) R forsiram 0.22 nazaj gor; c) dosedanja prekuženost 60.2%; d) trenutna učinkovitost cepiv proti okužbam: 48%
Spremembe primerov in incidenc.
Takole izgledajo občine in regije po 14d/100k incidenci.
Takole izgledajo občine in regije po EU semaforju na bazi 14d/100k incidence.
Takole izgledajo občine in regije po 7d/100k incidenci.
Takole izgledajo občine in regije po SLO semaforju na bazi 7d/100k incidence.
Prikaz, koliko časa posamezna občina že ni imela novih primerov (črna <7 dni, modra vsaj 7/14/21 dni, bela vsaj 28 dni). Na desni seznam po dnevih.

Smo na rekordnih vrednostih novih primerov dnevno. Delež pozitivnih je že nekaj časa rekorden, v zadnjih dneh celo že rahlo pada.
Laboratoriji bodo tokrat očitno zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Tempo rasti se upočasnjuje, R pada. Vprašanje je, do kam in v kolikšnem času bo uspel pasti. Če pade pod 1, bomo imeli padajočo epidemijo. Upanje, da bi se to lahko zgodilo proti koncu prejšnjega tedna, in bi potem imeli padanje okužb, je žal izpuhtelo. Kot sem rekel, itak nisem bil prevelik optimist glede tega. Vrh okužb se sedaj kaže v drugem tednu novembra, model pa pravi da ob zelo rahli postopni rasti celo 4. decembra.

Vreme (rumena krivulja) v povprečju vse bolj deluje v smeri povečevanja R (pričakovano) …