Trendi, napovedi (arhiv januar 2022)

Dobro skrit v tako gosti megli, da bi jo lahko rezali, leži mali ribnik.
Na prvi pogled je popolnoma vsakdanji. Če pa bi ga pogledali še enkrat, bi videli, da je pravljični …

Podatke pridobivam od vlade RS, MZ, NIJZ, NIB in @sledilnik.
Najlepša hvala!

arhiv analiz: december 2021 – november 2021 – oktober 2021 – september 2021 – avgust 2021 – julij 2021 – junij 2021 – maj 2021 – april 2021 –
marec 2021 – februar 2021 – januar 2021 – december 2020 – pred decembrom 2020

Opozorilo: Vse napisano in prikazano na tej strani ter znotraj aplikacije covidSLO je plod veliko vloženega dela. Pri tem se trudim upoštevati čimveč znanstvenih dognanj in stvari predstaviti na čimbolj realen način. Je pa epidemija COVID-19 zelo kaotičen sistem, ki je odvisen od množice dejavnikov. Na svetu tako ni nikogar, ki bi lahko s 100% gotovostjo vse pravilno predvidel vnaprej, še sploh za primer Slovenije. Zato tudi jaz ne prevzemam nobene odgovornosti, če bi nekdo mojim zaključkom preveč zaupal in zaradi tega potem utrpel kakršnokoli škodo. Kot rečeno, se trudim čimbolj verno interpretirati dogajanje in pričakovanja glede epidemije v bližnji prihodnosti. Hvala za razumevanje in zaupanje!:)
avtor strani in aplikacije covidSLO: Peter Malovrh, univ. dipl. inž. el., 2020-2022

VROČE: Naloži si Windows aplikacijo covidSLO (COVID-SLOVENIJA), ki ti omogoča dinamičen pogled na epidemijo z animacijami, statistikami, HAGT kalkulatorjem, epidemiološko napovedjo, …

Časovne animacije širjenja SARS-CoV-2
Scenariji razvoja epidemije v Sloveniji

29.7.2021: Določanje skupne imunosti na osnovi števila cepljenih in ocene števila prebolelih …
3.8.2021: Določanje števila neimunih po rizičnih starostnih skupinah na osnovi števila cepljenih in ocene števila prebolelih …
7.8.2021: Določanje prekuženosti v aplikaciji covidSLO …
12.12.2021: Ocena učinkovitosti zaščite s cepljenjem ter potenciala za 5. val epidemije …

petek 4.2.2022

Povzetek dnevne analize:
SMO ŽE PREKO VRHA PRIMEROV IN SMO VERJETNO ŽE NA VRHU SPREJEMOV V BOLNIŠNICE, VRH HOSPITALIZACIJ VERJETNO V NEDELJO
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO MARCA DELNO RAZŠIRI TA VAL EPIDEMIJE
zaradi spremembe metodologije testiranja (zadostuje HAT+) za 1.2. in 2.2. nerealno višja številka pozitivnih (skoraj seštevek dveh dni)
R=0.96 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov in sprememb metodologije testiranja natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorcev (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se je izboljševalo, zdaj že realni
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.5% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, zdaj pa še okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas omikrona že nekaj časa preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi, zdaj baje 2x)
vrh primerov se kaže da je bil nekje okoli 26.-30.1.2022, dosegli smo tudi 17.000 dnevnih primerov, bolj natančno bom vrh definiral do 7.1., ker je treba upoštevati spremembo metodologije testiranja in zamike
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 14.630 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.381
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 76%, 65-69: 77%, 70-74: 79%, 75-79: 79%, 80-84: 79%, 85-89: 79%, 90+: 79% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 96/dan, od 3.2. se ne šteje več rdečih con v ne-covid oddelkih, kjer so samo v izolaciji
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 15/dan (pri precej ni vzrok covid), obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max (realno) dnevno povprečje je bilo 14.056 27.1., razpolovitev primerov se predvideva v 13 dneh
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 800 7.2.2022, BA.2 ga ne more povišati, od 3.2. ne-covid izolacijske rdeče cone niso več vštete
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu je bil okoli 150, omikron vrh je odpadel, omikon v EIT spravi 10x manjši delež okuženih od delte
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, spremljajoča covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

četrtek 3.2.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI IMA TRENUTNO VRH, OZIROMA SMO VERJETNO ŽE PAR DNI PREKO
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO DELNO RAZŠIRI 5. VAL EPIDEMIJE
zaradi spremembe metodologije testiranja (zadostuje HAT+) za 1.2. in 2.2. nerealno višja številka pozitivnih (skoraj seštevek dveh dni)
R=0.98 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorcev (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se izboljšuje, zdaj višji od realnih
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.5% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas omikrona že nekaj časa preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže da je bil nekje okoli 26.-30.1.2022, dosegli smo tudi 17.000 dnevnih primerov, bolj natančno bom vrh definiral do 7.1., ker je treba upoštevati spremembo metodologije testiranja in zamike
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 15.140 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 15.111
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 75%, 65-69: 77%, 70-74: 78%, 75-79: 78%, 80-84: 78%, 85-89: 78%, 90+: 79% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 115/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 12/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max (realno) dnevno povprečje je bilo 14.056 27.1., razpolovitev primerov se predvideva v 13 dneh
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1100 9.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu je bil okoli 150, omikron vrh je odpadel
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, spremljajoča covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

sreda 2.2.2022

Javljenih je bilo 23.429 potrjeno pozitivnih, pri opravljenih 17.143 PCR testih in 96.160 HAT.
Metodologija je sedaj spremenjena. Veliko ljudi se namesto na PCR pošlje na HAT, in HAT+ že pomeni potrjeno okužbo, ni več potrjevanja s PCR.
Potrjevanje s PCR je vzelo nekaj časa, tipično 1-2 dneva. Rezultati teh PCR testov so bili tako sporočani z omenjenim časovnim zamikom.
Tako smo tudi za včerajšnji dan prejeli rezultate PCR vzorcev od prej, dodatno pa še vse HAT+ od včeraj. Pri teh HAT+ ni omenjenega časovnega zamika poročanja. Zaradi prehodnega pojava iz naslova spremenjene metodologije smo tako za torek 1.2. prejeli precej višjo številko potrjeno pozitivnih, kot bi jo pri nespremenjeni metodologiji. Ta višja številka tako sama po sebi ne pomeni nikakršnega znaka naraščajoče epidemije.
Omenjeni efekt spremembe metodologije bo verjetno delno opazen samo še na podatkih za sredo 2.2., potem pa bomo že dobivali sprotne regularne številke. Dejansko bodo te potem bolj ažurne. Efekt prehoda na večjo ažurnost pa lahko ponazorim na primeru pošte: prijatelju pošlješ vsak dan eno pismo. Pošta ga dostavi v treh dneh. Prijatelj vsak dan dobi eno pismo. Potem pošta pohitri dostavo in skrajša dostavni čas na 1 dan. Prijatelj bo takrat v istem dnevu prejel 3 pisma (analogija s 23k primeri), potem pa spet normalno po enega na dan.
Kakšen je dejanski potek epidemije lahko posredno sklepamo po sprejemih v bolnišnice, ti pa imajo enotedenski zamik. Če smo že imeli vrh okužb, bodo sprejemi prenehali naraščati do konca tega tedna.
To in več v novici na portalu n1info.si

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI IMA TRENUTNO VRH, OZIROMA SMO VERJETNO ŽE PAR DNI PREKO
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO ?POVIŠA? IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
zaradi spremembe metodologije testiranja (zadostuje HAT+) za včeraj nerealno višja številka pozitivnih (skoraj seštevek dveh dni)
R=1.00 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorcev (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se izboljšuje, zdaj višji od realnih
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.4% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas omikrona že nekaj časa preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 26.-28.1.2022, dosegli smo tudi 17.000 dnevnih primerov, bolj natančno bom vrh definiral do 7.1., ker je treba upoštevati spremembo metodologije testiranja in zamike
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 14.760 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.737
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 75%, 65-69: 76%, 70-74: 78%, 75-79: 78%, 80-84: 78%, 85-89: 78%, 90+: 79% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 110/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 11/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max (realno) dnevno povprečje je bilo 14.056 27.1., razpolovitev primerov se predvideva v 13 dneh
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1100 9.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu je bil okoli 150, omikron vrh bo izgleda 145 10. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, spremljajoča covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

torek 1.2.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI IMA TRENUTNO VRH, OZIROMA SMO VERJETNO ŽE PAR DNI PREKO
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO ?POVIŠA? IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.02 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorcev (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se izboljšuje, zdaj verjetno višji od realnih
s 1. februarjem ni več nujno PCR potrjevanje HAT+ testov, zadostuje HAT … kako bo to vplivalo na sporočene številke bomo videli že jutri
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.4% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas omikrona že nekaj časa preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 26.-28.1.2022, dosegli smo tudi 17.000 dnevnih primerov, bolj natančno bom vrh definiral do 7.1., ker je treba upoštevati spremembo metodologije testiranja in zamike
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 32%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 13.912 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 13.911
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 74%, 65-69: 75%, 70-74: 77%, 75-79: 77%, 80-84: 77%, 85-89: 77%, 90+: 78% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 105/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 11/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max dnevno povprečje je bilo 14.056 27.1., razpolovitev primerov se predvideva v 13 dneh
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 950-1000 8.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 150 okoli 10. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, zraven covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

ponedeljek 31.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI VERJETNO ŽE NA VRHU VALA ALI MALO ČEZ
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.08 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorce (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se stanje počasi izboljšuje
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.4% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 (BA.2 preko 80) mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 27.-31.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov, tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 33%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 14.056 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.055
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 73%, 65-69: 75%, 70-74: 76%, 75-79: 76%, 80-84: 76%, 85-89: 76%, 90+: 77% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 105/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 11/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 oz. t/2: -, predvideno omikron max dnevno povprečje >14.000 28.-31.1., posamezen dan lahko tudi 18.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 9.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 170 okoli 10. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, zraven covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

nedelja 30.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI VERJETNO ŽE NA VRHU VALA
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.10 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorce (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se stanje počasi izboljšuje
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (tudi 9.4% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno, pri BA.2 je to težje
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 27.-31.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov, tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 34%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 14.031 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.025
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 91% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 76%, 75-79: 76%, 80-84: 76%, 85-89: 76%, 90+: 76% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 100/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 11-12/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 29 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >14.000 28.-30.1., posamezen dan lahko tudi 18.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1000 9.2.2022 (razen če je vrh zaradi BA.2 podcenjen, potem bo več in kasneje)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160 okoli 10. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, zraven covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

sobota 29.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI ZELO BLIZU VRHA ALI MORDA CELO NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.15 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih zaradi zamikov pri odvzemu brisov (+1 dan) ter tudi pri obdelavi vzorce (+1 dan) nižji od realnih, po 25.1. se stanje počasi izboljšuje
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (9.4% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter le malo omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 27.-31.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov in ni še znakov ustavljanja rasti, a tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 14.039 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 14.070
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 91% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 71%, 65-69: 73%, 70-74: 75%, 75-79: 74%, 80-84: 74%, 85-89: 74%, 90+: 75% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 100/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 12/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 20 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >14.500 28.-30.1., posamezen dan lahko tudi 20.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 10.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več in kasneje)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-190 okoli 12. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 300-400 (to bodo večinoma smrti “s” covid, krivec osnovna bolezen, zraven covid okužba) (v prejšnjih valovih je poleg osnovne bolezni bil krivec tudi covid!)

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!
Pri omikronu smo šli s tem čez rob. Trenutno se kaže nekje pri 18000 testih dnevno oziroma 11500 PCR+. V drugi polovici januarja so že kar konkretni zamiki pri jemanju brisov (tudi 3-4 dni) in tudi pri obdelavi v laboratorijih (do 48 ur). Ob javljenih številkah novih primerov je zadaj še nejavljenih kar precej. Ko bomo čez vrh, se bo še nekaj dni obdelovalo za nazaj, šele potem (morda zadnje dni januarja) pa bi lahko začeli opažati padanje številk novih primerov.

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.
22.1. se že bližamo vrhu vala okužb, kar pomeni da R pada proti 1. Ker je merjen za 4 dni nazaj, bo krivulja računskega (merjenega) R na spodnjem grafu dosegla vrednost 1 4 dni po dejanskem vrhu vala.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval. Varianta omikron pa uspe v precejšnji meri zaobiti to zaščito, zato v omikron valu ta pada in je trenutno okoli 8.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 6.1.2022 je padel od 2.87 celo samo na 1.6, potem pa je zaradi tretjih odmerkov spet naraščal in je zdaj okoli 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla …

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

petek 28.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI ZELO BLIZU VRHA ALI MORDA CELO NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.14 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (9% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 24.-28.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov in ni še znakov ustavljanja rasti, a tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 32%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 13.334 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 13.323
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 74%, 65-69: 75%, 70-74: 77%, 75-79: 77%, 80-84: 77%, 85-89: 77%, 90+: 77% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 95-100/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 13/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 25 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >13.000 28.-30.1., posamezen dan lahko tudi 20.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 5.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-190 okoli 7. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200-300

četrtek 27.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI ZELO BLIZU VRHA ALI MORDA CELO NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, KI JE ŠE KUŽNEJŠA IN LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.10 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (8.4% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, povišanih smrti v DSO ter omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 24.-28.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov in ni še znakov ustavljanja rasti, a tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 8%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 23%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 12.375 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 12.368
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 92% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 83%, 65-69: 85%, 70-74: 87%, 75-79: 87%, 80-84: 87%, 85-89: 87%, 90+: 87% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 95-100/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 13/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 29 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >13.000 28.-30.1., posamezen dan lahko tudi 20.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 3.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-180 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200-300

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!
Pri omikronu smo šli s tem čez rob. Trenutno se kaže nekje pri 18000 testih dnevno oziroma 11500 PCR+. V drugi polovici januarja so že kar konkretni zamiki pri jemanju brisov (tudi 3-4 dni) in tudi pri obdelavi v laboratorijih (do 48 ur). Ob javljenih številkah novih primerov je zadaj še nejavljenih kar precej. Ko bomo čez vrh, se bo še nekaj dni obdelovalo za nazaj, šele potem (morda zadnje dni januarja) pa bi lahko začeli opažati padanje številk novih primerov.

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.
22.1. se že bližamo vrhu vala okužb, kar pomeni da R pada proti 1. Ker je merjen za 4 dni nazaj, bo krivulja računskega (merjenega) R na spodnjem grafu dosegla vrednost 1 4 dni po dejanskem vrhu vala.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval. Varianta omikron pa uspe v precejšnji meri zaobiti to zaščito, zato v omikron valu ta pada in je trenutno okoli 8.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 6.1.2022 je padel od 2.87 celo samo na 1.6, potem pa je zaradi tretjih odmerkov spet naraščal in je zdaj okoli 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla …

sreda 26.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI PRIBLIŽEVANJA VRHU ALI NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, ZA KATERO SE GOVORI, DA JE ŠE KUŽNEJŠA IN DA LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.12 (izmerjeno za 4 dni nazaj, zaradi zamikov natančna določitev ni možna)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (8% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah, usklajevanja podatkov med MZ in NIJZ ter omikrona
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-26.1.2022, izgleda visok, dosegli smo že 17.000 dnevnih primerov in ni še znakov ustavljanja rasti, a tu so zamiki …
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 25%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 11072 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 11058
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 91,4% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 81%, 65-69: 83%, 70-74: 85%, 75-79: 84%, 80-84: 84%, 85-89: 84%, 90+: 85% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 90/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 10/dan, obeta se malo porasta (za vse ni vzrok covid) v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 24 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >12.000 22.-26.1., posamezen dan lahko tudi 20.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1000 3.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-170 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200-300

torek 25.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI PRIBLIŽEVANJA VRHU ALI NA VRHU
V IGRI JE OMIKRON PODVARIANTA BA.2, ZA KATERO SE GOVORI, DA JE ŠE KUŽNEJŠA IN DA LAHKO POVIŠA IN RAZŠIRI VRH EPIDEMIJE
R=1.15 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (7.4% potrjeno okuženih v zadnjih 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah ali usklajevanja podatkov med MZ in NIJZ
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 27%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 11072 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 11058
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90,7% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 79%, 65-69: 81%, 70-74: 83%, 75-79: 82%, 80-84: 82%, 85-89: 82%, 90+: 83% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 85/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan (zadnje dni celo 10/dan), obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 20 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 800-1000 3.2.2022 (razen če je vrh podcenjen, potem bo več)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-170 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!
Pri omikronu smo šli s tem čez rob. Trenutno se kaže nekje pri 18000 testih dnevno oziroma 11500 PCR+. V drugi polovici januarja so že kar konkretni zamiki pri jemanju brisov (tudi 3-4 dni) in tudi pri obdelavi v laboratorijih (do 48 ur). Ob javljenih številkah novih primerov je zadaj še nejavljenih kar precej. Ko bomo čez vrh, se bo še nekaj dni obdelovalo za nazaj, šele potem (morda zadnje dni januarja) pa bi lahko začeli opažati padanje številk novih primerov.

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.
22.1. se že bližamo vrhu vala okužb, kar pomeni da R pada proti 1. Ker je merjen za 4 dni nazaj, bo krivulja računskega (merjenega) R na spodnjem grafu dosegla vrednost 1 4 dni po dejanskem vrhu vala.
27.1. je že postalo dokaj jasno, da 23.1. še nismo dosegli vrha vala, in to tudi ob upoštevanju zamikov pri jemanju brisov (slab dan) in poročanju rezultatov PCR (še en slab dan). V vsakem primeru pa smo zdaj res že zelo blizu vrha, teoretično pa lahko že na njem ali celo dan ali dva preko. Različica BA.2 pa zna tu podaljšati padanje z vrha, ali morda celo povišati vrh, bomo videli. Za BA.2 projekcije še niso prilagojene.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval. Varianta omikron pa uspe v precejšnji meri zaobiti to zaščito, zato v omikron valu ta pada in je trenutno okoli 8.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 6.1.2022 je padel od 2.87 celo samo na 1.6, potem pa je zaradi tretjih odmerkov spet naraščal in je zdaj okoli 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla …

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

ponedeljek 24.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI PRIBLIŽEVANJA VRHU ALI NA VRHU
R=1.20 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil do sredine januarja v skupini 15-24 let, ki je prevzela vodstvo in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let (7% potrjeno okuženih v 7 dneh !!!)
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah ali usklajevanja podatkov med MZ in NIJZ
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 29%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 10481 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 10474
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90,2% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 77%, 65-69: 79%, 70-74: 81%, 75-79: 80%, 80-84: 80%, 85-89: 80%, 90+: 81% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 80/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan (zadnje dni celo 10/dan), obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 15 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 800-1000 3.2.2022 (razen če je vrh podcenjen)
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 150-160 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

nedelja 23.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE IN LINEARNE RASTI ŽE V FAZI PRIBLIŽEVANJA VRHU
R=1.25 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
od 16.1. naprej nekaj več smrti, ki so verjetno posledica novoletnih delta okužb, okužb imunskooslabljenih v bolnišnicah ali usklajevanja podatkov med MZ in NIJZ
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že preko 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 9991 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 9950
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89,9% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 75%, 65-69: 77%, 70-74: 79%, 75-79: 79%, 80-84: 79%, 85-89: 79%, 90+: 79% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 75/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan (zadnje dni celo 10/dan), obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 12 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 800-1100 3.2.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 160-190 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

sobota 22.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.30 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 33%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 8862 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 8825
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89,4% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 74%, 65-69: 75%, 70-74: 77%, 75-79: 77%, 80-84: 77%, 85-89: 77%, 90+: 77% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 75/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 11 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1100 3.2.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 170-200 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!
Pri omikronu smo šli s tem čez rob. Trenutno se kaže nekje pri 18000 testih dnevno oziroma 11500 PCR+. V drugi polovici januarja so že kar konkretni zamiki pri jemanju brisov (tudi 3-4 dni) in tudi pri obdelavi v laboratorijih (do 48 ur). Ob javljenih številkah novih primerov je zadaj še nejavljenih kar precej. Ko bomo čez vrh, se bo še nekaj dni obdelovalo za nazaj, šele potem (morda zadnje dni januarja) pa bi lahko začeli opažati padanje številk novih primerov.

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.
22.1. se že bližamo vrhu vala okužb, kar pomeni da R pada proti 1. Ker je merjen za 4 dni nazaj, bo krivulja računskega (merjenega) R na spodnjem grafu dosegla vrednost 1 4 dni po dejanskem vrhu vala.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval. Varianta omikron pa uspe v precejšnji meri zaobiti to zaščito, zato v omikron valu ta pada in je trenutno okoli 8.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 6.1.2022 je padel od 2.87 celo samo na 1.6, potem pa je zaradi tretjih odmerkov spet naraščal in je zdaj okoli 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla …

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

petek 21.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.35 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 34%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 8525 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 8489
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89,1% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 75%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 76% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 75/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 9.2 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1200 3.2.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: predvidoma dodatnih 200

četrtek 20.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.36 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-25.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 12.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 36%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 8105 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 8068
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88,7% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 70%, 65-69: 72%, 70-74: 74%, 75-79: 74%, 80-84: 74%, 85-89: 74%, 90+: 74% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 65-70/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 5-6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 9 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-25.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1200 3.2.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1305 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

sreda 19.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.37 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-24.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 11500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 37%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 7614 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 7576
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88,7% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 69%, 65-69: 71%, 70-74: 73%, 75-79: 73%, 80-84: 73%, 85-89: 73%, 90+: 73% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 65/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8.8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 22.-24.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1297 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 4.1.2022 je padel od 2.87 že na 1.69 in še pada.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

torek 18.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.38 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 22.-24.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (izgleda bo pri povprečno 8000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 39%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 6919 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 6882
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88,2% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 68%, 65-69: 69%, 70-74: 71%, 75-79: 71%, 80-84: 71%, 85-89: 71%, 90+: 71% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 60-65/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8.6 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 20.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1290 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 4.1.2022 je padel od 2.87 že na 1.69 in še pada.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

ponedeljek 17.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.40 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-23.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000-7500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 41%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 6417 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 6381
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.9% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 66%, 65-69: 67%, 70-74: 69%, 75-79: 69%, 80-84: 69%, 85-89: 69%, 90+: 70% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 55-60/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8.5 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 20.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1280 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

nedelja 16.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.42 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-22.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000-7500 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 41%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 6066 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 6029
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.9% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 66%, 65-69: 67%, 70-74: 69%, 75-79: 69%, 80-84: 69%, 85-89: 69%, 90+: 69% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 60/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 20.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu 514 14.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1273 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

sobota 15.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.45 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki je izgleda že na vrhu ali celo čez; trenutno najbolj raste in podira rekorde incidenc skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
s sprotnimi dnevnimi meritvami virusa v odplakah bi lahko kakovostno spremljali dinamiko rasti omikron vala, tako pa žal niti na eni ČN ne monitorirajo dnevno (nekaj delajo zase na tedenski bazi)
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-22.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 48%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 5686 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 5646
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.5% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 57%, 65-69: 59%, 70-74: 60%, 75-79: 60%, 80-84: 60%, 85-89: 60%, 90+: 61% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 50-55/dan, po 10.1. se je pričel porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 7.5 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 20.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 15.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1100-1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1260 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

petek 14.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO SMO PREKO EKSPONENTNE ŽE V FAZI LINEARNE RASTI IN SE ŽE POČASI PRIBLIŽUJEMO VRHU
R=1.47 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki podira vse rekorde incidenc in je izgleda že čez vrh; trenutno najbolj raste in jih dohiteva skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
Omikron ima preko 50 mutacij in se uspešno izgobiba imunskemu odzivu, posledica je znižanje učinkovitsti zaščit (P, C) in bistveno povečanje bazena dovzetnih, ki ga je sposoben hitro preplaviti
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-22.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 48%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 5241 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 5202
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 58%, 65-69: 59%, 70-74: 61%, 75-79: 60%, 80-84: 60%, 85-89: 60%, 90+: 61% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 50/dan, pričenja se porast sprejemov zaradi omikrona
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 7.2 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 18.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 okoli 5. februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1260 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

četrtek 13.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO PREHOD IZ EKSPONENTNE V LINEARNO RAST
R=1.50 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 28.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki podira vse rekorde incidenc in je že blizu vrha; trenutno najbolj raste in jih dohiteva skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že okoli 95%, naše inštitucije so sicer delale veliko SGTF proxy PCR testov v začetni fazi vala, a rezultatov žal niso objavljale sproti dnevno
vrh primerov se kaže nekje okoli 18.-22.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 48%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 4834 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 4796
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.0% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 57%, 65-69: 59%, 70-74: 60%, 75-79: 60%, 80-84: 60%, 85-89: 60%, 90+: 60% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 48/dan, zadnje dni nekaj porasta, verjetno še zaradi NY delte …
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 6.8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 18.-23.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1200 na prehodu v februar 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1260 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

sreda 12.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO PREHOD IZ EKSPONENTNE V LINEARNO RAST
R=1.58 (izmerjeno za 4 dni nazaj, korigirano zaradi bližine mejne testne kapacitete)
od 10.1. so javljeni podatki o novih primerih pod vplivom bližine mejne testne kapacitete in posledičnih zamikov obdelave vzorcev nižji od realnih, realno stanje pričakujem spet po 25.1.
največji porast primerov je bil doslej med šolajočo mladino 15-24 let, ki podira vse rekorde incidenc; trenutno najbolj raste in jih dohiteva skupina 5-14 let
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že preko 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultatov žal ne objavljajo sproti dnevno
vrh primerov se kaže nekje okoli 17.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 7000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 9%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 46%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 4402 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 4367
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90.7% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 59%, 65-69: 60%, 70-74: 62%, 75-79: 62%, 80-84: 62%, 85-89: 62%, 90+: 62% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 47/dan, zadnje dni nekaj porasta, verjetno še zaradi NY delte …
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 6 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 17.-20.1., posamezen dan lahko tudi 15.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1200 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 145-155, predviden omikron vrh 200-250 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1241 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je bilo, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a da bo zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Ker po 10.1. ne vemo točnega števila novih primerov zaradi bližine meje testna kapacitete in posledičnih zamikov jemanja in obdelave vzorcev, ne moremo tudi povsem natančno določiti prave vrednosti R. Prikazani R je tako v tem času delno določen tudi po občutku in izkušnjah, ne samo po pridobljenih podatkih.
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa takrat največji forcing – različica omikron. Po novem letu bo prekuževanje postopoma spet pričelo bolj delovati v smeri zniževanja R, v drugi polovici januarja pa bo to največja sila.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 4.1.2022 je padel od 2.87 že na 1.69 in še pada.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

torek 11.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, TRENUTNO PREHOD IZ EKSPONENTNE V LINEARNO RAST
R=1.65 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
včeraj nerealno nizko število novih primerov (5164), pa čeprav je to absolutni rekord – to se vidi na nenaravno zlomljenih krivuljah, smo na meji testnh kapacitet
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, ki podira vse rekorde incidenc
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že preko 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 5-6000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 46%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 3923 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 3910
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 59%, 65-69: 60%, 70-74: 62%, 75-79: 61%, 80-84: 61%, 85-89: 61%, 90+: 62% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 50/dan, zadnje dni nekaj porasta, morda še zaradi delte …
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6/dan, obeta se malo porasta v prvi polovici februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 5 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >10.000 17.-20.1., posamezen dan lahko krepko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1200 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150-155, predviden omikron vrh 200-250 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1241 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200

ponedeljek 10.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.70 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, ki ima že rekordno incidenco
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že preko 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
že od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi krepko preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 34%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 3670 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 3634
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.8% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 76%, 75-79: 76%, 80-84: 76%, 85-89: 75%, 90+: 76% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., potem padlo do 31.12. na 38, zdaj nekje na nivoju 50/dan, zadnje dni nekaj porasta, morda še zaradi delte …
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 4.7 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >8000 15.-20.1., posamezen dan lahko krepko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150-155, predviden omikron vrh 250-300 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1230 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Delež prebolevnikov med pacienti na intenzivnih oddelkih (enote intenzivne terapije EIT) je zanemarljiv (pod 1%) …

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se je faktor v decembru 2021 zaradi tretjih odmerkov cepiva povečeval.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 4.1.2022 je padel od 2.87 že na 1.69 in še pada.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

nedelja 9.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.75 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, ki ima že rekordno incidenco
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že okoli 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
že od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je rekordnih 3455 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 3445
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.6% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 76%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 76% (omikron jo je znižal, zdaj raste nazaj!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., zdaj nekje na nivoju 45-50/dan, zadnje dni nekaj porasta …
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 4.7 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >8000 15.-20.1., posamezen dan lahko krepko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1230 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Ostali prikazi so na voljo v analizi prejšnjega dne.

sobota 8.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.80 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, ki ima že rekordno incidenco
Omikron ima kratko inkubacijsko dobo 3-4 dni, povzroča le 30-40% hospitalizacij glede na delto, in tudi manjšo možnost za intenzivno zdravljenje
pri nas trenutno omikrona že okoli 90%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
že od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri povprečno 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 3095 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 3068
4/1 SLO/EU zelenih občin, 3/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.4% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 73%, 70-74: 76%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 75% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., zdaj nekje na nivoju 45/dan, zadnje dni nekaj porasta …
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 8/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 4.7 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >8000 15.-20.1., posamezen dan lahko krepko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1100 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 v začetku februarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1219 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel, a zaradi verjetnega platoja testnih kapacitet bo izmerjeni R prej začel navidezno padati …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 15. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 3.1.2022 je padel od 2.87 že na 2.24 in še pada, verjetno bo kmalu pod 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

petek 7.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.80 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let, že jutri bo imela rekordno incidenco
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že preko 80%, naše inštitucije sicer delajo veliko SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
že od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2694 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 2667
3/2 SLO/EU zelenih občin, 3/2/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 71%, 65-69: 73%, 70-74: 75%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 75% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je imelo vrh 109 13.11., zdaj nekje na nivoju 40-45/dan, zadnje dni nekaj porasta …
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 8/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 4.7 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >8000 15.-20.1., posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 na prehodu v februar
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1219 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji uradno pričel s prvo registrirano okužbo 14.12.2021. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R nekje do 10.-15.1. še nekoliko narastel …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 15. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 3.1.2022 je padel od 2.87 že na 2.24 in še pada, verjetno bo kmalu pod 2.

Povprečna učinkovitost cepiva v Sloveniji proti okužbi je od sredine decembra že občutno padla. Kot kaže je možen celo padec v okolico 20% …

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

četrtek 6.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.75 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, trenutno največ med šolajočo mladino 15-24 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že preko 80%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2383 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 2361
3/1 SLO/EU zelenih občin, 3/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 71%, 65-69: 73%, 70-74: 75%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 75% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35-40/dan
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 5 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >5000 15.-20.1., posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 na prehodu v februar
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1204 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji pričel s prvo okužbo, ki je bila nekje v začetku decembra. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R do sredine januarja še nekoliko narastel …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 15. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 3.1.2022 je padel od 2.87 že na 2.24 in še pada, verjetno bo kmalu pod 2.

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

sreda 5.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.50 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, največ med ženskami 15-34 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že okoli 80%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 35%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 2079 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 2058
4/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.8% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 72%, 65-69: 74%, 70-74: 76%, 75-79: 75%, 80-84: 75%, 85-89: 75%, 90+: 76% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35/dan
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 6 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >5000 15.-20.1., posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 500 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 1000 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 na prehodu v februar
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1204 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 200-300

torek 4.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI DOMINANTEN ŽE OD 30.12.2021!
R=1.40 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, največ med ženskami 15-34 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že krepko preko 50%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. občutna rast, 3.1. bum …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 33%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1764 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1747
3/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.6% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 74%, 65-69: 75%, 70-74: 78%, 75-79: 77%, 80-84: 77%, 85-89: 77%, 90+: 77% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35-40/dan
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7-8/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >5000 sredi januarja, posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 520 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo okoli 150, predviden omikron vrh 250-300 konec januarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1198 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 300

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo! Jih bodo v omikron valu uspeli preko 15.000??

Omikron val se je v Sloveniji pričel s prvo okužbo, ki je bila nekje v začetku decembra. Pomik proti rasti števila primerov sem opažal na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. 27.12. smo imeli že občuten porast primerov. Za praznična (vikend) novoletna dneva smo dobili nekaj nižje število primerov, kar je pričakovano. 3.1. se je pokazala prava omikron eksplozija rasti števila primerov. Pričakovati je, da bo R do sredine januarja še nekoliko narastel …
Potrebno je ponovno povedati, da R pomeni koliko ljudi posamezen okuženi v povprečnem času okuževanja (inkubacijska doba omikrona se je skrajšala iz 5 na 3-4 dni) okuži naprej. Tu torej ne gre več za medtedenske primerjave, ampak za primerjave na bazi 4 dni.

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, bil konec leta že tudi 28, trenutno je okoli 15. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.
Pri tveganju za okužbo pa z nastopom omikron variante virusa faktor pada. Od sredine decembra 2021 do 3.1.2022 je padel od 2.87 že na 2.24 in še pada, verjetno bo kmalu pod 2.

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

ponedeljek 3.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI ŽE DOMINANTEN OD 30.12.2021!
R=1.40 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, največ med ženskami 25-34 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že krepko preko 50%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.-20.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 10.000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 31%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1539 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1526
6/1 SLO/EU zelenih občin, 3/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.4% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 77%, 65-69: 79%, 70-74: 82%, 75-79: 81%, 80-84: 81%, 85-89: 81%, 90+: 81% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35-40/dan
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 7-8/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >5000 sredi januarja, posamezen dan lahko preko 10.000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 520 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-170, predviden omikron vrh 250-300 konec januarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1189 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 300

nedelja 2.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI ŽE DOMINANTEN!
R=1.40 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi, največ med ženskami 25-34 let
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že krepko preko 50%, naše inštitucije sicer delajo dovolj SGTF proxy PCR testov a rezultate žal zadržujejo zase in jih javno ne objavljajo sproti
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 8000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 30%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1494 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1482
6/1 SLO/EU zelenih občin, 4/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 77%, 65-69: 79%, 70-74: 81%, 75-79: 81%, 80-84: 81%, 85-89: 81%, 90+: 81% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35/dan
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >4000 sredi januarja, posamezen dan lahko preko 8000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 520 do 13.1.2021, predviden omikron vrh okoli 900 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-170, predviden omikron vrh 250-300 konec januarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1178 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 300

sobota 1.1.2022

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI ŽE DOMINANTEN!
R=1.41 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že preko 50%, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(sploh ni šala)
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 8000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 30%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1471 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1458
6/1 SLO/EU zelenih občin, 4/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 78%, 65-69: 80%, 70-74: 82%, 75-79: 82%, 80-84: 82%, 85-89: 81%, 90+: 82% (omikron jo niža!)
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35/dan
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, na tem nivoju naj bi ostale čez omikron val do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >4000 sredi januarja, posamezen dan lahko preko 8000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 520 do 13.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900 konec januarja 2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-170, predviden omikron vrh 250-300 konec januarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1172 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 300

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. Dejansko se pomik proti rasti opazi na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. Krivuljo R bo kot kaže zelo verjetno dvignil že pred novim letom …

Vreme (rumena krivulja) pozimi v povprečju deluje (sila, “forcing”) v smeri povečevanja R, saj prehajamo v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. Sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa trenutno največji forcing – različica omikron.

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

petek 31.12.2021

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI ŽE DOMINANTEN!
R=1.42 (izmerjeno za 4 dni nazaj, danes vsak okuženi verjetno okuži blizu dveh naprej
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimi
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že preko 50%, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(sploh ni šala)
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
vrh primerov se kaže nekje okoli 16.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 8000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi omikrona in popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 30%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1389 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1377
5/1 SLO/EU zelenih občin, 3/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.2% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 78%, 65-69: 80%, 70-74: 83%, 75-79: 82%, 80-84: 82%, 85-89: 82%, 90+: 82%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 38/dan
smrti so imele vrh zadnji teden novembra pri 19/dan (delta), trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, na tem nivoju naj bi ostale do sredine februarja, nakar padec
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >4000 sredi januarja, posamezen dan lahko preko 8000
napoved hospitaliziranih: delta vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 540 do 10.1.2022, predviden omikron vrh okoli 900 po 25.1.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-180, predviden omikron vrh 280-300 konec januarja
napoved umrlih: ocena 1300 za delta val je bila izredno točna (1163 do zdaj), omikron bo predvidoma prinesel dodatnih 300

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. Dejansko se pomik proti rasti opazi na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. Krivuljo R bo kot kaže zelo verjetno dvignil že pred novim letom …

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra so prišli novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih.
Povprečno dnevno število umrlih je že krepko čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, že dolgo se vidi da izgleda okoli 1300.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Nižje starostne skupine imajo že od 21.12. omikron rast …

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

četrtek 30.12.2021

Povzetek dnevne analize:
OMIKRON VAL V SLOVENIJI V POLNEM RAZMAHU, MED RAZLIČICAMI ŽE DOMINANTEN!
R=1.40 (izmerjeno za 4 dni nazaj, danes že vsak okuženi okuži 2 naprej
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimij
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že preko 50%, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(sploh ni šala)
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
vrh primerov se kaže nekje okoli 15.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 8000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno (brez upoštevanja omikrona) vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 22%
omikron bo občutno dvignile delež dovzetnih, ki bo zdaj verjetno narastel na preko 30% (natančnejša ocena v kratkem)
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1290 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1281
4/1 SLO/EU zelenih občin, 3/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: , 65-69: , 70-74: , 75-79: , 80-84: , 85-89: ; 90+: … ocene v kratkem!
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 40/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 8 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >4000 okoli 15.1.2022, posamezen dan lahko preko 8000
napoved hospitaliziranih: deltai vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 550 do 31.12., predviden omikron vrh okoli 1000 po 25.1.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-180, predviden omikron vrh >280 konec januarja
napoved umrlih: delta val 1300-1350 (1158 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750, zaradi omikrona predvidoma dodatnih 400-500

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. Dejansko se pomik proti rasti opazi na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. Krivuljo R bo kot kaže zelo verjetno dvignil že pred novim letom …

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že krepko čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, že dolgo se vidi da izgleda okoli 1300.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Tudi višje starostne skupine imajo lepo padanje …
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja. Podobno 75-84 let. Verjetno je to popuščanje že pokrito s tretjimi odmerki, ki so že nekje na 40%.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

sreda 29.12.2021

Povzetek dnevne analize:
JASEN PRIČETEK OMIKRON VALA V SLOVENIJI!
R=1.29 (izmerjeno za 4 dni nazaj)
največji porast primerov je zaenkrat med mlajšimij
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, zato nekajdnevni zamik rasti hospitalizacij v Londonu, ZDA in drugje
pri nas trenutno omikrona že okoli 50%, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(sploh ni šala)
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
vrh primerov se kaže nekje okoli 15.1.2022, izgleda visok, kakšen dan lahko tudi preko 8000 primerov (verjetno bo pri 4-5000 plato zaradi kapacitet testiranja)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno (brez upoštevanja omikrona) vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 22%
omikron bo občutno dvignile delež dovzetnih, ki bo zdaj verjetno narastel na preko 30% (natančnejša ocena v kratkem)
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1208 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1200
4/1 SLO/EU zelenih občin, 1/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 88.0% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: , 65-69: , 70-74: , 75-79: , 80-84: , 85-89: ; 90+: … ocene v kratkem!
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 40/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 3 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje >4000 okoli 15.1.2022, posamezen dan lahko preko 8000
napoved hospitaliziranih: deltai vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 550 do 31.12., predviden omikron vrh okoli 1000 po 25.1.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-180, predviden omikron vrh >280 konec januarja
napoved umrlih: delta val 1300-1350 (1158 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750, zaradi omikrona predvidoma dodatnih 400-500

torek 28.12.2021

Povzetek dnevne analize:
PRIČETEK VIDNEGA DELA OMIKRON VALA V SLOVENIJI! Od 26.12. število primerov višje kot teden prej.
Omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, ranga 30-40% glede na delto, London ima le blag porast, podobno v USA
pri nas trenutno omikrona že blizu 50%, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(sploh ni šala)
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej, ponedeljek 27.12. že občutna rast …
glede na zadnje podatke sedaj od 28.12. predvidevam dvigovanje krivulje izmerjenega R (za teden nazaj) , vrh primerov pa verjetno nekje okoli 10.1.2022, sklepam da nižji kot kje drugod
R=0.93 (izračunan iz medtedenskih primerjav, ob upoštevanju t0=4 dni je bil 4 dni nazaj že 1.07)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 22% (opravljena je bila manjša korekcija v aplikaciji)
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1121 (min po delta valu je bil 25.12. pri 1068), NIJZ s korekcijami za nazaj 1112
8/0 SLO/EU zelenih občin, 3/0/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.8% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 87%, 65-69: 89%, 70-74: 92%, 75-79: 91%, 80-84: 91%, 85-89: 91%; 90+: 91%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 6-7/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): delta vrh 3338 6.11.2021, t2 3 dni, predvideno omikron max dnevno povprečje 3-4000 okoli 10.1.2022, posamezen dan lahko preko 5000
napoved hospitaliziranih: deltai vrh 1168 23.11., min po delta valu bo okoli 550 do 31.12., predviden omikron vrh okoli 1000 po 20.1.2022
napoved ICU: delta vrh je bil 25.11. pri 289, min po delta valu bo nekje 150-180, predviden omikron vrh 250 konec januarja
napoved umrlih: delta val 1300-1350 (1140 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750, zaradi omikrona predvidoma dodatnih 100-300

Omikron
Glavna tema zdaj je prihajajoča različica virusa omikron. Spremljamo njeno hitro širjenje najprej v Južni Afriki, potem pa že v VB, ter na Danskem in Norveškem. Kasneje cela USA, pa Avstralija, Nizozemska, … Vse te države so imele v tem času bolj slabo kontrolo superprenašalskih dogodkov. Situacija v teh državah ni neposredno primerljiva. Nizozemska je šla v lockdown, Izrael sprejema ukrepe, Španija uvedla maske na prostem, ….
JAR ima mlado populacijo, visoko prekuženo z beto in delto, ter precej slabo precepljeno populacijo. Omikron se tam širi že od konca novembra. Zdaj se že dogajajo hospitalizacije in tudi že nekaj smrti, do 17.12. je bilo 56 smrti. Podatki kažejo, da je hospitalizacij in smrti malo. A populacija je mlada in ne smemo prehitro sklepati na bolj blago bolezen, čeprav raziskave od 23.12. temu pritrjujejo.
V VB se omikron pospešeno širi od začetka decembra. V Londonu je omikron zadominiral že v sredini decembra. Pričakovali so več stotisoč dnevnih okužb, tudi do milijona, a realnost je pokazala neke vrste plato pri nekaj na 90k/dan. VB ima starejšo populacijo, ki je tudi zelo solidno prekužena z alfo in delto, predvsem pa je izredno dobro precepljena. So mojstri v obdelavi podatkov in stanje pri njih do Božiča bo veliko povedalo. 20.12. zjutraj: 104 omikron hospitalizacije in 12 omikron smrti.
Tudi na Danskem omikron že dominira. Danska je slabo prekužena, a visoko precepljena. Spet nazaj uvajajo omejitve, ker vedo, da je zaščita od cepljenja nekaj manj kvalitetna od tiste prebolevnikov.
R0 omikrona še ni določen. Hitrost opazovanega širjenja sugerira R0 višji od R0 delte, a ni tako preprosto. Ta hitrost je lahko tudi posledica dokazane moči imunskega pobega omikrona (ima ranga 30 mutacij na S proteinu), in pa superprenašalskih dogodkov. Raziskava iz Hong Konga pravijo, da se omikron v bronhijih človeka 70x hitreje širi, kot delta. Podobno je potrdila tudi britanska raziskava. Dodatno se je pokazalo, da je inkubacijska doba omikrona le 3-4 dni! To bi tudi govorilo v prid R0 višjega od delte. Širjenje v teh državah tudi ni več le med mlajšo populacijo, in tudi se ne poroča o nekih masovnih reinfekcijah (možnost naj bi bila 5x višja kot pri delti). Vse to trenutno res govori v prid, da ima omikron višji R0 od delte. To bi potem impliciralo, da bo omikron v kratkem izpodrinil delto, tega pa na podatkih še nismo dokazali.
Teža bolezni, ki jo povzroča omikron, naj bi po prvih informacijah iz JAR bila nižja. A tam so visoko prekuženi in mladi in ne smemo prehitro sklepati. Bolj točno bo to pokazala situacija v VB. Sklepal sem, da bomo že na podatkih iz VB bolnišnic do Božiča veliko vedeli na to temo, do novega leta pa že skoraj vse. Res se je 23.12. pojavilo kar nekaj raziskav, ki so pritrdile blažjemu poteku. Če bi bila bolezen od omikrona res blažja, in bi omikron izpodrinil delto, potem bi to lahko bilo kar lepo Božično darilo z neba. Zbiramo podatke naprej.
Sumim, da je omikron našel neko vrrsto “niše” in jo s svojo visoko kužnostjo hitro preplavi. Zato hitra rast primerov in nato hiter upad. Ta niša je verjetno v največji meri med cepljenimi, delno pa tudi med prebolevniki. Zadnje dni celo razmišljam o varianti, da si prebolevniki z naknadnim cepljenjem zožijo imunski odziv, zaradi česar potem omikron z lahkoto povzroči prebojno okužbo. Ker pa določene komponente spominskega dela imunskega sistema še vedno delujejo (link), je hospitalizacij vseeno precej manj. To bi pojasnilo tudi relativno hiter upad dosedanjih omikron valov. Pojasnilo bi tudi negativno korelacijo zaščite od cepljenja in incidence okužb med cepljenimi (na Danskem je pogostost okužb med cepljenimi proporcionalno višja kot med necepljenimi!). Kot rečeno, o tej varianti šele razmišljam in vanjo (še) nisem prepričan.
Pri nas čakamo, kdaj bo omikron zavzel pomemben delež okužb. Naše inštitucije spet poročajo za 2 tedna nazaj (opisujejo nam prazgodovino namesto sedanjosti), in bodo našle opazen delež omikrona, ko bo pri nas omikron vala že konec (pikra šala, no, ali pa sploh ni šala). Ne delajo sproti SGTF PCR proxy testa ne velikem delu vzorcev kot to delajo drugje. 21.12. je bil podatek o 51 odkritih omikron vzorcih, in to praktično v vseh regijah. Kot sem dejal prej, do 17.12. omikron še ni zavzel 10% deleža novih okužb. Po podatkih iz 21.12. sem sklepal, da smo dne 22.10. že bili pri okoli 10% od vseh novih prenosov okužb. Podatki rasti primerov 28.12. kažejo na to, da je 27.12. omikron že pri 30-50% deleža vseh primerov.
Sklepal sem, da se bo na številu novih primerov sprememba začela kazati že tik pred Božičem, potem pa bi znala krivulja R do novega leta že močno poskočiti. To se je pričelo s 26.12. Sklepam, da bo okoli 10.1. že vrh omikron vala pri nas, in da bo dnevno povprečno največ okoli 3000-4000 novih primerov, na posamezen dan lahko tudi preko 5000. Ker ne poznamo niti točnih karakteristik virusa, niti ne točnega obsega virusa pri nas, so vse to trenutno le zelo približne ocene. Seveda, na krivulje hospitalizacij in smrti bo omikron vplival pozneje, kot pa na krivuljo novih primerov.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. Dejansko se pomik proti rasti opazi na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. Krivuljo R bo kot kaže zelo verjetno dvignil že pred novim letom …

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že krepko čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, že dolgo se vidi da izgleda okoli 1300.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Tudi višje starostne skupine imajo lepo padanje …
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja. Podobno 75-84 let. Verjetno je to popuščanje že pokrito s tretjimi odmerki, ki so že nekje na 40%.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

ponedeljek 27.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso bile spodbudne, dominira: JAR, VB, Danska, Norvveška, USA, Sydney, v JAR in VB že smrti
od 20.12. kar ni bilo informacij o polnjenju bolnišnic zaradi omikrona, 23.12. objavljenih več študij, ki pritrjujejo temu, da omikron povzroča občutno manj hospitalizacij, London ima le blag porast
koliko je omikrona pri nas se ne ve točno, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
od 21.12. se mlajše starostne skupine (sploh 15-34) pomikajo proti rasti, na nedeljo 26.12. že porast primerov glede na teden prej … to bi lahko bil pričetek vidnega dela našega omikron vala
glede na zadnje podatke sedaj od 27.12. predvidevam dvigovanje krivulje izmerjenega R (za teden nazaj) , vrh primerov pa verjetno bekje do 10.1.2022, sklepam da nižji kot kje drugod
R=0.88, po 10.12. imamo rahel virtualen porast zaradi večanja obsega HAT testiranja (17.12. 5% populacije v enem dnevu!!!), očitno pa glede na sprejeme močno vpliva tudi veseli december
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 12%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 22% (opravljena je bila manjša korekcija v aplikaciji)
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1084 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1075
6/0 SLO/EU zelenih občin, 2/0/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 87.7% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 87%, 65-69: 89%, 70-74: 92%, 75-79: 91%, 80-84: 91%, 85-89: 91%; 90+: 91%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 35/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 7/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, do 26.12. so padale, t/2 40 dni
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 31.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 25.12., stanje 31.12.: 180, <150 20.1. (zaradi omikron verjetno kasneje)
napoved umrlih: 1300-1350 (1104 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750

Omikron
Glavna tema zdaj je prihajajoča različica virusa omikron. Spremljamo njeno hitro širjenje najprej v Južni Afriki, potem pa že v VB, ter na Danskem in Norveškem. Kasneje cela USA, pa Avstralija, Nizozemska, … Vse te države so imele v tem času bolj slabo kontrolo superprenašalskih dogodkov. Situacija v teh državah ni neposredno primerljiva. Nizozemska je šla v lockdown, Izrael sprejema ukrepe, Španija uvedla maske na prostem, ….
JAR ima mlado populacijo, visoko prekuženo z beto in delto, ter precej slabo precepljeno populacijo. Omikron se tam širi že od konca novembra. Zdaj se že dogajajo hospitalizacije in tudi že nekaj smrti, do 17.12. je bilo 56 smrti. Podatki kažejo, da je hospitalizacij in smrti malo. A populacija je mlada in ne smemo prehitro sklepati na bolj blago bolezen, čeprav raziskave od 23.12. temu pritrjujejo.
V VB se omikron pospešeno širi od začetka decembra. V Londonu je omikron zadominiral že v sredini decembra. Pričakovali so več stotisoč dnevnih okužb, tudi do milijona, a realnost je pokazala neke vrste plato pri nekaj na 90k/dan. VB ima starejšo populacijo, ki je tudi zelo solidno prekužena z alfo in delto, predvsem pa je izredno dobro precepljena. So mojstri v obdelavi podatkov in stanje pri njih do Božiča bo veliko povedalo. 20.12. zjutraj: 104 omikron hospitalizacije in 12 omikron smrti.
Tudi na Danskem omikron že dominira. Danska je slabo prekužena, a visoko precepljena. Spet nazaj uvajajo omejitve, ker vedo, da je zaščita od cepljenja nekaj manj kvalitetna od tiste prebolevnikov.
R0 omikrona še ni določen. Hitrost opazovanega širjenja sugerira R0 višji od R0 delte, a ni tako preprosto. Ta hitrost je lahko tudi posledica dokazane moči imunskega pobega omikrona (ima ranga 30 mutacij na S proteinu), in pa superprenašalskih dogodkov. Raziskava iz Hong Konga pravijo, da se omikron v bronhijih človeka 70x hitreje širi, kot delta. Podobno je potrdila tudi britanska raziskava. Dodatno se je pokazalo, da je inkubacijska doba omikrona le 3-4 dni! To bi tudi govorilo v prid R0 višjega od delte. Širjenje v teh državah tudi ni več le med mlajšo populacijo, in tudi se ne poroča o nekih masovnih reinfekcijah (možnost naj bi bila 5x višja kot pri delti). Vse to trenutno res govori v prid, da ima omikron višji R0 od delte. To bi potem impliciralo, da bo omikron v kratkem izpodrinil delto, tega pa na podatkih še nismo dokazali.
Teža bolezni, ki jo povzroča omikron, naj bi po prvih informacijah iz JAR bila nižja. A tam so visoko prekuženi in mladi in ne smemo prehitro sklepati. Bolj točno bo to pokazala situacija v VB. Sklepal sem, da bomo že na podatkih iz VB bolnišnic do Božiča veliko vedeli na to temo, do novega leta pa že skoraj vse. Res se je 23.12. pojavilo kar nekaj raziskav, ki so pritrdile blažjemu poteku. Če bi bila bolezen od omikrona res blažja, in bi omikron izpodrinil delto, potem bi to lahko bilo kar lepo Božično darilo z neba. Zbiramo podatke naprej.
Sumim, da je omikron našel neko vrrsto “niše” in jo s svojo visoko kužnostjo hitro preplavi. Zato hitra rast primerov in nato hiter upad. Ta niša je verjetno v največji meri med cepljenimi, delno pa tudi med prebolevniki. Zadnje dni celo razmišljam o varianti, da si prebolevniki z naknadnim cepljenjem zožijo imunski odziv, zaradi česar potem omikron z lahkoto povzroči prebojno okužbo. Ker pa določene komponente spominskega dela imunskega sistema še vedno delujejo (link), je hospitalizacij vseeno precej manj. To bi pojasnilo tudi relativno hiter upad dosedanjih omikron valov. Pojasnilo bi tudi negativno korelacijo zaščite od cepljenja in incidence okužb med cepljenimi (na Danskem je pogostost okužb med cepljenimi proporcionalno višja kot med necepljenimi!). Kot rečeno, o tej varianti šele razmišljam in vanjo (še) nisem prepričan.
Pri nas čakamo, kdaj bo omikron zavzel pomemben delež okužb. Naše inštitucije spet poročajo za 2 tedna nazaj (opisujejo nam prazgodovino namesto sedanjosti), in bodo našle opazen delež omikrona, ko bo pri nas omikron vala že konec (pikra šala, no, ali pa sploh ni šala). Ne delajo sproti SGTF PCR proxy testa ne velikem delu vzorcev kot to delajo drugje. 21.12. je bil podatek o 51 odkritih omikron vzorcih, in to praktično v vseh regijah. Kot sem dejal prej, do 17.12. omikron še ni zavzel 10% deleža novih okužb. Po podatkih iz 21.12. sklepam, da smo dne 22.10. že bili pri okoli 10% od vseh novih prenosov okužb. Sklepal sem, da se bo na številu novih primerov sprememba začela kazati že tik pred Božičem, potem pa bi znala krivulja R do novega leta že močno poskočiti. A 25.12. še ni omenjenega pričetka rasti primerov. Sklepam, da bo okoli 15.1. že vrh omikron vala pri nas, in da bo dnevno po največ okoli 3000-4000 novih primerov. Ker ne poznamo niti točnih karakteristik virusa, niti ne točnega obsega virusa pri nas, so vse to trenutno le zelo približne ocene. Seveda, na krivulje hospitalizacij in smrti bo omikron vplival pozneje, kot pa na krivuljo novih primerov.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1. 26.12. je bilo že prvič več primerov kot na isti dan teden dni nazaj. Dejansko se pomik proti rasti opazi na mlajših starostnih skupina že po 21.12.2021. Krivuljo R bo kot kaže zelo verjetno dvignil že pred novim letom …

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že krepko čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, že dolgo se vidi da izgleda okoli 1300.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Tudi višje starostne skupine imajo lepo padanje …
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja. Podobno 75-84 let. Verjetno je to popuščanje že pokrito s tretjimi odmerki, ki so že nekje na 40%.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

ponedeljek 27.12.2021 ob 00:55 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 632 kod (75 ali 13% več kot prejšnjo nedeljo!), izgleda bo okoli 660/2000 …)

nedelja 26.12.2021 ob 00:55 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 605 kod (137 ali 18% manj kot prejšnjo soboto!), izgleda bo okoli 620/2000 …)

sobota 25.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso bile spodbudne, dominira: JAR, VB, Danska, Norvveška, USA, Sydney, v JAR in VB že smrti
zadnje dni kar ni informacij o polnjenju bolnišnic zaradi omikrona, to je zelo dobro! do konca tedna bomo lahko z gotovostjo kaj povedali …
23.12. objavljenih več študij, ki pritrjujejo temu, da omikron povzroča občutno manj hospitalizacij
koliko je omikrona pri nas se ne ve točno, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
21.12. je naš prvi epidemiolog iz žepa potegnil listek, da smo (verjetno SGTF proxy testi) odkrili že 51 primerov omikrona, in da so praktično v vseh regijah (splošno dostopnih javnih podatkov ni)
glede na zadnje podatke predvidevam dvig krivulje izmerjenega R (za teden nazaj) v dneh točno okoli Božiča, vrh primerov pa verjetno do 10.1.2022, sklepam da nižji kot kje drugod
R=0.87, po 10.12. imamo rahel virtualen porast zaradi večanja obsega HAT testiranja (17.12. 5% populacije v enem dnevu!!!), očitno pa glede na sprejeme vpliva tudi veseli december
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1082 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1074
11/1 SLO/EU zelenih občin, 4/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90.5% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 90%, 65-69: 92%, 70-74: 94%, 75-79: 94%, 80-84: 94%, 85-89: 94%; 90+: 94%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 37/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 8/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 36 dni
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 30.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 25.12., stanje 31.12.: 178, <150 14.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1104 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750

Omikron
Glavna tema zdaj je prihajajoča različica virusa omikron. Spremljamo njeno hitro širjenje najprej v Južni Afriki, potem pa že v VB, ter na Danskem in Norveškem. Kasneje cela USA, pa Avstralija, Nizozemska, … Vse te države so imele v tem času bolj slabo kontrolo superprenašalskih dogodkov. Situacija v teh državah ni neposredno primerljiva. Nizozemska je šla v lockdown, Izrael sprejema ukrepe, Španija uvedla maske na prostem, ….
JAR ima mlado populacijo, visoko prekuženo z beto in delto, ter precej slabo precepljeno populacijo. Omikron se tam širi že od konca novembra. Zdaj se že dogajajo hospitalizacije in tudi že nekaj smrti, do 17.12. je bilo 56 smrti. Podatki kažejo, da je hospitalizacij in smrti malo. A populacija je mlada in ne smemo prehitro sklepati na bolj blago bolezen, čeprav raziskave od 23.12. temu pritrjujejo.
V VB se omikron pospešeno širi od začetka decembra. V Londonu je omikron zadominiral že v sredini decembra. Pričakovali so več stotisoč dnevnih okužb, tudi do milijona, a realnost je pokazala neke vrste plato pri nekaj na 90k/dan. VB ima starejšo populacijo, ki je tudi zelo solidno prekužena z alfo in delto, predvsem pa je izredno dobro precepljena. So mojstri v obdelavi podatkov in stanje pri njih do Božiča bo veliko povedalo. 20.12. zjutraj: 104 omikron hospitalizacije in 12 omikron smrti.
Tudi na Danskem omikron že dominira. Danska je slabo prekužena, a visoko precepljena. Spet nazaj uvajajo omejitve, ker vedo, da je zaščita od cepljenja nekaj manj kvalitetna od tiste prebolevnikov.
R0 omikrona še ni določen. Hitrost opazovanega širjenja sugerira R0 višji od R0 delte, a ni tako preprosto. Ta hitrost je lahko tudi posledica dokazane moči imunskega pobega omikrona (ima ranga 30 mutacij na S proteinu), in pa superprenašalskih dogodkov. Raziskava iz Hong Konga pravijo, da se omikron v bronhijih človeka 70x hitreje širi, kot delta. Podobno je potrdila tudi britanska raziskava. Dodatno se je pokazalo, da je inkubacijska doba omikrona le 3-4 dni! To bi tudi govorilo v prid R0 višjega od delte. Širjenje v teh državah tudi ni več le med mlajšo populacijo, in tudi se ne poroča o nekih masovnih reinfekcijah (možnost naj bi bila 5x višja kot pri delti). Vse to trenutno res govori v prid, da ima omikron višji R0 od delte. To bi potem impliciralo, da bo omikron v kratkem izpodrinil delto, tega pa na podatkih še nismo dokazali.
Teža bolezni, ki jo povzroča omikron, naj bi po prvih informacijah iz JAR bila nižja. A tam so visoko prekuženi in mladi in ne smemo prehitro sklepati. Bolj točno bo to pokazala situacija v VB. Sklepal sem, da bomo že na podatkih iz VB bolnišnic do Božiča veliko vedeli na to temo, do novega leta pa že skoraj vse. Res se je 23.12. pojavilo kar nekaj raziskav, ki so pritrdile blažjemu poteku. Če bi bila bolezen od omikrona res blažja, in bi omikron izpodrinil delto, potem bi to lahko bilo kar lepo Božično darilo z neba. Zbiramo podatke naprej.
Sumim, da je omikron našel neko vrrsto “niše” in jo s svojo visoko kužnostjo hitro preplavi. Zato hitra rast primerov in nato hiter upad. Ta niša je verjetno v največji meri med cepljenimi, delno pa tudi med prebolevniki. Zadnje dni celo razmišljam o varianti, da si prebolevniki z naknadnim cepljenjem zožijo imunski odziv, zaradi česar potem omikron z lahkoto povzroči prebojno okužbo. Ker pa določene komponente spominskega dela imunskega sistema še vedno delujejo (link), je hospitalizacij vseeno precej manj. To bi pojasnilo tudi relativno hiter upad dosedanjih omikron valov. Pojasnilo bi tudi negativno korelacijo zaščite od cepljenja in incidence okužb med cepljenimi (na Danskem je pogostost okužb med cepljenimi proporcionalno višja kot med necepljenimi!). Kot rečeno, o tej varianti šele razmišljam in vanjo (še) nisem prepričan.
Pri nas čakamo, kdaj bo omikron zavzel pomemben delež okužb. Naše inštitucije spet poročajo za 2 tedna nazaj (opisujejo nam prazgodovino namesto sedanjosti), in bodo našle opazen delež omikrona, ko bo pri nas omikron vala že konec (pikra šala, no, ali pa sploh ni šala). Ne delajo sproti SGTF PCR proxy testa ne velikem delu vzorcev kot to delajo drugje. 21.12. je bil podatek o 51 odkritih omikron vzorcih, in to praktično v vseh regijah. Kot sem dejal prej, do 17.12. omikron še ni zavzel 10% deleža novih okužb. Po podatkih iz 21.12. sklepam, da smo dne 22.10. že bili pri okoli 10% od vseh novih prenosov okužb. Sklepal sem, da se bo na številu novih primerov sprememba začela kazati že tik pred Božičem, potem pa bi znala krivulja R do novega leta že močno poskočiti. A 25.12. še ni omenjenega pričetka rasti primerov. Sklepam, da bo okoli 15.1. že vrh omikron vala pri nas, in da bo dnevno po največ okoli 3000-4000 novih primerov. Ker ne poznamo niti točnih karakteristik virusa, niti ne točnega obsega virusa pri nas, so vse to trenutno le zelo približne ocene. Seveda, na krivulje hospitalizacij in smrti bo omikron vplival pozneje, kot pa na krivuljo novih primerov.

petek 24.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso bile spodbudne, dominira: JAR, VB, Danska, Norvveška, USA, Sydney, v JAR in VB že smrti
zadnje dni kar ni informacij o polnjenju bolnišnic zaradi omikrona, to je zelo dobro! do konca tedna bomo lahko z gotovostjo kaj povedali …
23.12. objavljenih več študij, ki pritrjujejo temu, da omikron povzroča občutno manj hospitalizacij
koliko je omikrona pri nas se ne ve točno, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
21.12. je naš prvi epidemiolog iz žepa potegnil listek, da smo (verjetno SGTF proxy testi) odkrili že 51 primerov omikrona, in da so praktično v vseh regijah (splošno dostopnih javnih podatkov ni)
glede na zadnje podatke predvidevam dvig krivulje izmerjenega R (za teden nazaj) v dneh točno okoli Božiča, vrh primerov pa verjetno do 10.1.2022, sklepam da nižji kot kje drugod
R=0.88, po 10.12. imamo rahel virtualen porast zaradi večanja obsega HAT testiranja (17.12. 5% populacije v enem dnevu!!!), očitno pa glede na sprejeme vpliva tudi veseli december
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1111 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1101
8/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90.4% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 90%, 65-69: 92%, 70-74: 94%, 75-79: 94%, 80-84: 94%, 85-89: 94%; 90+: 94%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 38/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 9/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 37 dni
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 31.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 24.12., stanje 31.12.: 175, <150 10.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1104 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750

četrtek 23.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, dominira: JAR, VB, Danska, Norvveška, USA, Sydney, v JAR in VB že smrti
zadnje dni kar ni informacij o polnjenju bolnišnic zaradi omikrona, to je zelo dobro! do konca tedna bomo lahko z gotovostjo kaj povedali …
23.12. objavljenih več študij, ki pritrjujejo temu, da omikron povzroča občutno manj hospitalizacij
koliko je omikrona pri nas se ne ve točno, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
21.12. je naš prvi epidemiolog iz žepa potegnil listek, da smo (verjetno SGTF proxy testi) odkrili že 51 primerov omikrona, in da so praktično v vseh regijah (splošno dostopnih javnih podatkov ni)
glede na zadnje podatke predvidevam dvig krivulje izmerjenega R (za teden nazaj) v dneh točno okoli Božiča, vrh primerov pa verjetno do 10.1.2022, sklepam da nižji kot kje drugod
R=0.88, po 10.12. imamo rahel virtualen porast zaradi večanja obsega HAT testiranja (17.12. 5% populacije v enem dnevu!!!)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1121 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1114
6/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90.3% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 90%, 65-69: 92%, 70-74: 94%, 75-79: 94%, 80-84: 94%, 85-89: 93%; 90+: 93%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 38/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 9/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 38 dni
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 30.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 23.12., stanje 31.12.: 170, <150 8.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1103 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750

Omikron
Glavna tema zdaj je prihajajoča različica virusa omikron. Spremljamo njeno hitro širjenje najprej v Južni Afriki, potem pa že v VB, ter na Danskem in Norveškem. Kasneje cela USA, pa Avstralija, Nizozemska, … Vse te države so imele v tem času bolj slabo kontrolo superprenašalskih dogodkov. Situacija v teh državah ni neposredno primerljiva. Nizozemska je šla v lockdown, Izrael sprejema ukrepe, Španija uvedla maske na prostem, ….
JAR ima mlado populacijo, visoko prekuženo z beto in delto, ter precej slabo precepljeno populacijo. Omikron se tam širi že od konca novembra. Zdaj se že dogajajo hospitalizacije in tudi že nekaj smrti, do 17.12. je bilo 56 smrti. Podatki kažejo, da je hospitalizacij in smrti malo. A populacija je mlada in ne smemo prehitro sklepati na bolj blago bolezen, čeprav raziskave od 23.12. temu pritrjujejo.
V VB se omikron pospešeno širi od začetka decembra. V Londonu je omikron zadominiral že v sredini decembra. Pričakovali so več stotisoč dnevnih okužb, tudi do milijona, a realnost je pokazala neke vrste plato pri nekaj na 90k/dan. VB ima starejšo populacijo, ki je tudi zelo solidno prekužena z alfo in delto, predvsem pa je izredno dobro precepljena. So mojstri v obdelavi podatkov in stanje pri njih do Božiča bo veliko povedalo. 20.12. zjutraj: 104 omikron hospitalizacije in 12 omikron smrti.
Tudi na Danskem omikron že dominira. Danska je slabo prekužena, a visoko precepljena. Spet nazaj uvajajo omejitve, ker vedo, da je zaščita od cepljenja nekaj manj kvalitetna od tiste prebolevnikov.
R0 omikrona še ni določen. Hitrost opazovanega širjenja sugerira R0 višji od R0 delte, a ni tako preprosto. Ta hitrost je lahko tudi posledica dokazane moči imunskega pobega omikrona (ima ranga 30 mutacij na S proteinu), in pa superprenašalskih dogodkov. Raziskava iz Hong Konga pravijo, da se omikron v bronhijih človeka 70x hitreje širi, kot delta. Podobno je potrdila tudi britanska raziskava. To bi tudi govorilo v prid R0 višjega od delte. Širjenje v teh državah tudi ni več le med mlajšo populacijo, in tudi se ne poroča o nekih masovnih reinfekcijah (možnost naj bi bila 5x višja kot pri delti). Vse to trenutno res govori v prid, da ima omikron višji R0 od delte. To bi potem impliciralo, da bo omikron v kratkem izpodrinil delto, tega pa na podatkih še nismo dokazali.
Teža bolezni, ki jo povzroča omikron, naj bi po prvih informacijah iz JAR bila nižja. A tam so visoko prekuženi in mladi in ne smemo prehitro sklepati. Bolj točno bo to pokazala situacija v VB. Sklepal sem, da bomo že na podatkih iz VB bolnišnic do Božiča veliko vedeli na to temo, do novega leta pa že skoraj vse. Res se je 23.12. pojavilo kar nekaj raziskav, ki so pritrdile blažjemu poteku. Če bi bila bolezen od omikrona res blažja, in bi omikron izpodrinil delto, potem bi to lahko bilo kar lepo Božično darilo z neba. Zbiramo podatke naprej.
Sumim, da je omikron našel neko vrrsto “niše” in jo s svojo visoko kužnostjo hitro preplavi. Zato hitra rast primerov in nato hiter upad. Ta niša je verjetno v največji meri med cepljenimi, delno pa tudi med prebolevniki. Zadnje dni celo razmišljam o varianti, da si prebolevniki z naknadnim cepljenjem zožijo imunski odziv, zaradi česar potem omikron z lahkoto povzroči prebojno okužbo. Ker pa določene komponente spominskega dela imunskega sistema še vedno delujejo (link), je hospitalizacij vseeno precej manj. To bi pojasnilo tudi relativno hiter upad dosedanjih omikron valov. Pojasnilo bi tudi negativno korelacijo zaščite od cepljenja in incidence okužb med cepljenimi (na Danskem je pogostost okužb med cepljenimi proporcionalno višja kot med necepljenimi!). Kot rečeno, o tej varianti šele razmišljam in vanjo (še) nisem prepričan.
Pri nas čakamo, kdaj bo omikron zavzel pomemben delež okužb. Naše inštitucije spet poročajo za 2 tedna nazaj (opisujejo nam prazgodovino namesto sedanjosti), in bodo našle opazen delež omikrona, ko bo pri nas omikron vala že konec (pikra šala, no, ali pa sploh ni šala). Ne delajo sproti SGTF PCR proxy testa ne velikem delu vzorcev kot to delajo drugje. 21.12. je bil podatek o 51 odkritih omikron vzorcih, in to praktično v vseh regijah. Kot sem dejal prej, do 17.12. omikron še ni zavzel 10% deleža novih okužb. Po podatkih iz 21.12. sklepam, da smo dne 22.10. že bili pri okoli 10% od vseh novih prenosov okužb. Sklepam, da se bo na številu novih primerov sprememba začela kazati že tik pred Božičem, potem pa zna krivulja R do novega leta že močno poskočiti. Sklepam, da bo okoli 10.1. že vrh omikron vala pri nas, in da bo dnevno po največ okoli 3000-4000 novih primerov. Ker ne poznamo niti točnih karakteristik virusa, niti ne točnega obsega virusa pri nas, so vse to trenutno le zelo približne ocene. Seveda, na krivulje hospitalizacij in smrti bo omikron vplival pozneje, kot pa na krivuljo novih primerov.

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram novoletni porast R za 0.22 in potem še njegov padec nazaj za 0.17. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra do decembra zaradi 3. odmerkov narasla na preko 60%. Opozorilo: zaradi prihajajoče variante omikron bo krivulja primerov v januarju verjetno povsem drugačna. Trenutno je še ni možno kvalitetno izrisati.

Laboratoriji so v delta valu zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1.
Gledano brez omikrona pa epidemija upada solidno hitro, R je že od konca novembra v okolici 0.75-0.80. Zdaj vreme lahko prestavlja R malce gor/dol, mišljeno je bilo tudi do 0.85. Dejansko pa nam v zadnjem času R virtualno dviguje vse večji obseh hitrega testiranja, ki je povprečno že preko 80k/dan. 17.12. je bilo tako s hitrimi testi pretestiranega 5% prebivalstva!! Približno tak nivo padanja epidemije bi se brez omikrona obdržal kar skoraj do sredine januarja, razen od Božiča do prvega tedna januarja, ko bi bil nekoliko višji.
Omikron pa zdaj riše svoje krivulje ne oziraje se na našo zgodovino in naše želje. Krivuljo R bo kot kaže zelo verjetno dvignil že pred novim letom …

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, že dolgo se vidi da izgleda okoli 1300.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Tudi višje starostne skupine imajo lepo padanje …
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja. Podobno 75-84 let. Verjetno je to popuščanje že pokrito s tretjimi odmerki, ki so že nekje na 40%.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

četrtek 23.12.2021 ob 00:55 … preview: (zaenkrat samo pogled na včeraj izdane TAN kode – 999 kod (217 ali 18% manj kot prejšnjo sredo!), izgleda bo okoli 1100/4500 …)

sreda 22.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, dominira: JAR, VB, Danska, Norvveška, USA, v JAR in VB že smrti
zadnje dni kar ni informacij o polnjenju bolnišnic zaradi omikrona, to je zelo dobro! do konca tedna bomo lahko z gotovostjo kaj povedali …
koliko je omikrona pri nas se ne ve točno, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
včeraj je naš prvi epidemiolog iz žepa potegnil listek, da smo (verjetno SGTF proxy testi) odkrili že 51 primerov omikrona, in da so praktično v vseh regijah (splošno dostopnih javnih podatkov ni)
glede na zadnje podatke predvidevam dvig krivulje izmerjenega R (za teden nazaj) v dneh točno okoli Božiča, vrh primerov pa verjetno do 10.1.2022, sklepam da nižji kot kje drugod
R=0.88, po 10.12. imamo rahel virtualen porast zaradi večanja obsega HAT testiranja (17.12. 5% populacije v enem dnevu!!!)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1153 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1145
6/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90.1% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 89%, 65-69: 91%, 70-74: 94%, 75-79: 93%, 80-84: 93%, 85-89: 93%; 90+: 93%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 38/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 9-10/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 37 dni
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 30.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 23.12., stanje 31.12.: 165, <150 4.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1093 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750

Omikron
Glavna tema zdaj je prihajajoča različica virusa omikron. Spremljamo njeno hitro širjenje najprej v Južni Afriki, potem pa že v VB, ter na Danskem in Norveškem. Vse te države so imele v tem času bolj slabo kontrolo superprenašalskih dogodkov. Situacija v teh državah ni neposredno primerljiva, edino mogoče med Dansko in Norveško. Zato bom Norveško izpustil. Dominira tudi že v ameriški zvezni državi Washington, Nizozemska šla v lockdown, Izrael sprejema ukrepe, ….
JAR ima mlado populacijo, visoko prekuženo z beto in delto, ter precej slabo precepljeno populacijo. Omikron se tam širi že od konca novembra. Zdaj se že dogajajo hospitalizacije in tudi že nekaj smrti, do 17.12. je bilo 56 smrti. Podatki kažejo, da je hospitalizacij in smrti malo. A populacija je mlada in ne smemo prehitro sklepati na bolj blago bolezen.
V VB se omikron pospešeno širi od začetka decembra. V Londonu je omikron zadominiral že v sredini decembra. Pričakujejo več stotisoč dnevnih okužb. VB ima starejšo populacijo, ki je tudi zelo solidno prekužena z alfo in delto, predvsem pa je izredno dobro precepljena. So mojstri v obdelavi podatkov in stanje pri njih do Božiča bo že marsikaj povedalo. 20.12. zjutraj: 104 omikron hospitalizacije in 12 omikron smrti.
Tudi na Danskem omikron že dominira. Danska je slabo prekužena, a visoko precepljena. Spet nazaj uvajajo omejitve, ker vedo, da je zaščita od cepljenja nekaj manj kvalitetna od tiste prebolevnikov.
R0 omikrona še ni določen. Hitrost opazovanega širjenja sugerira R0 višji od R0 delte, a ni tako preprosto. Ta hitrost je lahko tudi posledica dokazane moči imunskega pobega omikrona (ima ranga 30 mutacij na S proteinu), in pa superprenašalskih dogodkov. Raziskava iz Hong Konga pravijo, da se omikron v bronhijih človeka 70x hitreje širi, kot delta. Podobno je potrdila tudi britanska raziskava. To bi tudi govorilo v prid R0 višjega od delte. Širjenje v teh državah tudi ni več le med mlajšo populacijo, in tudi se ne poroča o nekih masovnih reinfekcijah (možnost naj bi bila 5x višja kot pri delti). Vse to trenutno res govori v prid, da ima omikron višji R0 od delte. To bi potem impliciralo, da bo omikron v kratkem izpodrinil delto, tega pa na podatkih še nismo dokazali.
Teža bolezni, ki jo povzroča omikron, naj bi po prvih informacijah iz JAR bila nižja. A tam so visoko prekuženi in mladi in ne smemo prehitro sklepati. Bolj točno bo to pokazala situacija v VB. Sklepam, da bomo že na podatkih iz VB bolnišnic do Božiča veliko vedeli na to temo, do novega leta pa že skoraj vse. Če bi bila bolezen od omikrona res blažja, in bi omikron izpodrinil delto, potem bi to lahko bilo kar lepo Božično darilo z neba. Zbiramo podatke naprej.
Sumim, da je omikron našel neko vrrsto “niše” in jo s svojo visoko kužnostjo hitro preplavi. Zato hitra rast primerov in nato hiter upad. Ta niša je verjetno v največji meri med cepljenimi, delno pa tudi med prebolevniki.
Pri nas čakamo, kdaj bo omikron zavzel pomemben delež okužb. Naše inštitucije spet poročajo za 2 tedna nazaj (opisujejo nam prazgodovino namesto sedanjosti), in bodo našle opazen delež omikrona, ko bo pri nas omikron vala že konec (pikra šala, no, ali pa sploh ni šala). Ne delajo sproti SGTF PCR proxy testa ne velikem delu vzorcev kot to delajo drugje. 21.12. je bil podatek o 51 odkritih omikron vzorcih, in to praktično v vseh regijah. Kot sem dejal prej, do 17.12. omikron še ni zavzel 10% deleža novih okužb. Po podatkih iz 21.12. sklepam, da smo danes 22.10. že pri okoli 10% od vseh novih prenosov okužb. Sklepam, da se bo na številu novih primerov sprememba začela kazati že tik pred Božičem, potem pa zna krivulja R do novega leta že močno poskočiti. Sklepam, da bo okoli 10.1. že vrh omikron vala pri nas, in da bo dnevno po največ okoli 3000-4000 novih primerov. Ker ne poznamo niti točnih karakteristik virusa, niti ne točnega obsega virusa pri nas, so vse to trenutno le zelo približne ocene. Seveda, na krivulje hospitalizacij in smrti bo omikron vplival pozneje, kot pa na krivuljo novih primerov.

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram novoletni porast R za 0.22 in potem še njegov padec nazaj za 0.17. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra do decembra zaradi 3. odmerkov narasla na preko 60%. Opozorilo: zaradi prihajajoče variante omikron bo krivulja primerov v januarju verjetno povsem drugačna. Trenutno je še ni možno kvalitetno izrisati.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1.
Gledano brez omikrona pa epidemija upada solidno hitro, R je že od konca novembra v okolici 0.75-0.80. Zdaj vreme lahko prestavlja R malce gor/dol, mišljeno je bilo tudi do 0.85. Dejansko pa nam v zadnjem času R virtualno dviguje vse večji obseh hitrega testiranja, ki je povprečno že preko 80k/dan. 17.12. je bilo tako s hitrimi testi pretestiranega 5% prebivalstva!! Približno tak nivo padanja epidemije bi se brez omikrona obdržal kar skoraj do sredine januarja, razen od Božiča do prvega tedna januarja, ko bi bil nekoliko višji.
Omikron pa zdaj riše svoje krivulje ne oziraje se na našo zgodovino in naše želje. Krivuljo R bo kot kaže zelo verjetno dvignil že pred novim letom …

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, že dolgo se vidi da izgleda okoli 1300.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Tudi višje starostne skupine imajo lepo padanje …
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja. Podobno 75-84 let. Verjetno je to popuščanje že pokrito s tretjimi odmerki, ki so že nekje na 40%.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

torek 21.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, dominira: JAR, London, Danska, Washington, Norvveška(?), v JAR in VB že smrti
zadnje dni kar ni informacij o polnjenju bolnišnic zaradi omikrona, to je zelo dobro! do konca tedna bomo lahko z gotovostjo kaj povedali …
koliko je omikrona pri nas se ne ve točno, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
včeraj je naš prvi epidemiolog iz žepa potegnil listek, da smo (verjetno SGTF proxy testi) odkrili že 51 primerov omikrona, in da so praktično v vseh regijah
glede na zadnje podatke predvidevam dvig krivulje izmerjenega R (za teden nazaj) v dneh točno okoli Božiča, vrh primerov pa verjetno do 10.1.2022, sklepam da nižji kot kje drugod
R=0.88, rahel virtualen porast zaradi večanja obsega HAT testiranja (17.12. 5% populacije v enem dnevu!!!)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1192 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1186
9/1 SLO/EU zelenih občin, 3/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 90.0% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 89%, 65-69: 91%, 70-74: 94%, 75-79: 93%, 80-84: 93%, 85-89: 93%; 90+: 93%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 39/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 10/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 37 dni
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 29.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 23.12., <100 26.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1087 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750

ponedeljek 20.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, dominira: JAR, London, Danska, Washington, Norvveška(?), v JAR in VB že smrti
koliko je omikrona pri nas se ne ve točno, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
omikron večjega vpliva na naše krivulje do konca leta morda še ne bo imel, morda tudi do sredine januarja ne, lahko pa je že po novem letu hud val
R=0.87, rahel virtualen porast zaradi večanja obsega HAT testiranja (17.12. 5% populacije v enem dnevu!!!)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1214 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1209
4/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.9% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 89%, 65-69: 91%, 70-74: 93%, 75-79: 93%, 80-84: 93%, 85-89: 93%; 90+: 93%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 41/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 10/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 35 dni
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 29.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 23.12., <100 27.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1081 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750

Omikron
Glavna tema zdaj je prihajajoča različica virusa omikron. Spremljamo njeno hitro širjenje najprej v Južni Afriki, potem pa že v VB, ter na Danskem in Norveškem. Vse te države so imele v tem času bolj slabo kontrolo superprenašalskih dogodkov. Situacija v teh državah ni neposredno primerljiva, edino mogoče med Dansko in Norveško. Zato bom Norveško izpustil. Dominira tudi že v ameriški zvezni državi Washington, Nizozemska šla v lockdown, Izrael sprejema ukrepe, ….
JAR ima mlado populacijo, visoko prekuženo z beto in delto, ter precej slabo precepljeno populacijo. Omikron se tam širi že od konca novembra. Zdaj se že dogajajo hospitalizacije in tudi že nekaj smrti, do 17.12. je bilo 56 smrti. Podatki kažejo, da je hospitalizacij in smrti malo. A populacija je mlada in ne smemo prehitro sklepati na bolj blago bolezen.
V VB se omikron pospešeno širi od začetka decembra. V Londonu je omikron zadominiral že v sredini decembra. Pričakujejo več stotisoč dnevnih okužb. VB ima starejšo populacijo, ki je tudi zelo solidno prekužena z alfo in delto, predvsem pa je izredno dobro precepljena. So mojstri v obdelavi podatkov in stanje pri njih do Božiča bo že marsikaj povedalo. 20.12. zjutraj: 104 omikron hospitalizacije in 12 omikron smrti.
Na Danskem je omikron tudi tik pred dominacijo. Danska je slabo prekužena, a visoko precepljena. Spet nazaj uvajajo omejitve, ker vedo, da je zaščita od cepljenja nekaj manj kvalitetna od tiste prebolevnikov.
R0 omikrona še ni določen. Hitrost opazovanega širjenja sugerira R0 višji od R0 delte, a ni tako preprosto. Ta hitrost je lahko tudi posledica dokazane moči imunskega pobega omikrona (ima ranga 30 mutacij na S proteinu), in pa superprenašalskih dogodkov. Raziskava iz Hong Konga pravijo, da se omikron v bronhijih človeka 70x hitreje širi, kot delta. Podobno je potrdila tudi britanska raziskava. To bi tudi govorilo v prid R0 višjega od delte. Širjenje v teh državah tudi ni več le med mlajšo populacijo, in tudi se ne poroča o nekih masovnih reinfekcijah (možnost naj bi bila 5x višja kot pri delti). Vse to trenutno res govori v prid, da ima omikron višji R0 od delte. To bi potem impliciralo, da bo omikron v kratkem izpodrinil delto, tega pa na podatkih še nismo dokazali.
Teža bolezni, ki jo povzroča omikron, naj bi po prvih informacijah iz JAR bila nižja. A tam so visoko prekuženi in mladi in ne smemo prehitro sklepati. Bolj točno bo to pokazala situacija v VB. Sklepam, da bomo že na podatkih iz VB bolnišnic do Božiča veliko vedeli na to temo, do novega leta pa že skoraj vse. Če bi bila bolezen od omikrona res blažja, in bi omikron izpodrinil delto, potem bi to lahko bilo kar lepo Božično darilo z neba. Zbiramo podatke naprej.
Pri nas čakamo, kdaj bo omikron zavzel pomemben delež okužb. Naše inštitucije spet poročajo za 2 tedna nazaj (opisujejo nam prazgodovino namesto sedanjosti), in bodo našle opazen delež omikrona, ko bo pri nas omikron vala že konec (pikra šala). Ne delajo sproti SGTF PCR proxy testa ne velikem delu vzorcev kot to delajo drugje. Sklepam, da do 17.12. omikron še ni zavzel 10% deleža novih okužb. Ko bo to presegel, bo verjetno že v enem tednu postal dominantna različica virusa in takrat bodo naše krivulje močno poskočile. Ker ne poznamo niti karakteristik virusa, niti obsega virusa pri nas, trenutno še ni možno povedati, kdaj se bo omikron val pri nas zares začel. Lahko je jutri, lahko pa po novem letu. V tej luči je tudi potrebno gledati vse krivulje na teh straneh. Seveda, na krivulje hospitalizacij in smrti bo omikron vplival pozneje, kot pa na krivuljo novih primerov.

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram novoletni porast R za 0.22 in potem še njegov padec nazaj za 0.17. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra do decembra zaradi 3. odmerkov narasla na preko 60%. Opozorilo: zaradi prihajajoče variante omikron bo krivulja primerov v januarju verjetno povsem drugačna. Trenutno je še ni možno kvalitetno izrisati.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1.
Gledano brez omikrona pa epidemija upada solidno hitro, R je že od konca novembra v okolici 0.75-0.80. Zdaj vreme lahko prestavlja R malce gor/dol, mišljeno je bilo tudi do 0.85. Dejansko pa nam v zadnjem času R virtualno dviguje vse večji obseh hitrega testiranja. 17.12. je bilo tako s hitrimi testi pretestiranega 5% prebivalstva!! Približno tak nivo padanja epidemije bi se brez omikrona obdržal kar skoraj do sredine januarja, razen od Božiča do prvega tedna januarja, ko bo nekoliko višji.
Kot rečeno bo vse spremenila varianta omikron, a o njej zaenkrat še ni zanesljivih informacij. Spremljamo na polno. V Londonu že dominira, skoraj tudi že na Danskem, počasi prihajajo vse bolj kvalitetne informacije tudi iz tamkajšnjih bolnišnic. Na krivuljah pri nas se omikron skoraj zagotovo ne bo poznal vsaj do Božiča, morda do konca decembra. Bil sem prepričan, da tudi ne vsaj do sredine januarja, a po zadnjih informacijah o prisotnosti omikrona v Sloveniji že konec novembra zdaj nisem več. Vse bolj verjeten postaja scenarij glavnine omikron vala v Sloveniji januarja. Še vedno pa je možno, da bo to kasneje, spremljamo naprej. Glavno bo zdaj v naslednjem tednu dobiti zanesljive podatke iz britanskih bolnišnic o tem, če omikron zares povzroča blažjo bolezen oziroma manj hospitalizacij.

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1300.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 12. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

nedelja 19.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, dominira: JAR, London, Danska, Washington, Norvveška(?), v JAR že smrti, VB 20 smrti
koliko je omikrona pri nas se ne ve točno, naše inštitucije ne delajo dovolj SGTF proxy PCR testov in gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
omikron večjega vpliva na naše krivulje do konca leta morda še ne bo imel, morda tudi do sredine januarja ne, lahko pa je že po novem letu hud val
R=0.87, rahel virtualen porast zaradi večanja obsega HAT testiranja (17.12. 5% populacije v enem dnevu!!!)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1227 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1222
4/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.8% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 89%, 65-69: 91%, 70-74: 93%, 75-79: 93%, 80-84: 93%, 85-89: 92%; 90+: 93%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 43/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 11/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 35 dni, pod 1000 24.12. (brez omikrona!)
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 28.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 22.12., <100 21.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1071 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750

Omikron
Glavna tema zdaj je prihajajoča različica virusa omikron. Spremljamo njeno hitro širjenje najprej v Južni Afriki, potem pa že v VB, ter na Danskem in Norveškem. Vse te države so imele v tem času bolj slabo kontrolo superprenašalskih dogodkov. Situacija v teh državah ni neposredno primerljiva, edino mogoče med Dansko in Norveško. Zato bom Norveško izpustil. Dominira tudi že v ameriški zvezni državi Washington.
JAR ima mlado populacijo, visoko prekuženo z beto in delto, ter precej slabo precepljeno populacijo. Omikron se tam širi že od konca novembra. Zdaj se že dogajajo hospitalizacije in tudi že nekaj smrti, do 17.12. je bilo 56 smrti. Podatki kažejo, da je hospitalizacij in smrti malo. A populacija je mlada in ne smemo prehitro sklepati na bolj blago bolezen.
V VB se omikron pospešeno širi od začetka decembra. V Londonu je omikron zadominiral že v sredini decembra. Pričakujejo več stotisoč dnevnih okužb. VB ima starejšo populacijo, ki je tudi zelo solidno prekužena z alfo in delto, predvsem pa je izredno dobro precepljena. So mojstri v obdelavi podatkov in stanje pri njih do Božiča bo že marsikaj povedalo. Do 19.12. so že imeli 20 covid smrti.
Na Danskem je omikron tudi tik pred dominacijo. Danska je slabo prekužena, a visoko precepljena. Spet nazaj uvajajo omejitve, ker vedo, da je zaščita od cepljenja nekaj manj kvalitetna od tiste prebolevnikov.
R0 omikrona še ni določen. Hitrost opazovanega širjenja sugerira R0 višji od R0 delte, a ni tako preprosto. Ta hitrost je lahko tudi posledica dokazane moči imunskega pobega omikrona (ima ranga 30 mutacij na S proteinu), in pa superprenašalskih dogodkov. Raziskava iz Hong Konga pravijo, da se omikron v bronhijih človeka 70x hitreje širi, kot delta. Podobno je potrdila tudi britanska raziskava. To bi tudi govorilo v prid R0 višjega od delte. Širjenje v teh državah tudi ni več le med mlajšo populacijo, in tudi se ne poroča o nekih masovnih reinfekcijah (možnost naj bi bila 5x višja kot pri delti). Vse to trenutno res govori v prid, da ima omikron višji R0 od delte. To bi potem impliciralo, da bo omikron v kratkem izpodrinil delto, tega pa na podatkih še nismo dokazali.
Teža bolezni, ki jo povzroča omikron, naj bi po prvih informacijah iz JAR bila nižja. A tam so visoko prekuženi in mladi in ne smemo prehitro sklepati. Bolj točno bo to pokazala situacija v VB. Sklepam, da bomo že na podatkih iz VB bolnišnic do Božiča veliko vedeli na to temo, do novega leta pa že skoraj vse. Če bi bila bolezen od omikrona res blažja, in bi omikron izpodrinil delto, potem bi to lahko bilo kar lepo Božično darilo z neba. Zbiramo podatke naprej.
Pri nas čakamo, kdaj bo omikron zavzel pomemben delež okužb. Naše inštitucije spet poročajo za 2 tedna nazaj (opisujejo nam prazgodovino namesto sedanjosti), in bodo našle opazen delež omikrona, ko bo pri nas omikron vala že konec (pikra šala). Ne delajo sproti SGTF PCR proxy testa ne velikem delu vzorcev kot to delajo drugje. Sklepam, da do 17.12. omikron še ni zavzel 10% deleža novih okužb. Ko bo to presegel, bo verjetno že v enem tednu postal dominantna različica virusa in takrat bodo naše krivulje močno poskočile. Ker ne poznamo niti karakteristik virusa, niti obsega virusa pri nas, trenutno še ni možno povedati, kdaj se bo omikron val pri nas zares začel. Lahko je jutri, lahko pa po novem letu. V tej luči je tudi potrebno gledati vse krivulje na teh straneh. Seveda, na krivulje hospitalizacij in smrti bo omikron vplival pozneje, kot pa na krivuljo novih primerov.

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram novoletni porast R za 0.22 in potem še njegov padec nazaj za 0.17. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra do decembra zaradi 3. odmerkov narasla na preko 60%. Opozorilo: zaradi prihajajoče variante omikron bo krivulja primerov v januarju verjetno povsem drugačna. Trenutno je še ni možno kvalitetno izrisati.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1.
Gledano brez omikrona pa epidemija upada solidno hitro, R je že od konca novembra v okolici 0.75-0.80. Zdaj vreme lahko prestavlja R malce gor/dol, mišljeno je bilo tudi do 0.85. Dejansko pa nam v zadnjem času R virtualno dviguje vse večji obseh hitrega testiranja. 17.12. je bilo tako s hitrimi testi pretestiranega 5% prebivalstva!! Približno tak nivo padanja epidemije bi se brez omikrona obdržal kar skoraj do sredine januarja, razen od Božiča do prvega tedna januarja, ko bo nekoliko višji .
Kot rečeno bo vse spremenila varianta omikron, a o njej zaenkrat še ni zanesljivih informacij. Spremljamo na polno. V Londonu že dominira, skoraj tudi že na Danskem, počasi prihajajo vse bolj kvalitetne informacije tudi iz tamkajšnjih bolnišnic. Na krivuljah pri nas se omikron skoraj zagotovo ne bo poznal vsaj do Božiča, morda do konca decembra. Bil sem prepričan, da tudi ne vsaj do sredine januarja, a po zadnjih informacijah o prisotnosti omikrona v Sloveniji že konec novembra zdaj nisem več. Vse bolj verjeten postaja scenarij omikron vala v Sloveniji januarja. Še vedno pa je možno, da bo to kasneje, spremljamo naprej. Glavno bo zdaj v naslednjem tednu dobiti zanesljive podatke iz britanskih bolnišnic o tem, če omikron zares povzroča blažjo bolezen oziroma manj hospitalizacij.

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno), povečevanje obsega HAT testiranja in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1300.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ni narastel nad 30%, kar me je rahlo presenečalo. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

sobota 18.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v zadnjih dneh (še) ni predvidenega padanja R proti 0.75, razlog ni podcenjevanje veselega decembra niti omikron (od 14.12.2021 uradno pri nas), ampak večanje obsega HAT testiranja
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, v Londonu že dominira, na Danskem skoraj, v JAR so že smrti
omikron imamo že tudi mi 1-2 tedna (o tem sem pisal v zadnjih analizah) – naše inštitucije gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
omikron večjega vpliva na naše krivulje do konca leta verjetno ne bo imel, morda tudi do sredine januarja ne, lahko pa je že po novem letu hud val
R=0.85, rahel virtualen porast zaradi večanja obsega HAT testiranja (17.12. 5% populacije v enem dnevu!!!)
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1230 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1225
7/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.8% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 89%, 65-69: 91%, 70-74: 93%, 75-79: 93%, 80-84: 93%, 85-89: 92%; 90+: 92%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 45/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 11/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 29 dni, pod 1000 21.12. (brez omikrona!)
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 27.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 24.12., <100 17.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1058 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 12. januar 2021 (brez omikrona)

Omikron
Glavna tema zdaj je prihajajoča različica virusa omikron. Spremljamo njeno hitro širjenje najprej v Južni Afriki, potem pa že v VB, ter na Danskem in Norveškem. Vse te države so imele v tem času bolj slabo kontrolo superprenašalskih dogodkov. Situacija v teh državah ni neposredno primerljiva, edino mogoče med Dansko in Norveško. Zato bom Norveško izpustil.
JAR ima mlado populacijo, visoko prekuženo z beto in delto, ter precej slabo precepljeno populacijo. Omikron se tam širi že od konca novembra. Zdaj se že dogajajo hospitalizacije in tudi že nekaj smrti. Podatki kažejo, da je hospitalizacij in smrti malo. A populacija je mlada in ne smemo prehitro sklepati na bolj blago bolezen.
V VB se omikron pospešeno širi od začetka decembra. V Londonu je omikron zadominiral že v sredini decembra. Pričakujejo več stotisoč dnevnih okužb. VB ima starejšo populacijo, ki je tudi zelo solidno prekužena z alfo in delto, predvsem pa je izredno dobro precepljena. So mojstri v obdelavi podatkov in stanje pri njih do Božiča bo že marsikaj povedalo.
Na Danskem je omikron tudi tik pred dominacijo. Danska je slabo prekužena, a visoko precepljena. Spet nazaj uvajajo omejitve, ker vedo, da je zaščita od cepljenja nekaj manj kvalitetna od tiste prebolevnikov.
R0 omikrona še ni določen. Hitrost opazovanega širjenja sugerira R0 višji od R0 delte, a ni tako preprosto. Ta hitrost je lahko tudi posledica dokazane moči imunskega pobega omikrona (ima ranga 30 mutacij na S proteinu), in pa superprenašalskih dogodkov. Raziskave pravijo, da se omikron v bronhijih človeka 70x hitreje širi, kot delta. To bi tudi govorilo v prid R0 višjega od delte. Širjenje v teh državah tudi ni več le med mlajšo populacijo, in tudi se ne poroča o nekih masovnih reinfekcijah (možnost naj bi bila 5x višja kot pri delti). Vse to trenutno res govori v prid, da ima omikron višji R0 od delte. To bi potem impliciralo, da bo omikron v kratkem izpodrinil delto, tega pa na podatkih še nismo dokazali.
Teža bolezni, ki jo povzroča omikron, naj bi po prvih informacijah iz JAR bila nižja. A tam so visoko prekuženi in mladi in ne smemo prehitro sklepati. Bolj točno bo to pokazala situacija v VB. Sklepam, da bomo že na podatkih iz VB bolnišnic do Božiča veliko vedeli na to temo, do novega leta pa že skoraj vse. Če bi bila bolezen od omikrona res blažja, in bi omikron izpodrinil delto, potem bi to lahko bilo kar lepo Božično darilo z neba. Zbiramo podatke naprej.
Pri nas čakamo, kdaj bo omikron zavzel pomemben delež okužb. Naše inštitucije spet poročajo za 2 tedna nazaj (opisujejo nam prazgodovino namesto sedanjosti), in bodo našle opazen delež omikrona, ko bo pri nas omikron vala že konec (pikra šala). Sklepam, da do 17.12. omikron še ni zavzel 10% deleža novih okužb. Ko bo to presegel, bo verjetno že v enem tednu postal dominantna različica virusa in takrat bodo naše krivulje močno poskočile. Ker ne poznamo niti karakteristik virusa, niti obsega virusa pri nas, trenutno še ni možno povedati, kdaj se bo omikron val pri nas zares začel. Lahko je jutri, lahko pa po novem letu. V tej luči je tudi potrebno gledati vse krivulje na teh straneh. Seveda, na krivulje hospitalizacij in smrti bo omikron vplival pozneje, kot pa na krivuljo novih primerov.

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram novoletni porast R za 0.22 in potem še njegov padec nazaj za 0.17. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra do decembra zaradi 3. odmerkov narasla na preko 60%. Opozorilo: zaradi prihajajoče variante omikron bo krivulja primerov v januarju verjetno povsem drugačna. Trenutno je še ni možno kvalitetno izrisati.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Smo v pričakovanju pohoda omikrona, ko nam bo R hitro narastel krepko preko 1.
Gledan brez omikrona pa epidemija upada solidno hitro, R je že od konca novembra v okolici 0.75-0.80. Zdaj vreme lahko prestavlja R malce gor/dol, mišljeno je bilo tudi do 0.85. Dejansko pa nam v zadnjem času R virtualno dviguje vse večji obseh hitrega testiranja. 17.12. je bilo tako s hitrimi testi pretestiranega 5% prebivalstva!! Približno tak nivo padanja epidemije bi se brez omikrona obdržal kar skoraj do sredine januarja, razen od Božiča do prvega tedna januarja, ko bo nekoliko višji .
Kot rečeno bo vse spremenila varianta omikron, a o njej zaenkrat še ni zanesljivih informacij. Spremljamo na polno. V Londonu že dominira, skoraj tudi že na Danskem, počasi prihajajo vse bolj kvalitetne informacije tudi iz tamkajšnjih bolnišnic. Na krivuljah pri nas se omikron skoraj zagotovo ne bo poznal vsaj do Božiča, morda do konca decembra. Bil sem prepričan, da tudi ne vsaj do sredine januarja, a po zadnjih informacijah o prisotnosti omikrona v Sloveniji že konec novembra zdaj nisem več. Vse bolj verjeten postaja scenarij omikron vala v Sloveniji januarja. Še vedno pa je možno, da bo to kasneje, spremljamo naprej. Glavno bo zdaj v naslednjem tednu dobiti zanesljive podatke iz britanskih bolnišnic o tem, če omikron zares povzroča blažjo bolezen oziroma manj hospitalizacij.

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno) in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1300.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ni narastel nad 30%, kar me je rahlo presenečalo. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Tudi višje starostne skupine imajo lepo padanje …
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja. Podobno 75-84 let. Verjetno je to popuščanje že pokrito s tretjimi odmerki, ki so že nekje na 40%.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

petek 17.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v zadnjih dneh (še) ni predvidenega padanja R proti 0.75, razlog je lahko podcenjevanje veselega decembra z moje strani, lahko pa omikron, ki od 14.12.2021 uradno je pri nas
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, v Londonu že dominira, na Danskem skoraj, v JAR že 56 smrti
omikron imamo že tudi mi 1-2 tedna (o tem sem pisal v zadnjih analizah) – naše inštitucije gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
omikron večjega vpliva na naše krivulje do konca leta verjetno ne bo imel, morda tudi do sredine januarja ne, lahko pa je že po novem letu hud val
R=0.83, v zadnjem dnevu porast, morda že zaradi omikrona ali pa veselega decembra
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1257 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1253
4/2 SLO/EU zelenih občin, 2/2/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.6% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 88%, 65-69: 90%, 70-74: 93%, 75-79: 92%, 80-84: 92%, 85-89: 92%; 90+: 92%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 50/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 11/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 26 dni, pod 1000 20.12. (brez omikrona!)
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 29.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 23.12., <100 25.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1039 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 8. januar 2021 (brez omikrona)

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram novoletni porast R za 0.22 in potem še njegov padec nazaj za 0.17. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra do decembra zaradi 3. odmerkov narasla na preko 60%. Opozorilo: zaradi prihajajoče variante omikron bo krivulja primerov v januarju verjetno povsem drugačna. Trenutno je še ni možno kvalitetno izrisati.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija upada solidno hitro, R je že od konca novembra v okolici 0.75-0.80. Zdaj vreme lahko prestavlja R malce gor/dol, mišljeno je bilo tudi do 0.85 a se (še) ni zgodilo. Približno tak nivo padanja epidemije se bo izgleda obdržal kar skoraj do sredine januarja, razen od Božiča do prvega tedna januarja, ko bo nekoliko višji .
Prekuževanje še vedno poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prešli smo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi ostaja v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ni prineslo. Nekaj ga nedvomno je, saj zaradi tega naš R ni padal še hitreje. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Vse lahko spremeni varianta omikron, a o njej zaenkrat še ni zanesljivih informacij. Spremljamo na polno. V Londonu že dominira, skoraj tudi že na Danskem, počasi prihajajo vse bolj kvalitetne informacije tudi iz tamkajšnjih bolnišnic. Na krivuljah pri nas se omikron skoraj zagotovo ne bo poznal vsaj do Božiča, morda do konca decembra. Bil sem prepričan, da tudi ne vsaj do sredine januarja, a po zadnjih informacijah o prisotnosti omikrona v Sloveniji že konec novembra zdaj nisem več. Vse bolj verjeten postaja scenarij omikron vala v Sloveniji januarja. Še vedno pa je možno, da bo to kasneje, spremljamo naprej.

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno) in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1300.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ni narastel nad 30%, kar me je rahlo presenečalo. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

četrtek 16.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v zadnjih dneh (še) ni predvidenega padanja R proti 0.75, razlog je lahko podcenjevanje veselega decembra z moje strani, lahko pa omikron, ki od 14.12.2021 uradno je pri nas
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, v Londonu že dominira, na Danskem skoraj
omikron imamo že tudi mi 1-2 tedna (o tem sem pisal v zadnjih analizah) – naše inštitucije gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
omikron večjega vpliva na naše krivulje do konca leta verjetno ne bo imel, morda tudi do sredine januarja ne, lahko pa je že po novem letu hud val
R=0.80, izgledi so do sredine decembra v območju okoli 0.80, potem rahlo upadanje proti 0.75 (to bomo še videli), trenutni razpolovni čas novih primerov je 22 dni
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 10%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1263 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1258
7/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.5% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 88%, 65-69: 90%, 70-74: 93%, 75-79: 92%, 80-84: 92%, 85-89: 92%; 90+: 92%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 50/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 12/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 22 dni, pod 1000 19.12. (brez omikrona!)
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 28.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 22.12., <100 20.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1027 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 5. januar 2021

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram novoletni porast R za 0.22 in potem še njegov padec nazaj za 0.17. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra do decembra zaradi 3. odmerkov narasla na preko 60%. Opozorilo: zaradi prihajajoče variante omikron bo krivulja primerov v januarju verjetno povsem drugačna. Trenutno je še ni možno ne da kvalitetno izrisati.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija upada solidno hitro, R je že od konca novembra v okolici 0.75-0.80. Zdaj vreme lahko prestavlja R malce gor/dol, mišljeno je bilo tudi do 0.85 a se (še) ni zgodilo. Približno tak nivo padanja epidemije se bo izgleda obdržal kar skoraj do sredine januarja, razen od Božiča do prvega tedna januarja, ko bo nekoliko višji .
Prekuževanje še vedno poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prešli smo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi ostaja v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ni prineslo. Nekaj ga nedvomno je, saj zaradi tega naš R ni padal še hitreje. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Vse lahko spremeni varianta omikron, a o njej zaenkrat še ni zanesljivih informacij. Spremljamo na polno. V Londonu že dominira, skoraj tudi že na Danskem, počasi prihajajo vse bolj kvalitetne informacije tudi iz tamkajšnjih bolnišnic. Na krivuljah pri nas se omikron skoraj zagotovo ne bo poznal vsaj do Božiča, morda do konca decembra. Bil sem prepričan, da tudi ne vsaj do sredine januarja, a po zadnjih informacijah o prisotnosti omikrona v Sloveniji že konec novembra zdaj nisem več. Vse bolj verjeten postaja scenarij omikron vala v Sloveniji januarja. Še vedno pa je možno, da bo to kasneje, spremljamo naprej.

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno) in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je že čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1300.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ni narastel nad 30%, kar me je rahlo presenečalo. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Tudi višje starostne skupine imajo lepo padanje …
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja. Podobno 75-84 let. Verjetno je to popuščanje že pokrito s tretjimi odmerki, ki so že nekje na 40%.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

sreda 15.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v zadnjih dneh (še) ni predvidenega padanja R proti 0.75, razlog je lahko podcenjevanje veselega decembra z moje strani, lahko pa omikron, ki od 14.12.2021 uradno je pri nas
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, v Londonu že dominira
omikron imamo že tudi mi 1-2 tedna (o tem sem pisal v zadnjih analizah) – naše inštitucije gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
omikron večjega vpliva na naše krivulje do konca leta zelo verjetno ne bo imel, morda tudi do sredine januarja ne, lahko pa je že po novem letu hud val
R=0.80, izgledi so do sredine decembra v območju okoli 0.80, potem rahlo upadanje proti 0.75 (to bomo še videli), trenutni razpolovni čas novih primerov je 22 dni
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 20%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1312 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1307
4/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.4% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 88%, 65-69: 90%, 70-74: 92%, 75-79: 92%, 80-84: 92%, 85-89: 92%; 90+: 92%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 50-55/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 13/dan, smo že krepko čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 22 dni, pod 1000 20.12.
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 28.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 21.12., <100 20.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1011 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 5. januar 2021

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram novoletni porast R za 0.22 in potem še njegov padec nazaj za 0.17. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra do decembra zaradi 3. odmerkov narasla na preko 60%.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija upada solidno hitro, R je že od konca novembra v okolici 0.75-0.80. Zdaj vreme lahko prestavlja R malce gor/dol, mišljeno je bilo tudi do 0.85 a se (še) ni zgodilo. Približno tak nivo padanja epidemije se bo izgleda obdržal kar skoraj do sredine januarja, razen od Božiča do prvega tedna januarja, ko bo nekoliko višji .
Prekuževanje še vedno poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prešli smo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi ostaja v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ni prineslo. Nekaj ga nedvomno je, saj zaradi tega naš R ni padal še hitreje. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Vse lahko spremeni varianta omikron, a o njej zaenkrat še ni zanesljivih informacij. Spremljamo na polno. V Londonu že dominira, počasi prihajajo vse bolj kvalitetne informacije tudi iz tamkajšnjih bolnišnic. Na krivuljah pri nas se omikron skoraj zagotovo ne bo poznal vsaj do konca decembra. Bil sem prepričan, da tudi ne vsaj do sredine januarja, a po zadnjih informacijah o prisotnosti omikrona v Sloveniji že konec novembra zdaj nisem več. Vse bolj verjeten postaja scenarij omikron vala v Sloveniji januarja. Še vedno pa je možno, da bo to kasneje, spremljamo naprej.

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno) in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast mi ni bil jasen, razmišljal sem o nekem statističnem prekladanju podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem. Zdaj se nagibam k razlagi, da je to logična posledica podaljševanja ležalne dobe v bolnišnicah konec septembra.
Dnevno število smrti je proti sedanjemu vrhu postopoma naraščalo. Zdaj smo že čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1300.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ni narastel nad 30%, kar me je rahlo presenečalo. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Tudi višje starostne skupine imajo lepo padanje …
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja. Podobno 75-84 let. Verjetno je to popuščanje že pokrito s tretjimi odmerki, ki so že nekje na 40%.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

torek 14.12.2021

Povzetek dnevne analize:
epidemija je od 6.11. naprej počasi padala, potem hitreje, razlog v hitrem zmanjševanju bazena dovzetnih zaradi prekuževanja in dvigovanja učinkovitosti zaščite od cepljenja s 3. odmerki
trenutno pomaga PCT v šolah (upoštevan v projekcijah), ljudje se zdaj tudi sami bolj zaščitno obnašajo, nekaj dodaja vreme (to v teh dneh že dosega max učinek na R navzgor – modelirano)
v zadnjih dneh (še) ni predvidenega padanja R proti 0.70, slabše padanje pri mladih, razlog je lahko podcenjevanje veselega decembra z moje strani, lahko pa omikron, ki od danes uradno je pri nas
v igro prihaja varianta omikron iz Botswane/Južne Afrike, je že povsod, začetne informacije niso spodbudne, v Londonu že dominira
omikron imamo že tudi mi 1-2 tedna (o tem sem pisal v zadnjih analizah) – naše inštitucije gledajo stanje 2 tedna nazaj, v tem času bo omikron vala morda že skoraj konec?!(pikra šala)
omikron večjega vpliva na naše krivulje do konca leta zelo verjetno ne bo imel, morda tudi do sredine januarja ne, lahko pa je že po novem letu hud val
R=0.80, izgledi so do sredine decembra v območju okoli 0.80, potem rahlo upadanje proti 0.70 (to bomo še videli), trenutni razpolovni čas novih primerov je 22 dni
bazen ljudi brez vsakršne imunosti (naive) okoli 11%, a zaradi popuščanja zaščite po cepljenju trenutno vseeno dovzetnih (susceptible) okoli 21%
povprečje javljenih primerov zadnjih 7 dni je 1358 (vmesni max je bil 17.9. pri 1045), NIJZ s korekcijami za nazaj 1352
3/1 SLO/EU zelenih občin, 2/1/0 občin brez primerov že vsaj 1/2/4 tedne
dosežena splošna skupna (kakršnakoli) imunost (upoštevani prekuženost in precepljenost, ter njun presek): 89.2% (popuščanje zaščite ni zajeto)
P ali C (ali oboje) starostnih skupin: 60-64: 100%, 65-69: 100%, 70-74: 100%, 75-79: 100%, 80-84: 100%, 85-89: 100%; 90+: 100%
dejanska trenutna imunost starostnih skupin: 60-64: 88%, 65-69: 90%, 70-74: 92%, 75-79: 92%, 80-84: 92%, 85-89: 91%; 90+: 91%
število novih sprejemov v bolnišnice je čez vrh 109 13.11. in je nekje na nivoju 60/dan
smrti so imele prvi vrh 24.9. pri 6/dan, po 14.10. so nenavadno porasle, trenutno jih je v povprečju 14/dan, smo že čez vrh, ki je bil okoli 19/dan zadnji teden novembra.
napoved okužb (tekoče 7d povprečje): vmesni vrh 14.9. pri povprečno 1045 primerih dnevno, glavni vrh 3338 6.11.2021, zdaj padajo, t/2 22 dni, pod 1000 18.12.
napoved hospitaliziranih: vmesni vrh pri dobrih 400, potem glavni vrh 1168 23.11., <500 bo 26.12.
napoved ICU: v skladu z napovedjo res nismo šli preko 300, vrh je bil 25.11. pri 289 (ležalne dobe so se daljšale, odpusti so zaostajali), <200 21.12., <100 13.1.
napoved umrlih: 1300-1350 (1011 od tega jih je že bilo), po 4. valu skupno okoli 5750
napoved izpolnitve kriterijev za EU-rdečo: 2. januar 2021

Z epidemiološkim modelom v aplikaciji covidSLO modeliram novoletni porast R za 0.22 in potem še njegov padec nazaj za 0.17. Štartam s trenutno izmerjenim R, upoštevana trenutna povprečna učinkovitost cepiva (učinkovitost zaščite posameznega cepljenja s časom upada) je iz 50% v sredini novembra do decembra zaradi 3. odmerkov narasla na preko 60%.

Laboratoriji so tokrat zmogli več od povprečno 7-8000 PCR testov dnevno! Bravo!

Epidemija upada solidno hitro, R pada in je že od konca novembra v okolici 0.75-0.80. Zdaj vreme lahko prestavlja R malce gor/dol, mišljeno je bilo tudi do 0.85 a se (še) ni zgodilo. Približno tak nivo padanja epidemije se bo izgleda obdržal kar skoraj do sredine januarja, razen od Božiča do prvega tedna januarja, ko bo nekoliko višji .
Prekuževanje še vedno poteka hitro. R se bo zelo težko kaj bistveno dvignil. Prešli smo v najhladnejši del leta in več delcev z virusi ostaja v zraku, a nekega dodatnega velikega dviga R to ni prineslo. Nekaj ga nedvomno je, saj zaradi tega naš R ni padal še hitreje. Omeniti je treba še to, da se zaradi trenutne situacije tudi ljudje sami obnašajo nekoliko bolj zaščitno, to pa spet znižuje R.
Že od 14.11. sem pisal, da sem optimist, da bo R v kratkem 0.95. Očtno sem imel glede tega dober občutek:) Potem je R hitro padel. Vse bolj realna je bila možnost, da bi EU-rdečo fazo dosegli že za Božič. Zdaj se je to zamaknilo na novo leto. Najslabši možni scenarij bi bil, da se to potegne še za en dodaten teden, slabše od tega pa bi si upal garantirati, da ne bo.
Vse lahko spremeni varianta omikron, a o njej zaenkrat še ni zanesljivih informacij. Spremljamo na polno. V Londonu že dominira, počasi prihajajo vse bolj kvalitetne informacije tudi iz tamkajšnjih bolnišnic. Na krivuljah pri nas se omikron skoraj zagotovo ne bo poznal vsaj do konca decembra. Bil sem prepričan, da tudi ne vsaj do sredine januarja, a po zadnjih informacijah o prisotnosti omikrona v Sloveniji že konec novembra zdaj nisem več. Vse bolj verjeten postaja scenarij omikron vala v Sloveniji januarja. Še vedno pa je možno, da bo to kasneje, spremljamo naprej.

Vreme (rumena krivulja) je v povprečju delovala v smeri povečevanja R, saj smo prehajali v najhladnejši del leta, ko vse več delcev z virusi ostaja v zraku. “Sila” oziroma “forcing” povečevanja R naj bi povzročila največ zadrževanje R na nivoju okoli 0.77-0.82 do sredine decembra. A sredi decembra prihajajo novi vplivi, kot je veseli december (mogoče sem ga planiral prepozno) in pa omikron.

Vrh hospitalizacij je bil 23.11. pri 1168 hospitaliziranih. Pod 500 bo izgleda padlo nekje do novega leta.
Povprečno dnevno število umrlih je bilo po prvem vrhu pri 6.5/dan v zadnjem tednu septembra in v prvem tednu oktobra okoli 5/dan, potem pa v drugem tednu oktobra celo 3.5/dan. Nato je še pred pričetkom ponovne rasti sprejemov pričelo samo od sebe naraščati proti 9/dan. Vzrok za tak porast mi ni bil jasen, razmišljal sem o nekem statističnem prekladanju podatkov med NIJZ in MZ, ali pa morda za preventivno čuvanje ICU postelj (delež ICU je padal), ne vem. Zdaj se nagibam k razlagi, da je to logična posledica podaljševanja ležalne dobe v bolnišnicah konec septembra.
Dnevno število smrti je proti sedanjemu vrhu postopoma naraščalo. Zdaj smo že čez vrh, ki je bil pri povprečnem nivoju okoli 19/dan. Rizične skupine so zdaj res dobro imunizirane, popušča pa zaščita po cepljenju tistim prvim cepljenim v prvih letošnjih mesecih – teh je baje zato zdaj že kar nekaj v bolnišnicah, čeprav pogled okužb po starostnih skupinah pokaže, da recimo skupina 85+ ni nič kaj “podivjala”. Kar nekaj je tudi imunsko oslabljenih bolnikov.
Velikostni razred števila smrti med neimunimi v 4. valu je že dolgo vnaprej določen za 500-700 (morda podcenjeno za par 100?), a popuščanje zaščite in imunokompromitirani tu niso bili všteti. Zaščitenost od cepljenja je že popustila, in vsi se ne bodo takoj cepili s 3. odmerkom – zato bo večje, zdaj izgleda okoli 1300.

Med sprejetimi v ICU delež cepljenih ni narastel nad 30%, kar me je rahlo presenečalo. Zaradi poživitvenih odmerkov cepiva se naša trenutna povprečna učinkovitost zaščite od cepljenja že polagoma dviga.
Primer iz sredine novembra 2021: 30% delež cepljenih od 80% cepljene rizične populacije da proti 70% deležu necepljenih v ICU od 20% necepljene rizične populacije (80/30)/(20/70)=9.33x boljšo zaščito cepljenih od necepljenih pred ICU obravnavo. Oziroma našo trenutno 1-1/9.33=89% učinkovitost cepiva pred ICU obravnavo.

Naš trenutni povprečni faktor boljše zaščite cepljenega od necepljenega za pristanek v ICU/EIT/EIZ je sčasoma padal, in je konec oktobra znašal le okoli 7. Potem je naraščal, trenutno je okoli 10. Za posameznika je kmalu po cepljenju z 2. ali 3. odmerkom ta faktor še bistveno višji.
Pri tveganju za okužbo in hospitalizacijo se faktor v zadnjem času zaradi tretjih odmerkov povečuje.

Tudi višje starostne skupine imajo lepo padanje …
Skupina 85+ (zaenkrat) nima neke posebne rasti, ki bi jo lahko pripisali popuščanju zaščite od cepljenja. Podobno 75-84 let. Verjetno je to popuščanje že pokrito s tretjimi odmerki, ki so že nekje na 40%.

Na spodnjem diagramu celotnega poteka epidemije po starostnih skupinah je lepo vidno, kako je cepljenje v višjih starostnih skupinah preprečilo ponovitev lanske grozljive porazdelitve okužb, ki je imela za posledico veliko hospitalizacij in tudi smrti …

arhiv analiz: december 2021 – november 2021 – oktober 2021 – september 2021 – avgust 2021 – julij 2021 – junij 2021 – maj 2021 – april 2021 – marec 2021 – februar 2021 – januar 2021 – december 2020 – pred decembrom 2020